219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1704 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1704  siroheme synthase  100 
 
 		 152 aa  316  7.999999999999999e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0204  precorrin-2 dehydrogenase  39.29 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  37.09 
 
 		 280 aa  103  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  35.46 
 
 		 212 aa  98.6  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1945  precorrin-2 dehydrogenase  36.43 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.996395  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2148  precorrin-2 dehydrogenase  36.43 
 
 		 161 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1966  precorrin-2 dehydrogenase  35.71 
 
 		 157 aa  95.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0700016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2173  precorrin-2 dehydrogenase  35.71 
 
 		 157 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1993  precorrin-2 dehydrogenase  35.71 
 
 		 157 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2142  precorrin-2 dehydrogenase  35.71 
 
 		 157 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26346  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1123  siroheme synthase  36.13 
 
 		 230 aa  94.4  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.967334 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3166  precorrin-2 dehydrogenase  37.14 
 
 		 157 aa  94  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1745  siroheme synthase  32.21 
 
 		 198 aa  93.6  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2289  precorrin-2 dehydrogenase  36.5 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  32.43 
 
 		 209 aa  91.7  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1986  precorrin-2 dehydrogenase  35.71 
 
 		 156 aa  91.3  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.347019  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  38.56 
 
 		 626 aa  90.5  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  33.1 
 
 		 213 aa  89.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3231  precorrin-2 dehydrogenase  34.84 
 
 		 224 aa  86.3  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000236198  normal  0.247587 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1150  precorrin-2 dehydrogenase  33.81 
 
 		 205 aa  84.7  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.225032  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  32.67 
 
 		 554 aa  84.3  6e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3861  precorrin-2 dehydrogenase  33.81 
 
 		 204 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.458104  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.67 
 
 		 528 aa  83.6  8e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0405  siroheme synthase  30.41 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00161187  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0478  siroheme synthase  28.75 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.598281  normal  0.875071 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  27.03 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1483  precorrin-2 dehydrogenase  33.09 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3282  siroheme synthase  33.11 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  32.65 
 
 		 312 aa  82  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0405  siroheme synthase  32.89 
 
 		 224 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2374  precorrin-2 dehydrogenase  26.14 
 
 		 200 aa  80.5  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0710  siroheme synthase  35.71 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5870  siroheme synthase  31.61 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2755  siroheme synthase  29.87 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.600217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0464  siroheme synthase  32.26 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142976  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3066  siroheme synthase  28.47 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  34.01 
 
 		 306 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0537  siroheme synthase, N-terminal component  28 
 
 		 321 aa  78.2  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3356  siroheme synthase  30.07 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0422337  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.71 
 
 		 476 aa  77  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  31.72 
 
 		 213 aa  77  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  30.72 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.33 
 
 		 487 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1977  siroheme synthase CysG  32.37 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.769253  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  32.65 
 
 		 306 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0580  siroheme synthase  33.8 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0345  siroheme synthase  31.33 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00442257  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  30 
 
 		 489 aa  73.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3311  hypothetical protein  28.57 
 
 		 226 aa  73.9  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.17565  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0049  siroheme synthase  31.62 
 
 		 193 aa  73.9  0.0000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760194  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  29.37 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2188  precorrin-2 dehydrogenase  32.39 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2058  virulence protein VirC  29.73 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  28.29 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1748  siroheme synthase  31.45 
 
 		 229 aa  72  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.14 
 
 		 502 aa  71.6  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1943  siroheme synthase-like  30.82 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1589  precorrin-2 dehydrogenase  30.22 
 
 		 205 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000991009  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0141  porphyrin biosynthesis protein, putative  24.66 
 
 		 150 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1551  precorrin-2 dehydrogenase  30.22 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.710428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1351  precorrin-2 dehydrogenase  29.73 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00349577  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1785  siroheme synthase  27.46 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000034128  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3617  precorrin-2 dehydrogenase  30.99 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370108 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4780  siroheme synthase  25.93 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000000392652  hitchhiker  0.00414073 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11590  siroheme synthase, N-terminal domain protein  27.78 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30 
 
 		 473 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2023  precorrin-2 dehydrogenase  26 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3656  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.41 
 
 		 470 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12390  siroheme synthase, N-terminal domain protein  26.9 
 
 		 255 aa  68.2  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7364  siroheme synthase  32.39 
 
 		 410 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0139888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3090  siroheme synthase  27.86 
 
 		 498 aa  68.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000482671  normal  0.0254521 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  27.52 
 
 		 493 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  28.57 
 
 		 462 aa  67.8  0.00000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1337  precorrin-2 dehydrogenase  30.22 
 
 		 205 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1310  precorrin-2 dehydrogenase  30.22 
 
 		 205 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1311  precorrin-2 dehydrogenase  30.22 
 
 		 205 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1447  precorrin-2 dehydrogenase  30.22 
 
 		 205 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17371  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1519  precorrin-2 dehydrogenase  30.22 
 
 		 205 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.71349e-22 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1159  siroheme synthase  30.37 
 
 		 215 aa  67.4  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.403167  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3379  siroheme synthase  27.39 
 
 		 197 aa  67.4  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.14 
 
 		 472 aa  67.4  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  28.86 
 
 		 468 aa  67  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30 
 
 		 473 aa  67  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1980  precorrin-2 dehydrogenase  29.86 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00160437  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0298  siroheme synthase  24.84 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27017 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2635  precorrin-2 dehydrogenase  26.85 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.917436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0511  siroheme synthase  33.77 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  27.14 
 
 		 472 aa  65.1  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1369  siroheme synthase  30.34 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1941  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.66 
 
 		 478 aa  64.7  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.43 
 
 		 480 aa  64.7  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0708  siroheme synthase  26.24 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.14 
 
 		 480 aa  63.9  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2018  siroheme synthase  29.66 
 
 		 476 aa  63.9  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0362  siroheme synthase  36.17 
 
 		 249 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.2 
 
 		 482 aa  63.9  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2561  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.28 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.945162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10020  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  29.29 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0127568  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01486  siroheme synthase  27.74 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2307  porphyrin biosynthesis protein, putative  26.03 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.187642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>