More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0536 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0536  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
419 aa  798    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.865143  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7364  siroheme synthase  57.54 
 
 
410 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0139888  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2321  uroporphyrin-III C-methyltransferase  62.19 
 
 
405 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1323  uroporphyrin-III C-methyltransferase  60.67 
 
 
448 aa  408  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153793  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2561  uroporphyrin-III C-methyltransferase  60.57 
 
 
410 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.945162  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2600  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  60.57 
 
 
407 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.177036  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2221  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  57.96 
 
 
426 aa  397  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2074  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  56.71 
 
 
398 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376766  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2057  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  56.71 
 
 
398 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177628  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2120  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  56.71 
 
 
398 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0228819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4663  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.04 
 
 
394 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.607311  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3431  uroporphyrin-III C-methyltransferase  59.41 
 
 
426 aa  385  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.447049  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4047  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.7 
 
 
403 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12862  multi-functional enzyme siroheme synthase cysG: uroporphyrin-III C-methyltransferase + precorrin-2 oxidase + ferrochelatase  55.64 
 
 
405 aa  382  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000225219  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1703  uroporphyrin-III C-methyltransferase  58.87 
 
 
411 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2305  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.19 
 
 
402 aa  375  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2143  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.89 
 
 
413 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.32611  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5854  uroporphyrin-III C-methyltransferase  58.71 
 
 
405 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.148412  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22640  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  58.82 
 
 
414 aa  352  1e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3920  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.79 
 
 
419 aa  350  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.797973  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1734  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.46 
 
 
406 aa  329  4e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0333412  normal  0.124511 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3545  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.26 
 
 
417 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10020  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  49 
 
 
422 aa  314  1.9999999999999998e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0127568  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2812  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.12 
 
 
420 aa  303  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00743993 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3111  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  48.88 
 
 
418 aa  303  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1616  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  48.66 
 
 
475 aa  278  1e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512799  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1326  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.61 
 
 
421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0751578  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.34 
 
 
385 aa  266  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2248  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.77 
 
 
416 aa  259  9e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000210375  normal  0.280858 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17730  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  58.23 
 
 
329 aa  259  9e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0658  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.98 
 
 
447 aa  255  8e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.244252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32840  siroheme synthase, N-terminal domain protein  41.5 
 
 
490 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.703694  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  36.48 
 
 
493 aa  249  8e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  35.62 
 
 
457 aa  248  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  35.62 
 
 
457 aa  248  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  35.62 
 
 
457 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.62 
 
 
457 aa  248  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  35.62 
 
 
457 aa  248  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  35.62 
 
 
457 aa  248  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  35.62 
 
 
457 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  35.62 
 
 
457 aa  248  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  64.85 
 
 
553 aa  247  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.459561  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  35.4 
 
 
457 aa  246  8e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.35 
 
 
403 aa  244  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  decreased coverage  0.000494849 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  35.62 
 
 
457 aa  241  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  34.52 
 
 
462 aa  241  2e-62  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.39 
 
 
472 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  34.96 
 
 
457 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  35.18 
 
 
457 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  34.96 
 
 
459 aa  239  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  35.4 
 
 
489 aa  239  9e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  34.96 
 
 
457 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  34.73 
 
 
457 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1941  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.15 
 
 
478 aa  237  4e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2018  siroheme synthase  35.37 
 
 
476 aa  235  9e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.27 
 
 
473 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  34 
 
 
470 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.63 
 
 
464 aa  233  6e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2699  uroporphyrin-III C-methyltransferase  62.29 
 
 
550 aa  232  8.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2804  hitchhiker  0.000140912 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.94 
 
 
476 aa  231  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  33.55 
 
 
473 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  33.55 
 
 
473 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0984  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.79 
 
 
245 aa  231  2e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.084748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  37.31 
 
 
464 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6102  uroporphyrin-III C-methyltransferase  59.75 
 
 
570 aa  229  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229547  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5796  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.96 
 
 
271 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.991425  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0796  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  52.8 
 
 
276 aa  226  8e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  35.02 
 
 
459 aa  225  9e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  36.42 
 
 
464 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.81 
 
 
502 aa  225  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.15 
 
 
510 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.72 
 
 
504 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  36.73 
 
 
472 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.59 
 
 
512 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.73 
 
 
472 aa  224  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  36.5 
 
 
472 aa  223  6e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  34.36 
 
 
459 aa  223  7e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  46.69 
 
 
516 aa  223  7e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  51.88 
 
 
513 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0528  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  58.97 
 
 
508 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.216012 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.54 
 
 
511 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  34.29 
 
 
467 aa  220  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  36.2 
 
 
464 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.08 
 
 
480 aa  219  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  35.9 
 
 
462 aa  219  7e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.38 
 
 
491 aa  219  7e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1724  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.26 
 
 
250 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  52.54 
 
 
513 aa  217  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  36.62 
 
 
465 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1774  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.57 
 
 
426 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.254822  normal  0.025791 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  36.62 
 
 
465 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.47 
 
 
504 aa  215  9e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1233  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.84 
 
 
254 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323489  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.99 
 
 
258 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0319  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.88 
 
 
497 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.99 
 
 
259 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.45 
 
 
473 aa  212  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  45.68 
 
 
505 aa  211  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.73 
 
 
258 aa  211  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2131  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.9 
 
 
507 aa  210  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0860734  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>