242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1369 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1369  siroheme synthase  100 
 
 		 155 aa  317  3e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1785  siroheme synthase  42.76 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000034128  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2526  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  43.38 
 
 		 142 aa  110  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.569901  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  34.23 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  34.93 
 
 		 306 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1276  precorrin-6x reductase  36.81 
 
 		 407 aa  100  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00118855  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  33.56 
 
 		 306 aa  98.2  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  32.43 
 
 		 626 aa  97.4  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  34.93 
 
 		 213 aa  95.5  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3166  precorrin-2 dehydrogenase  36.11 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.97 
 
 		 476 aa  92.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  29.33 
 
 		 213 aa  92.8  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  33.78 
 
 		 312 aa  92.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  32.06 
 
 		 225 aa  91.7  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  33.1 
 
 		 212 aa  91.7  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  26.21 
 
 		 468 aa  90.5  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1993  precorrin-2 dehydrogenase  36.11 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2142  precorrin-2 dehydrogenase  36.11 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0405  siroheme synthase  32.43 
 
 		 224 aa  89.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00161187  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  30.52 
 
 		 235 aa  89.4  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2148  precorrin-2 dehydrogenase  35.42 
 
 		 161 aa  89  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.97 
 
 		 472 aa  89  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12390  siroheme synthase, N-terminal domain protein  33.33 
 
 		 255 aa  88.2  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2173  precorrin-2 dehydrogenase  34.72 
 
 		 157 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1966  precorrin-2 dehydrogenase  34.72 
 
 		 157 aa  87.8  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0700016  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1986  precorrin-2 dehydrogenase  34.03 
 
 		 156 aa  87  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.347019  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  27.59 
 
 		 472 aa  87  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.59 
 
 		 472 aa  87  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  27.59 
 
 		 472 aa  87  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  30.07 
 
 		 280 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1945  precorrin-2 dehydrogenase  34.03 
 
 		 157 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.996395  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.66 
 
 		 473 aa  86.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  28.47 
 
 		 209 aa  85.9  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0405  siroheme synthase  37.5 
 
 		 224 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.38 
 
 		 487 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3282  siroheme synthase  31.5 
 
 		 224 aa  84.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.66 
 
 		 462 aa  85.1  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3861  precorrin-2 dehydrogenase  34.51 
 
 		 204 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.458104  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1483  precorrin-2 dehydrogenase  34.51 
 
 		 204 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2058  virulence protein VirC  28.77 
 
 		 313 aa  84.3  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.21 
 
 		 480 aa  84.3  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2289  precorrin-2 dehydrogenase  34.03 
 
 		 157 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1943  siroheme synthase-like  29.25 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  27.59 
 
 		 462 aa  83.2  0.000000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1150  precorrin-2 dehydrogenase  33.8 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.225032  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0710  siroheme synthase  31.76 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3311  hypothetical protein  27.52 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.17565  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.21 
 
 		 480 aa  82.8  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0537  siroheme synthase, N-terminal component  30.34 
 
 		 321 aa  81.6  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.38 
 
 		 528 aa  82  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7364  siroheme synthase  32.64 
 
 		 410 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0139888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11590  siroheme synthase, N-terminal domain protein  28.57 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1745  siroheme synthase  28.67 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  34.85 
 
 		 554 aa  81.3  0.000000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0580  siroheme synthase  31.78 
 
 		 226 aa  80.9  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4663  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.57 
 
 		 394 aa  81.3  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.607311  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2755  siroheme synthase  33.1 
 
 		 314 aa  81.3  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.600217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0345  siroheme synthase  29.66 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00442257  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2165  siroheme synthase  33.59 
 
 		 190 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.576163  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  29.66 
 
 		 473 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  29.66 
 
 		 473 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  28.97 
 
 		 472 aa  79.7  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  29.66 
 
 		 470 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.35 
 
 		 473 aa  79.3  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0204  precorrin-2 dehydrogenase  32.86 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1844  siroheme synthase  29.05 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204715  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  29.66 
 
 		 462 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  28.28 
 
 		 467 aa  77.8  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1123  siroheme synthase  31.01 
 
 		 230 aa  77.4  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.967334 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.66 
 
 		 464 aa  77.4  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.19 
 
 		 502 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3111  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  32.82 
 
 		 418 aa  77  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.65 
 
 		 778 aa  75.9  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0854  siroheme synthase  27.97 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.819849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0362  siroheme synthase  32.19 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1748  siroheme synthase  31.25 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0708  siroheme synthase  29.45 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.7 
 
 		 479 aa  73.9  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2374  precorrin-2 dehydrogenase  24.66 
 
 		 200 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  31.29 
 
 		 458 aa  72.8  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  29.79 
 
 		 465 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  29.79 
 
 		 465 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  27.59 
 
 		 489 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3356  siroheme synthase  27.08 
 
 		 212 aa  72  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0422337  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  27.59 
 
 		 464 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  27.59 
 
 		 464 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0213  siroheme synthase  33.58 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000389168  normal  0.0129038 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2188  precorrin-2 dehydrogenase  29.79 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  26.9 
 
 		 459 aa  71.2  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2321  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.67 
 
 		 405 aa  71.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0536  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.85 
 
 		 419 aa  71.2  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.865143  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06710  siroheme synthase Met8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05680)  31.43 
 
 		 242 aa  70.9  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  27.4 
 
 		 257 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  25.69 
 
 		 493 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  26.21 
 
 		 459 aa  70.5  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3431  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.89 
 
 		 426 aa  70.5  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.447049  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1551  precorrin-2 dehydrogenase  35.21 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.710428  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32840  siroheme synthase, N-terminal domain protein  32.52 
 
 		 490 aa  70.1  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.703694  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  27.59 
 
 		 464 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1589  precorrin-2 dehydrogenase  34.51 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000991009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>