233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1230 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1230  siroheme synthase  100 
 
 
226 aa  455  1e-127  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000002162  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1461  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  51.4 
 
 
224 aa  229  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0979  siroheme synthase  43.41 
 
 
208 aa  153  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.678356  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1239  siroheme synthase  35.15 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1729  siroheme synthase  35.78 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1220  siroheme synthase  32.2 
 
 
238 aa  103  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.5 
 
 
528 aa  102  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2563  siroheme synthase  33.33 
 
 
206 aa  101  8e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.999316 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0522  hypothetical protein  33.16 
 
 
204 aa  100  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0965703  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  31.5 
 
 
554 aa  100  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  31.05 
 
 
468 aa  100  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3247  siroheme synthase  34.7 
 
 
218 aa  99  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2131  siroheme synthase  32.3 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1613  siroheme synthase  29.63 
 
 
215 aa  97.1  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00109576  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  34.27 
 
 
209 aa  96.7  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  28.05 
 
 
457 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  28.05 
 
 
457 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  35 
 
 
214 aa  95.1  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  27.6 
 
 
459 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  27.6 
 
 
457 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  27.15 
 
 
457 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  27.15 
 
 
457 aa  93.2  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  33.51 
 
 
462 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  27.15 
 
 
457 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  27.15 
 
 
457 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.839222 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  27.15 
 
 
457 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.15 
 
 
457 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  27.15 
 
 
457 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  27.15 
 
 
457 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  27.15 
 
 
457 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  27.15 
 
 
457 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  29.36 
 
 
213 aa  91.7  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.41 
 
 
502 aa  90.9  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  30.99 
 
 
458 aa  89  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.47 
 
 
487 aa  88.2  9e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.83 
 
 
476 aa  87.8  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  25.76 
 
 
472 aa  87.8  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  33.7 
 
 
306 aa  88.2  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.87 
 
 
472 aa  87.4  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  29.26 
 
 
457 aa  87  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  27.13 
 
 
473 aa  86.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  27.13 
 
 
473 aa  86.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  32.49 
 
 
280 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  29.51 
 
 
225 aa  85.9  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.73 
 
 
473 aa  85.9  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  31.12 
 
 
464 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  31.75 
 
 
465 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  31.75 
 
 
465 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0464  siroheme synthase  29.41 
 
 
195 aa  84.7  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142976  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  29.47 
 
 
489 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  31.25 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.39 
 
 
472 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0049  siroheme synthase  29.41 
 
 
193 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760194  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1101  siroheme synthase  28.12 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  30.39 
 
 
472 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  30.39 
 
 
472 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  29.94 
 
 
235 aa  82.8  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3356  siroheme synthase  29.73 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0422337  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  29.17 
 
 
462 aa  82.8  0.000000000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1587  siroheme synthase  25.64 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68882  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  32.07 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  28.57 
 
 
464 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1616  siroheme synthase  28.79 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.16 
 
 
480 aa  82  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0858  siroheme synthase  26.15 
 
 
201 aa  82  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1150  precorrin-2 dehydrogenase  35.56 
 
 
205 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.225032  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  26.4 
 
 
470 aa  81.6  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1755  siroheme synthase  37.75 
 
 
216 aa  81.3  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.146692  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5870  siroheme synthase  29.1 
 
 
218 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115348  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.57 
 
 
480 aa  80.1  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  28.57 
 
 
626 aa  80.1  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  28.11 
 
 
464 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  29.35 
 
 
493 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1088  siroheme synthase  25.51 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.604366  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  33.5 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.11 
 
 
464 aa  79.3  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2755  siroheme synthase  29.19 
 
 
314 aa  79.3  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.600217  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0405  siroheme synthase  31.82 
 
 
224 aa  79  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00161187  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1762  siroheme synthase  28.88 
 
 
303 aa  79  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.128247  normal  0.013009 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2886  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  30.48 
 
 
303 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360303  hitchhiker  0.00000078916 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1576  siroheme synthase  26.24 
 
 
303 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190124  hitchhiker  0.000000012919 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  24.34 
 
 
467 aa  78.2  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1669  siroheme synthase  32.16 
 
 
247 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0465114  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2876  siroheme synthase  26.07 
 
 
303 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1748  siroheme synthase  33.72 
 
 
229 aa  77  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2781  siroheme synthase  26.07 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0880434  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  23.23 
 
 
459 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2801  siroheme synthase  25.59 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0131295  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.59 
 
 
479 aa  76.3  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  23.86 
 
 
459 aa  75.9  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  31.82 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2018  siroheme synthase  29.67 
 
 
476 aa  75.9  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3047  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.81 
 
 
467 aa  75.9  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0114628  normal  0.960594 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12390  siroheme synthase, N-terminal domain protein  27.88 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  29.12 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1941  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.07 
 
 
478 aa  75.1  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1123  siroheme synthase  28.8 
 
 
230 aa  74.7  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.967334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2374  precorrin-2 dehydrogenase  30.18 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1671  siroheme synthase  28.83 
 
 
464 aa  75.1  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105367  normal  0.362016 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2188  precorrin-2 dehydrogenase  27.6 
 
 
203 aa  74.3  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>