More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3111 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2812  uroporphyrin-III C-methyltransferase  92.27 
 
 
420 aa  730    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00743993 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3111  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  100 
 
 
418 aa  822    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10020  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  69.35 
 
 
422 aa  505  9.999999999999999e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0127568  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1734  uroporphyrin-III C-methyltransferase  58.44 
 
 
406 aa  374  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0333412  normal  0.124511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7364  siroheme synthase  51.27 
 
 
410 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0139888  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1326  uroporphyrin-III C-methyltransferase  59.9 
 
 
421 aa  358  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0751578  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1616  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  58.99 
 
 
475 aa  352  5.9999999999999994e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512799  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2221  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  51.26 
 
 
426 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2561  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.39 
 
 
410 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.945162  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2321  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.52 
 
 
405 aa  324  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0658  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.88 
 
 
447 aa  325  1e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.244252 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2248  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.5 
 
 
416 aa  322  6e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000210375  normal  0.280858 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1323  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.96 
 
 
448 aa  319  7e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153793  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.61 
 
 
403 aa  307  3e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  decreased coverage  0.000494849 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3431  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.75 
 
 
426 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.447049  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32840  siroheme synthase, N-terminal domain protein  42.49 
 
 
490 aa  296  7e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.703694  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3920  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.24 
 
 
419 aa  293  5e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.797973  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0536  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.88 
 
 
419 aa  290  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.865143  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4663  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.37 
 
 
394 aa  287  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.607311  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1703  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.22 
 
 
411 aa  278  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2057  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.29 
 
 
398 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177628  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2074  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.29 
 
 
398 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376766  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2120  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.29 
 
 
398 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0228819 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1774  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.69 
 
 
426 aa  276  7e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.254822  normal  0.025791 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3545  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.39 
 
 
417 aa  271  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12862  multi-functional enzyme siroheme synthase cysG: uroporphyrin-III C-methyltransferase + precorrin-2 oxidase + ferrochelatase  45.73 
 
 
405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000225219  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2600  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.88 
 
 
407 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.177036  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2305  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45 
 
 
402 aa  268  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4047  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.23 
 
 
403 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5854  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.59 
 
 
405 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.148412  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22640  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  48.86 
 
 
414 aa  255  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  37.67 
 
 
457 aa  251  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  37.67 
 
 
457 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.67 
 
 
457 aa  250  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  37.67 
 
 
457 aa  250  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  37.67 
 
 
457 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  37.67 
 
 
457 aa  250  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  37.67 
 
 
457 aa  250  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  37.44 
 
 
457 aa  249  7e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  37.44 
 
 
457 aa  248  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  37.19 
 
 
457 aa  240  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  35.65 
 
 
457 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  35.65 
 
 
457 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  35.65 
 
 
457 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  35.65 
 
 
459 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  35.43 
 
 
457 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  34.68 
 
 
459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  34.52 
 
 
459 aa  233  7.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2143  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.01 
 
 
413 aa  231  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.32611  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0711  uroporphyrin-III C-methyltransferase  61.51 
 
 
261 aa  231  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.572038  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  34.87 
 
 
470 aa  229  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  34.64 
 
 
473 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  34.64 
 
 
473 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  34.11 
 
 
467 aa  222  8e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1304  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.88 
 
 
341 aa  219  7.999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013342 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1257  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  54.27 
 
 
344 aa  219  8.999999999999998e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.1 
 
 
491 aa  218  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00850  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.38 
 
 
340 aa  216  5e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.36 
 
 
385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.9 
 
 
504 aa  213  7e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1941  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.12 
 
 
478 aa  211  1e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2018  siroheme synthase  33.05 
 
 
476 aa  211  3e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  32.67 
 
 
462 aa  210  3e-53  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  32.67 
 
 
458 aa  209  7e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.77 
 
 
484 aa  209  7e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  34.51 
 
 
489 aa  209  9e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.33 
 
 
505 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0796  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  51.25 
 
 
276 aa  209  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1278  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.04 
 
 
504 aa  209  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0984  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.21 
 
 
245 aa  208  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.084748  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2603  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.71 
 
 
256 aa  206  8e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2200  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.55 
 
 
261 aa  205  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0396322  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  51.69 
 
 
513 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.7 
 
 
464 aa  204  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0319  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.44 
 
 
497 aa  204  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.53 
 
 
512 aa  203  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1724  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.12 
 
 
250 aa  203  6e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  35.1 
 
 
464 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3603  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.46 
 
 
455 aa  202  7e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525458  normal  0.155845 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  43.98 
 
 
516 aa  202  9e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.19 
 
 
258 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36 
 
 
482 aa  202  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.96 
 
 
497 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000345374  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5796  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.94 
 
 
271 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.991425  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0457  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.03 
 
 
249 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000204102  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3676  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.21 
 
 
272 aa  200  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  35.1 
 
 
464 aa  199  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.92 
 
 
258 aa  199  7e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17730  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  49.37 
 
 
329 aa  199  7e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1668  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.68 
 
 
271 aa  199  9e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.228653  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1371  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.42 
 
 
502 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34 
 
 
472 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2013  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.43 
 
 
283 aa  197  3e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  35.49 
 
 
464 aa  197  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.66 
 
 
513 aa  197  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1626  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.02 
 
 
531 aa  197  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  32.52 
 
 
472 aa  197  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  34.2 
 
 
468 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.21 
 
 
504 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1105  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.26 
 
 
250 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000034343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>