176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1239 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1239  siroheme synthase  100 
 
 		 208 aa  424  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0979  siroheme synthase  43.96 
 
 		 208 aa  180  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.678356  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1729  siroheme synthase  46.8 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2563  siroheme synthase  41.75 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.999316 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1461  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  40.98 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0522  hypothetical protein  39.79 
 
 		 204 aa  127  8.000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0965703  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1230  siroheme synthase  35.15 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000002162  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3247  siroheme synthase  34.83 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1220  siroheme synthase  32.39 
 
 		 238 aa  97.4  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1613  siroheme synthase  34.12 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00109576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2131  siroheme synthase  35.1 
 
 		 225 aa  88.6  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1755  siroheme synthase  33.33 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.146692  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1088  siroheme synthase  27.27 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.604366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0858  siroheme synthase  26.74 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.49 
 
 		 476 aa  75.5  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  34.44 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  30 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  31.88 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0710  siroheme synthase  31.37 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1710  siroheme synthase  32.97 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0722893 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1587  siroheme synthase  25.13 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68882  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1748  siroheme synthase  33.33 
 
 		 229 aa  72  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  26.54 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  30 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  30.81 
 
 		 468 aa  69.7  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.83 
 
 		 472 aa  69.3  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  29.12 
 
 		 306 aa  68.2  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  29.28 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  28.73 
 
 		 306 aa  67  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.39 
 
 		 473 aa  66.6  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1150  precorrin-2 dehydrogenase  31.22 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.225032  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  29.28 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3861  precorrin-2 dehydrogenase  30.11 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.458104  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.28 
 
 		 502 aa  65.5  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1483  precorrin-2 dehydrogenase  29.57 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  32.47 
 
 		 489 aa  64.7  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.87 
 
 		 480 aa  63.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  29.91 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.27 
 
 		 464 aa  63.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1369  siroheme synthase  32.87 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.57 
 
 		 480 aa  62  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  25.11 
 
 		 457 aa  62.4  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1101  siroheme synthase  24.87 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  26.54 
 
 		 457 aa  62  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1745  siroheme synthase  32.07 
 
 		 198 aa  62  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  25.11 
 
 		 457 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  25.11 
 
 		 457 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  25.11 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.11 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  25.11 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.07 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  25.11 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.63 
 
 		 487 aa  61.2  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  25.11 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1476  siroheme synthase  28.02 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.154904  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  25.11 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  27 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  28.34 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3617  precorrin-2 dehydrogenase  28.65 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370108 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  27.32 
 
 		 472 aa  60.1  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.06 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1896  siroheme synthase  36.84 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.105096 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1731  siroheme synthase  26.67 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.381088  normal  0.846654 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2188  precorrin-2 dehydrogenase  26.46 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  27.53 
 
 		 626 aa  59.3  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  26.5 
 
 		 459 aa  59.3  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1463  siroheme synthase  27.14 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438897  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.96 
 
 		 462 aa  58.9  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  27.47 
 
 		 312 aa  58.5  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  30.32 
 
 		 464 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1993  precorrin-2 dehydrogenase  26.25 
 
 		 157 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1311  precorrin-2 dehydrogenase  28.85 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1945  precorrin-2 dehydrogenase  25.62 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.996395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2142  precorrin-2 dehydrogenase  26.25 
 
 		 157 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26346  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1508  siroheme synthase  26.92 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.359282  normal  0.0117341 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1616  siroheme synthase  34.71 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1337  precorrin-2 dehydrogenase  30.65 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1310  precorrin-2 dehydrogenase  30.65 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1447  precorrin-2 dehydrogenase  30.65 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17371  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0345  siroheme synthase  29.05 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00442257  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2058  virulence protein VirC  26.78 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  30 
 
 		 465 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  24.31 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1519  precorrin-2 dehydrogenase  30.65 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.71349e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  29.47 
 
 		 465 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  27.72 
 
 		 467 aa  57  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  24.31 
 
 		 459 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1966  precorrin-2 dehydrogenase  25.62 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0700016  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  24.31 
 
 		 457 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2173  precorrin-2 dehydrogenase  25.62 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  29.95 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  25 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  26.82 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  23.85 
 
 		 457 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  26.46 
 
 		 457 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0478  siroheme synthase  24.73 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.598281  normal  0.875071 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1551  precorrin-2 dehydrogenase  30.65 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.710428  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06710  siroheme synthase Met8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05680)  29.55 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0213  siroheme synthase  26.34 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000389168  normal  0.0129038 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1775  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  30.49 
 
 		 473 aa  55.1  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0534697  normal  0.7368 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>