More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2120 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2074  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  100 
 
 
398 aa  774    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376766  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2120  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  100 
 
 
398 aa  774    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0228819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2057  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  100 
 
 
398 aa  774    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177628  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4047  uroporphyrin-III C-methyltransferase  82.66 
 
 
403 aa  630  1e-179  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2305  uroporphyrin-III C-methyltransferase  82.96 
 
 
402 aa  630  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12862  multi-functional enzyme siroheme synthase cysG: uroporphyrin-III C-methyltransferase + precorrin-2 oxidase + ferrochelatase  82.66 
 
 
405 aa  621  1e-177  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000225219  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1703  uroporphyrin-III C-methyltransferase  65.84 
 
 
411 aa  483  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2143  uroporphyrin-III C-methyltransferase  65.98 
 
 
413 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.32611  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5854  uroporphyrin-III C-methyltransferase  63.16 
 
 
405 aa  428  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.148412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7364  siroheme synthase  58.23 
 
 
410 aa  418  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0139888  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2321  uroporphyrin-III C-methyltransferase  58.93 
 
 
405 aa  406  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22640  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  64.07 
 
 
414 aa  402  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1323  uroporphyrin-III C-methyltransferase  60 
 
 
448 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153793  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2600  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  58.03 
 
 
407 aa  372  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.177036  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2561  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.29 
 
 
410 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.945162  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2221  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.58 
 
 
426 aa  366  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0536  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.71 
 
 
419 aa  360  2e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.865143  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3920  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.21 
 
 
419 aa  352  4e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.797973  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4663  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.44 
 
 
394 aa  351  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.607311  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3431  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.54 
 
 
426 aa  342  5.999999999999999e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.447049  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3545  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.99 
 
 
417 aa  332  8e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1734  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.19 
 
 
406 aa  290  3e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0333412  normal  0.124511 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1616  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.78 
 
 
475 aa  278  1e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512799  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10020  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.84 
 
 
422 aa  265  8.999999999999999e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0127568  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2812  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.55 
 
 
420 aa  265  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00743993 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3111  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.29 
 
 
418 aa  263  4.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1326  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.33 
 
 
421 aa  253  6e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0751578  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17730  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  53.19 
 
 
329 aa  236  4e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0796  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  54.47 
 
 
276 aa  236  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0658  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.48 
 
 
447 aa  235  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.244252 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.11 
 
 
403 aa  233  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  decreased coverage  0.000494849 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32840  siroheme synthase, N-terminal domain protein  37.53 
 
 
490 aa  229  6e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.703694  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2248  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.12 
 
 
416 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000210375  normal  0.280858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5796  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.04 
 
 
271 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.991425  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.44 
 
 
491 aa  223  4e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  59.57 
 
 
553 aa  218  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.459561  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.26 
 
 
385 aa  216  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0528  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.98 
 
 
508 aa  216  5e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.216012 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  33.78 
 
 
459 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  45.26 
 
 
516 aa  212  9e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  32.88 
 
 
457 aa  212  9e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  33.63 
 
 
459 aa  211  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  46.12 
 
 
505 aa  212  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.98 
 
 
504 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.84 
 
 
512 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.81 
 
 
505 aa  211  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  32.65 
 
 
457 aa  210  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  32.65 
 
 
457 aa  209  7e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.65 
 
 
457 aa  209  7e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  32.65 
 
 
457 aa  209  7e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  32.65 
 
 
457 aa  209  7e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  32.65 
 
 
457 aa  209  7e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00850  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.85 
 
 
340 aa  209  7e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  32.65 
 
 
457 aa  209  7e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  32.65 
 
 
457 aa  209  7e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  33.56 
 
 
468 aa  207  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.53 
 
 
504 aa  207  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  34.22 
 
 
481 aa  206  5e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6102  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.01 
 
 
570 aa  206  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229547  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2699  uroporphyrin-III C-methyltransferase  60.43 
 
 
550 aa  205  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2804  hitchhiker  0.000140912 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  49.14 
 
 
520 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  32.96 
 
 
493 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  32.88 
 
 
457 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.23 
 
 
519 aa  202  6e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  48.5 
 
 
513 aa  202  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.83 
 
 
503 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.4 
 
 
258 aa  200  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  32.65 
 
 
457 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.83 
 
 
503 aa  199  5e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1549  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.04 
 
 
258 aa  199  6e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  32.65 
 
 
459 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  32.65 
 
 
457 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1668  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.59 
 
 
271 aa  199  7e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.228653  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  32.65 
 
 
457 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1349  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.4 
 
 
258 aa  199  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.758533  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  33.11 
 
 
464 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.97 
 
 
503 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  32.43 
 
 
457 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1587  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.98 
 
 
258 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1744  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.06 
 
 
263 aa  199  9e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1724  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.4 
 
 
250 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  32.15 
 
 
467 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  30.8 
 
 
470 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.84 
 
 
513 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  32.27 
 
 
462 aa  198  2.0000000000000003e-49  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0984  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.78 
 
 
245 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.084748  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  32.66 
 
 
464 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1335  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.55 
 
 
258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1308  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.55 
 
 
258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1445  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.55 
 
 
258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.51628  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.55 
 
 
258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58633e-17 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  30.6 
 
 
473 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  30.6 
 
 
473 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.7 
 
 
258 aa  196  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.33 
 
 
464 aa  195  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.26 
 
 
512 aa  195  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1774  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.78 
 
 
426 aa  195  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.254822  normal  0.025791 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1148  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.55 
 
 
258 aa  195  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.660594  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.84 
 
 
479 aa  194  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.4 
 
 
511 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>