More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2561 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2561  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
410 aa  785    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.945162  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7364  siroheme synthase  82.68 
 
 
410 aa  663    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0139888  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1323  uroporphyrin-III C-methyltransferase  73.22 
 
 
448 aa  530  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153793  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2221  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  66.92 
 
 
426 aa  511  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3431  uroporphyrin-III C-methyltransferase  65.84 
 
 
426 aa  478  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.447049  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2321  uroporphyrin-III C-methyltransferase  61.82 
 
 
405 aa  454  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0536  uroporphyrin-III C-methyltransferase  60.3 
 
 
419 aa  413  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.865143  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2057  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  56.46 
 
 
398 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177628  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2074  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  56.46 
 
 
398 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376766  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12862  multi-functional enzyme siroheme synthase cysG: uroporphyrin-III C-methyltransferase + precorrin-2 oxidase + ferrochelatase  58.48 
 
 
405 aa  414  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000225219  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2120  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  56.46 
 
 
398 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0228819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2305  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.54 
 
 
402 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4047  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.04 
 
 
403 aa  393  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5854  uroporphyrin-III C-methyltransferase  60.05 
 
 
405 aa  391  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.148412  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1703  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.86 
 
 
411 aa  390  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4663  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.33 
 
 
394 aa  388  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.607311  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3920  uroporphyrin-III C-methyltransferase  59.22 
 
 
419 aa  377  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.797973  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2812  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.57 
 
 
420 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00743993 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2600  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.99 
 
 
407 aa  374  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.177036  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2143  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.75 
 
 
413 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.32611  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22640  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  60.05 
 
 
414 aa  369  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3111  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  53.55 
 
 
418 aa  365  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1734  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.91 
 
 
406 aa  362  9e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0333412  normal  0.124511 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1616  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  56.83 
 
 
475 aa  355  6.999999999999999e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512799  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10020  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  52.57 
 
 
422 aa  354  2e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0127568  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3545  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.32 
 
 
417 aa  345  7e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1326  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.76 
 
 
421 aa  293  3e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0751578  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.53 
 
 
385 aa  288  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32840  siroheme synthase, N-terminal domain protein  42.47 
 
 
490 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.703694  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.86 
 
 
403 aa  281  1e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  decreased coverage  0.000494849 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0658  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.37 
 
 
447 aa  280  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.244252 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2248  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.53 
 
 
416 aa  273  5.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000210375  normal  0.280858 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1774  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.55 
 
 
426 aa  269  7e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.254822  normal  0.025791 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17730  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  56.9 
 
 
329 aa  252  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0796  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  54.47 
 
 
276 aa  241  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  53.97 
 
 
513 aa  238  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  46.86 
 
 
516 aa  235  9e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5796  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.36 
 
 
271 aa  235  9e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.991425  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.67 
 
 
504 aa  233  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  35.63 
 
 
493 aa  233  6e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6102  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.66 
 
 
570 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229547  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  45.71 
 
 
505 aa  228  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  34.45 
 
 
457 aa  227  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.78 
 
 
491 aa  227  3e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.58 
 
 
504 aa  226  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  52.77 
 
 
520 aa  226  5.0000000000000005e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0528  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  56.96 
 
 
508 aa  224  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.216012 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  32.82 
 
 
470 aa  224  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  33.92 
 
 
462 aa  224  3e-57  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00850  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.76 
 
 
340 aa  223  4e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  33.19 
 
 
457 aa  222  8e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1668  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.02 
 
 
271 aa  222  9e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.228653  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  59.09 
 
 
553 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.459561  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  35.7 
 
 
464 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  35.25 
 
 
464 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  34.9 
 
 
467 aa  220  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  35.46 
 
 
464 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3656  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.36 
 
 
470 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.03 
 
 
512 aa  219  5e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.24 
 
 
480 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.92 
 
 
259 aa  216  7e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.12 
 
 
472 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0319  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.96 
 
 
497 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  31.87 
 
 
458 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  33.33 
 
 
472 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2018  siroheme synthase  33.92 
 
 
476 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.46 
 
 
480 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1941  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.85 
 
 
478 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.12 
 
 
512 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1724  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.96 
 
 
250 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0581  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.44 
 
 
264 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  33.18 
 
 
459 aa  213  7e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.61 
 
 
510 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.03 
 
 
511 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  46.44 
 
 
513 aa  209  5e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.06 
 
 
476 aa  209  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0984  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.22 
 
 
245 aa  209  9e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.084748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.08 
 
 
258 aa  208  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2699  uroporphyrin-III C-methyltransferase  58.51 
 
 
550 aa  208  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2804  hitchhiker  0.000140912 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0896  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.79 
 
 
506 aa  209  1e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  35.28 
 
 
465 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1175  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.04 
 
 
252 aa  207  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0224859 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1682  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.51 
 
 
264 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.577733 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.53 
 
 
503 aa  206  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.79 
 
 
508 aa  206  5e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.68 
 
 
513 aa  205  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1626  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.42 
 
 
531 aa  205  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2200  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.15 
 
 
261 aa  205  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0396322  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.83 
 
 
258 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3286  uroporphyrinogen III synthase/methyltransferase  46.86 
 
 
515 aa  204  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3676  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.31 
 
 
272 aa  204  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.27 
 
 
472 aa  204  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.38 
 
 
473 aa  204  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5880  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.16 
 
 
492 aa  203  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.204086  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1233  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.68 
 
 
254 aa  203  4e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323489  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0489  uroporphyrinogen-III methylase  35.8 
 
 
417 aa  203  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1290  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.25 
 
 
258 aa  203  5e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.19 
 
 
505 aa  203  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.38 
 
 
511 aa  203  6e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1104  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.28 
 
 
275 aa  203  6e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217718  normal  0.455501 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>