More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1616 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  67.61 
 
 		 562 aa  774    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  100 
 
 		 565 aa  1154    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  62.02 
 
 		 549 aa  639    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  52.39 
 
 		 578 aa  587  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  55.15 
 
 		 601 aa  576  1.0000000000000001e-163  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  52.04 
 
 		 549 aa  558  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  51.06 
 
 		 552 aa  546  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  50.53 
 
 		 551 aa  542  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  52.67 
 
 		 597 aa  543  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  51.25 
 
 		 569 aa  538  1e-151  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  49.91 
 
 		 578 aa  533  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  51.74 
 
 		 576 aa  531  1e-149  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  50.09 
 
 		 662 aa  530  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  51.05 
 
 		 564 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  46.15 
 
 		 584 aa  501  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  48.24 
 
 		 558 aa  494  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  61.77 
 
 		 336 aa  393  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  40 
 
 		 537 aa  378  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1759  Resolvase domain  77.97 
 
 		 251 aa  359  7e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.621745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  37.94 
 
 		 542 aa  329  9e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  36.41 
 
 		 541 aa  326  8.000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  37.57 
 
 		 542 aa  320  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2219  recombinase  37.7 
 
 		 558 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338837  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0834  recombinase  62.01 
 
 		 277 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.315619  hitchhiker  0.000339857 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  35.8 
 
 		 539 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  36.05 
 
 		 540 aa  301  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  37.7 
 
 		 546 aa  292  9e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37130  Recombinase  35.49 
 
 		 520 aa  256  6e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  33.01 
 
 		 564 aa  247  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  32.1 
 
 		 532 aa  216  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4799  recombinase  33.97 
 
 		 564 aa  203  8e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284934  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  29.09 
 
 		 506 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  31.29 
 
 		 626 aa  169  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  26.74 
 
 		 738 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  23.52 
 
 		 494 aa  124  5e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  23.38 
 
 		 485 aa  120  9e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  26.07 
 
 		 515 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  28.28 
 
 		 487 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  24.86 
 
 		 522 aa  115  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  24.75 
 
 		 542 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  24.75 
 
 		 542 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  23.27 
 
 		 479 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  24.55 
 
 		 542 aa  113  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  25.77 
 
 		 515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  26.19 
 
 		 546 aa  111  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  26.29 
 
 		 496 aa  109  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  25.67 
 
 		 517 aa  109  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  25.74 
 
 		 510 aa  107  9e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3843  Resolvase domain  26.76 
 
 		 707 aa  106  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  23.67 
 
 		 462 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  26.35 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  28.11 
 
 		 482 aa  105  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0980  Resolvase domain  23.89 
 
 		 707 aa  105  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0578275 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  25.75 
 
 		 519 aa  103  8e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5403  Resolvase domain  30.28 
 
 		 279 aa  102  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  24.18 
 
 		 517 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  25.43 
 
 		 542 aa  101  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  25.06 
 
 		 554 aa  101  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  27.59 
 
 		 526 aa  101  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  25.27 
 
 		 547 aa  100  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  26.07 
 
 		 539 aa  100  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  27.74 
 
 		 488 aa  100  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  26.01 
 
 		 606 aa  99.4  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  25.14 
 
 		 484 aa  99  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  24.03 
 
 		 548 aa  99  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  23.27 
 
 		 553 aa  99  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  26.09 
 
 		 552 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  26.01 
 
 		 606 aa  99.4  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  27.02 
 
 		 500 aa  97.8  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  25.33 
 
 		 511 aa  97.8  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  26.29 
 
 		 429 aa  97.4  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  24.73 
 
 		 521 aa  97.4  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  24.86 
 
 		 484 aa  97.4  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  22.37 
 
 		 552 aa  96.3  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  23.96 
 
 		 579 aa  95.9  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  25.27 
 
 		 522 aa  95.9  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  28.01 
 
 		 442 aa  95.9  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  22.33 
 
 		 521 aa  95.5  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  23.54 
 
 		 541 aa  94.7  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4059  Resolvase domain  26.24 
 
 		 862 aa  94.7  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932376  normal  0.13959 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  24.52 
 
 		 520 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  27.18 
 
 		 540 aa  94.4  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  27.04 
 
 		 465 aa  94  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1541  recombinase  29.39 
 
 		 414 aa  93.2  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.343961  normal  0.0432678 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  25.05 
 
 		 565 aa  93.2  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  25.15 
 
 		 515 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  24.47 
 
 		 522 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  24.41 
 
 		 537 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  26.37 
 
 		 485 aa  92  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  26.57 
 
 		 561 aa  90.9  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  24.12 
 
 		 555 aa  90.5  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  26.65 
 
 		 551 aa  90.5  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  26.4 
 
 		 516 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  26.25 
 
 		 515 aa  89.7  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3623  recombinase  24.78 
 
 		 515 aa  90.1  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  22.78 
 
 		 547 aa  89  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  26.4 
 
 		 516 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  26.04 
 
 		 546 aa  89  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  24.68 
 
 		 537 aa  89.4  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  26.37 
 
 		 430 aa  88.6  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>