190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2131 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2131  siroheme synthase  100 
 
 		 225 aa  433  1e-120  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3247  siroheme synthase  57.85 
 
 		 218 aa  214  5.9999999999999996e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1613  siroheme synthase  58.37 
 
 		 215 aa  203  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00109576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1220  siroheme synthase  49.18 
 
 		 238 aa  191  6e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1755  siroheme synthase  51.11 
 
 		 216 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.146692  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1239  siroheme synthase  35.1 
 
 		 208 aa  99.4  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1461  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  29.33 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2563  siroheme synthase  33.33 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.999316 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1230  siroheme synthase  32.3 
 
 		 226 aa  85.9  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000002162  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0979  siroheme synthase  32.11 
 
 		 208 aa  85.9  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.678356  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  27.6 
 
 		 626 aa  85.1  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  30.48 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  35.26 
 
 		 462 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  33.33 
 
 		 465 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35 
 
 		 502 aa  81.6  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  33.33 
 
 		 465 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  26.43 
 
 		 473 aa  80.1  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  29.55 
 
 		 459 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  26.43 
 
 		 473 aa  80.1  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  29.44 
 
 		 468 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.98 
 
 		 464 aa  79.3  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1729  siroheme synthase  34.16 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3617  precorrin-2 dehydrogenase  32.63 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370108 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  32.86 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  30.88 
 
 		 464 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32 
 
 		 482 aa  76.3  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.73 
 
 		 487 aa  76.3  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  30.85 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  25.66 
 
 		 470 aa  75.5  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.79 
 
 		 480 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  34.17 
 
 		 489 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0522  hypothetical protein  29.95 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0965703  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.49 
 
 		 472 aa  72.8  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.33 
 
 		 473 aa  72.8  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2058  virulence protein VirC  28.36 
 
 		 313 aa  72  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  29.47 
 
 		 464 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  29.03 
 
 		 464 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  31 
 
 		 225 aa  72  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  34.78 
 
 		 474 aa  71.6  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1101  siroheme synthase  26.34 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.88 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.72 
 
 		 463 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2755  siroheme synthase  27.62 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.600217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.56 
 
 		 463 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.32 
 
 		 480 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.56 
 
 		 463 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  30.56 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  29.79 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1587  siroheme synthase  25.85 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68882  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.46 
 
 		 476 aa  68.9  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  27.62 
 
 		 472 aa  68.6  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0858  siroheme synthase  24.88 
 
 		 201 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  29.51 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  27.63 
 
 		 457 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  27.93 
 
 		 462 aa  67.4  0.0000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.1 
 
 		 464 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  28.57 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  27.63 
 
 		 457 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  28.07 
 
 		 457 aa  66.6  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0049  siroheme synthase  25.24 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760194  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1088  siroheme synthase  24.88 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.604366  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  27.63 
 
 		 457 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.63 
 
 		 457 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  27.63 
 
 		 457 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3656  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.5 
 
 		 470 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3356  siroheme synthase  29.63 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0422337  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  27.63 
 
 		 457 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  27.19 
 
 		 457 aa  66.2  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  27.63 
 
 		 457 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  28.1 
 
 		 457 aa  66.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  27.63 
 
 		 457 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  26.29 
 
 		 554 aa  65.9  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01486  siroheme synthase  33.65 
 
 		 326 aa  65.9  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.51 
 
 		 528 aa  65.5  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0537  siroheme synthase, N-terminal component  26.82 
 
 		 321 aa  65.5  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  32.5 
 
 		 493 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  32.88 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  28.1 
 
 		 457 aa  65.1  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1941  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.58 
 
 		 478 aa  65.1  0.0000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  28.1 
 
 		 459 aa  65.1  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  29.74 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  27.62 
 
 		 457 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  30.16 
 
 		 472 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0464  siroheme synthase  25 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142976  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.16 
 
 		 472 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  30.16 
 
 		 472 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  28.1 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2018  siroheme synthase  31.58 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11590  siroheme synthase, N-terminal domain protein  29.67 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3861  precorrin-2 dehydrogenase  32.37 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.458104  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0405  siroheme synthase  34.62 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00161187  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2479  siroheme synthase  27.43 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105774  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0204  precorrin-2 dehydrogenase  29.56 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2023  precorrin-2 dehydrogenase  31.37 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  30.48 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1150  precorrin-2 dehydrogenase  36.31 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.225032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1483  precorrin-2 dehydrogenase  31.3 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2235  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.31 
 
 		 470 aa  61.2  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2642  precorrin-2 dehydrogenase  28.36 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2697  precorrin-2 dehydrogenase  28.36 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>