238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0141 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0141  porphyrin biosynthesis protein, putative  100 
 
 
150 aa  308  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2307  porphyrin biosynthesis protein, putative  73.47 
 
 
149 aa  229  9e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.187642  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0708  siroheme synthase  73.1 
 
 
153 aa  221  4e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1844  siroheme synthase  67.12 
 
 
149 aa  217  3.9999999999999997e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204715  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0042  porphyrin biosynthesis protein, putative  67.59 
 
 
149 aa  214  2.9999999999999998e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1943  siroheme synthase-like  60.69 
 
 
153 aa  185  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0049  porphyrin biosynthesis protein, putative  52.78 
 
 
155 aa  175  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.843521 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  38.93 
 
 
626 aa  99.8  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0710  siroheme synthase  35.66 
 
 
148 aa  95.5  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3379  siroheme synthase  34.69 
 
 
197 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3282  siroheme synthase  29.05 
 
 
224 aa  90.5  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  32.87 
 
 
214 aa  89  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  30.34 
 
 
213 aa  87.4  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2526  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  35.56 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.569901  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  32.64 
 
 
213 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5870  siroheme synthase  33.1 
 
 
218 aa  85.9  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115348  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  33.79 
 
 
493 aa  85.9  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.51 
 
 
528 aa  84.3  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1150  precorrin-2 dehydrogenase  34.53 
 
 
205 aa  84.3  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.225032  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  31.51 
 
 
554 aa  84.3  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12390  siroheme synthase, N-terminal domain protein  30.82 
 
 
255 aa  81.6  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.21 
 
 
502 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  30.2 
 
 
306 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  29.53 
 
 
306 aa  80.5  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2332  siroheme synthase  31.76 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.477134  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3356  siroheme synthase  29.32 
 
 
212 aa  79  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0422337  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1785  siroheme synthase  31.78 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000034128  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0345  siroheme synthase  27.52 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00442257  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  30.34 
 
 
489 aa  77.8  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  31.25 
 
 
235 aa  77.4  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  31.78 
 
 
312 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  28.17 
 
 
257 aa  77.4  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  28.38 
 
 
468 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  35.71 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.14 
 
 
487 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.19 
 
 
464 aa  75.9  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  32.81 
 
 
280 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0204  precorrin-2 dehydrogenase  26.76 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  29.53 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0580  siroheme synthase  29.37 
 
 
226 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2635  precorrin-2 dehydrogenase  31.79 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.917436  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3617  precorrin-2 dehydrogenase  32.39 
 
 
212 aa  74.7  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370108 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3989  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  31.97 
 
 
480 aa  74.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0569779  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  32.81 
 
 
462 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3066  siroheme synthase  26.06 
 
 
221 aa  74.3  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1123  siroheme synthase  31.2 
 
 
230 aa  73.9  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.967334 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4663  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30 
 
 
394 aa  73.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.607311  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3311  hypothetical protein  26.57 
 
 
226 aa  73.6  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.17565  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3861  precorrin-2 dehydrogenase  29.5 
 
 
204 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.458104  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0478  siroheme synthase  29.68 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.598281  normal  0.875071 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2374  precorrin-2 dehydrogenase  30.53 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0405  siroheme synthase  26.12 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00161187  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1483  precorrin-2 dehydrogenase  29.5 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2058  virulence protein VirC  31.85 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1476  siroheme synthase  28.38 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.154904  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10020  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  29.69 
 
 
422 aa  72.8  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0127568  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1980  precorrin-2 dehydrogenase  28.87 
 
 
194 aa  72  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00160437  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  29.05 
 
 
459 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.66 
 
 
472 aa  71.6  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0464  siroheme synthase  31.25 
 
 
195 aa  71.2  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142976  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2188  precorrin-2 dehydrogenase  30.53 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  32.03 
 
 
464 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7364  siroheme synthase  28.29 
 
 
410 aa  70.5  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0139888  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  29.66 
 
 
472 aa  70.5  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  29.05 
 
 
459 aa  70.5  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1276  precorrin-6x reductase  31.54 
 
 
407 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00118855  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1704  siroheme synthase  24.66 
 
 
152 aa  70.1  0.000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  31.72 
 
 
474 aa  69.7  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01486  siroheme synthase  29.01 
 
 
326 aa  69.7  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.73 
 
 
480 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6615  siroheme synthase  33.33 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.027684 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0049  siroheme synthase  31.25 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760194  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3236  siroheme synthase  31.69 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0304551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2289  precorrin-2 dehydrogenase  29.6 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0537  siroheme synthase, N-terminal component  32.35 
 
 
321 aa  68.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2300  siroheme synthase  31.72 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000117051  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  32.03 
 
 
464 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3231  precorrin-2 dehydrogenase  31.54 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000236198  normal  0.247587 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.73 
 
 
480 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  28.97 
 
 
462 aa  68.9  0.00000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.47 
 
 
462 aa  68.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3166  precorrin-2 dehydrogenase  29.6 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2561  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.8 
 
 
410 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.945162  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  27.54 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.47 
 
 
479 aa  69.3  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.38 
 
 
476 aa  68.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1986  precorrin-2 dehydrogenase  29.37 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.347019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2148  precorrin-2 dehydrogenase  28.8 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  26.35 
 
 
458 aa  68.2  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  31.78 
 
 
464 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0658  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.75 
 
 
447 aa  67.8  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.244252 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3656  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.91 
 
 
470 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1977  siroheme synthase CysG  24.62 
 
 
188 aa  67.4  0.00000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.769253  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.9 
 
 
473 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  26.9 
 
 
472 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2235  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.56 
 
 
470 aa  67.4  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.9 
 
 
472 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  26.9 
 
 
472 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1945  precorrin-2 dehydrogenase  26.43 
 
 
157 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.996395  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3090  siroheme synthase  31.08 
 
 
498 aa  67  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000482671  normal  0.0254521 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>