56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4799 on replicon NC_009670
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009670  Oant_4799  recombinase  100 
 
 		 564 aa  1164    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284934  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  33.97 
 
 		 565 aa  203  8e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  33.33 
 
 		 549 aa  177  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  31.23 
 
 		 576 aa  174  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  46.32 
 
 		 562 aa  166  8e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  29.56 
 
 		 601 aa  160  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  30.51 
 
 		 597 aa  160  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  29.56 
 
 		 578 aa  160  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  30.83 
 
 		 569 aa  158  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  30.73 
 
 		 552 aa  157  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  31.27 
 
 		 578 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  31.58 
 
 		 551 aa  154  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  32.05 
 
 		 537 aa  153  8e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  36.06 
 
 		 558 aa  151  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  31.28 
 
 		 549 aa  151  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  32.7 
 
 		 662 aa  151  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  29.32 
 
 		 584 aa  150  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 564 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  33.72 
 
 		 564 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  29.76 
 
 		 542 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  45.38 
 
 		 336 aa  117  6e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  29.73 
 
 		 542 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  27.69 
 
 		 541 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37130  Recombinase  30.6 
 
 		 520 aa  107  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2219  recombinase  26.4 
 
 		 558 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338837  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0834  recombinase  48.39 
 
 		 277 aa  96.7  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.315619  hitchhiker  0.000339857 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  36.77 
 
 		 540 aa  93.6  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  32.24 
 
 		 532 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  36.36 
 
 		 539 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  27.71 
 
 		 546 aa  79  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  31.44 
 
 		 738 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1541  recombinase  31.44 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.343961  normal  0.0432678 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  39.56 
 
 		 626 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  26.98 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  21.13 
 
 		 515 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  23.28 
 
 		 522 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  24.56 
 
 		 535 aa  57  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  22.93 
 
 		 542 aa  55.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  22.93 
 
 		 542 aa  55.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  24.15 
 
 		 498 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  20.96 
 
 		 542 aa  55.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3623  recombinase  24.19 
 
 		 515 aa  53.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  23.28 
 
 		 515 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0980  Resolvase domain  19.66 
 
 		 707 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0578275 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  20.69 
 
 		 552 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  31.06 
 
 		 484 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  27.17 
 
 		 485 aa  49.3  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  31.06 
 
 		 484 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  28.64 
 
 		 540 aa  48.1  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  20.87 
 
 		 494 aa  46.2  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3109  Recombinase  35.16 
 
 		 497 aa  45.8  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  25.23 
 
 		 506 aa  45.8  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1466  putative recombinase  30.48 
 
 		 568 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  27.66 
 
 		 522 aa  45.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3094  recombinase  28.97 
 
 		 386 aa  44.7  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0612  recombinase  28.47 
 
 		 656 aa  44.3  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>