More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1522 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
568 aa  1169    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1580  hypothetical protein  88.28 
 
 
303 aa  532  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  43.89 
 
 
545 aa  419  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  45.31 
 
 
522 aa  408  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  50.71 
 
 
441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  47.26 
 
 
447 aa  393  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  47.87 
 
 
445 aa  393  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  54.52 
 
 
445 aa  390  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  54.52 
 
 
445 aa  386  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  54.83 
 
 
443 aa  384  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  48.01 
 
 
445 aa  385  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  54.62 
 
 
549 aa  380  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  45.98 
 
 
441 aa  376  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  54.19 
 
 
550 aa  374  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  41.47 
 
 
506 aa  373  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  50.56 
 
 
441 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  50 
 
 
441 aa  362  7.0000000000000005e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  44.12 
 
 
462 aa  360  4e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  50.84 
 
 
462 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  50.28 
 
 
528 aa  353  2.9999999999999997e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  52.5 
 
 
460 aa  353  5e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  50 
 
 
528 aa  352  1e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  50.39 
 
 
532 aa  350  4e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  42.82 
 
 
449 aa  348  2e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  51.5 
 
 
343 aa  345  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  41.69 
 
 
459 aa  342  1e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  48.73 
 
 
527 aa  342  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  57.14 
 
 
474 aa  332  8e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  48.63 
 
 
525 aa  331  3e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  48.87 
 
 
511 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  48.87 
 
 
525 aa  313  3.9999999999999997e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  48.31 
 
 
525 aa  310  4e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  44.51 
 
 
537 aa  295  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  33.63 
 
 
489 aa  293  4e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  33.33 
 
 
500 aa  293  6e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  44.23 
 
 
534 aa  292  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  43.94 
 
 
534 aa  291  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  43.94 
 
 
534 aa  291  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  44.23 
 
 
534 aa  291  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  44.23 
 
 
534 aa  290  4e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  43.38 
 
 
534 aa  289  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  43.94 
 
 
537 aa  285  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  42.98 
 
 
412 aa  280  5e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  45.39 
 
 
299 aa  272  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1125  recombinase  39.46 
 
 
322 aa  208  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0324535  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  32.89 
 
 
544 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  32.95 
 
 
546 aa  162  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  31.12 
 
 
665 aa  160  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  31.34 
 
 
613 aa  157  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  29.47 
 
 
515 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  27.03 
 
 
534 aa  143  8e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  30.58 
 
 
475 aa  138  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  30.52 
 
 
542 aa  137  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  30.52 
 
 
542 aa  137  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  30.52 
 
 
542 aa  137  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  30.94 
 
 
515 aa  137  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  28.61 
 
 
500 aa  137  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  28.16 
 
 
462 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  31.25 
 
 
509 aa  133  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  34.12 
 
 
484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  34.12 
 
 
484 aa  131  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0913  resolvase domain-containing protein  24.82 
 
 
554 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.955385  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  32.08 
 
 
546 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  25 
 
 
552 aa  126  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  32.26 
 
 
485 aa  124  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  28.42 
 
 
522 aa  123  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  29.6 
 
 
415 aa  123  8e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  28.98 
 
 
272 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  28.31 
 
 
558 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  28.96 
 
 
474 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1608  putative resolvase  35.37 
 
 
502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  30.12 
 
 
465 aa  107  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  28.42 
 
 
521 aa  107  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  25.9 
 
 
421 aa  102  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  30.45 
 
 
500 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  26.35 
 
 
519 aa  100  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  30.04 
 
 
500 aa  99.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2997  resolvase domain-containing protein  34.01 
 
 
444 aa  99  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  29.55 
 
 
522 aa  98.6  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  26.93 
 
 
506 aa  98.2  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  28.73 
 
 
547 aa  97.1  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  29.63 
 
 
553 aa  96.3  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  27.15 
 
 
485 aa  96.3  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  24 
 
 
494 aa  96.7  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  33.74 
 
 
513 aa  95.5  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  29.21 
 
 
522 aa  95.5  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  33.53 
 
 
231 aa  93.6  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  32.11 
 
 
281 aa  93.6  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  23.24 
 
 
482 aa  92.8  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1857  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  27.8 
 
 
488 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830217  decreased coverage  0.0036727 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  27.19 
 
 
534 aa  93.2  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  26.33 
 
 
531 aa  92.8  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  33.54 
 
 
196 aa  92.8  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  39.02 
 
 
203 aa  92  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  35.71 
 
 
194 aa  91.7  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  27.6 
 
 
522 aa  91.3  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  35.95 
 
 
203 aa  90.5  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  26.42 
 
 
520 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  39.64 
 
 
214 aa  89.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  36.76 
 
 
188 aa  89.7  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>