More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4663 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4663  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
394 aa  761    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.607311  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7364  siroheme synthase  55.05 
 
 
410 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0139888  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2221  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  57.07 
 
 
426 aa  385  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2321  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.38 
 
 
405 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1703  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.57 
 
 
411 aa  373  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3920  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.6 
 
 
419 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.797973  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0536  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.04 
 
 
419 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.865143  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2074  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  53.44 
 
 
398 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376766  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2120  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  53.44 
 
 
398 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0228819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2057  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  53.44 
 
 
398 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177628  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2561  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.53 
 
 
410 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.945162  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4047  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.81 
 
 
403 aa  355  5e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3545  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.9 
 
 
417 aa  350  3e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2600  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  54.42 
 
 
407 aa  350  4e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.177036  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2305  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.05 
 
 
402 aa  348  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1323  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.27 
 
 
448 aa  347  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153793  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3431  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.5 
 
 
426 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.447049  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12862  multi-functional enzyme siroheme synthase cysG: uroporphyrin-III C-methyltransferase + precorrin-2 oxidase + ferrochelatase  51.52 
 
 
405 aa  343  4e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000225219  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22640  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  54.68 
 
 
414 aa  330  3e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5854  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.69 
 
 
405 aa  322  9.000000000000001e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.148412  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2143  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.76 
 
 
413 aa  312  5.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.32611  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1734  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.75 
 
 
406 aa  288  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0333412  normal  0.124511 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3111  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.37 
 
 
418 aa  279  6e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10020  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.84 
 
 
422 aa  276  4e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0127568  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2812  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.87 
 
 
420 aa  275  9e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00743993 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1616  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.28 
 
 
475 aa  264  2e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512799  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32840  siroheme synthase, N-terminal domain protein  41.89 
 
 
490 aa  263  3e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.703694  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1326  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.97 
 
 
421 aa  260  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0751578  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.01 
 
 
385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17730  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  53.61 
 
 
329 aa  243  5e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2248  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.2 
 
 
416 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000210375  normal  0.280858 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0658  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.47 
 
 
447 aa  234  3e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.244252 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.46 
 
 
403 aa  227  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  decreased coverage  0.000494849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5796  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.93 
 
 
271 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.991425  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0796  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  51.82 
 
 
276 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1774  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.88 
 
 
426 aa  211  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.254822  normal  0.025791 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  32.21 
 
 
462 aa  210  4e-53  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  32.59 
 
 
459 aa  203  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  32.59 
 
 
457 aa  202  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  32.59 
 
 
457 aa  202  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  32.59 
 
 
457 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  32.37 
 
 
457 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6102  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.01 
 
 
570 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229547  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  34.8 
 
 
464 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.27 
 
 
491 aa  199  9e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  32.74 
 
 
468 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.01 
 
 
472 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.92 
 
 
504 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.16 
 
 
472 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  34.16 
 
 
472 aa  196  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  32.74 
 
 
493 aa  196  6e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.71 
 
 
476 aa  196  7e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  33.93 
 
 
472 aa  195  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  34.59 
 
 
462 aa  195  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  34.74 
 
 
464 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0489  uroporphyrinogen-III methylase  35.03 
 
 
417 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.07 
 
 
258 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  34.01 
 
 
472 aa  193  4e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1549  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.49 
 
 
258 aa  193  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3603  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.15 
 
 
455 aa  193  5e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525458  normal  0.155845 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.41 
 
 
464 aa  193  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1587  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.49 
 
 
258 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  32.67 
 
 
457 aa  192  7e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.07 
 
 
258 aa  192  7e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1349  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.49 
 
 
258 aa  192  8e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.758533  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0984  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.83 
 
 
245 aa  192  8e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.084748  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.06 
 
 
513 aa  192  9e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  32.06 
 
 
470 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.28 
 
 
464 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.12 
 
 
507 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02124  siroheme synthase  38.25 
 
 
401 aa  192  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1335  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.07 
 
 
258 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1308  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.07 
 
 
258 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1445  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.07 
 
 
258 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.51628  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  48.1 
 
 
513 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1175  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.01 
 
 
252 aa  191  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0224859 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.07 
 
 
258 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58633e-17 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.41 
 
 
463 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  33.92 
 
 
464 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.63 
 
 
463 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.76 
 
 
553 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.459561  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.48 
 
 
502 aa  190  4e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1941  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.92 
 
 
478 aa  190  5e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  32.59 
 
 
489 aa  189  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0581  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.02 
 
 
264 aa  189  8e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.41 
 
 
463 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1309  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.64 
 
 
258 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.49 
 
 
504 aa  188  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0528  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  53.81 
 
 
508 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.216012 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  43.64 
 
 
516 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  32.52 
 
 
473 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  32.52 
 
 
473 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.33 
 
 
508 aa  186  4e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1668  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.14 
 
 
271 aa  186  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.228653  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1257  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  51.04 
 
 
344 aa  186  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.8 
 
 
510 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.22 
 
 
511 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.64 
 
 
512 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3656  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.19 
 
 
470 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1023  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.57 
 
 
493 aa  183  6e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>