297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4107 on replicon NC_007489
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  100 
 
 		 564 aa  1144    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  34.76 
 
 		 552 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  35.73 
 
 		 569 aa  275  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  34.21 
 
 		 549 aa  275  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  34.2 
 
 		 551 aa  274  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  34.96 
 
 		 558 aa  268  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  33.65 
 
 		 578 aa  267  2.9999999999999995e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  33.64 
 
 		 562 aa  267  2.9999999999999995e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  33.21 
 
 		 601 aa  266  8.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  32.96 
 
 		 662 aa  265  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  33.21 
 
 		 578 aa  266  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  32.77 
 
 		 584 aa  265  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  33.4 
 
 		 597 aa  264  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  32.76 
 
 		 549 aa  261  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  33.4 
 
 		 576 aa  258  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  33.97 
 
 		 537 aa  256  5e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  33.01 
 
 		 565 aa  247  3e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  31.31 
 
 		 541 aa  242  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  34.8 
 
 		 564 aa  218  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  32.64 
 
 		 542 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  32.13 
 
 		 539 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  31.05 
 
 		 542 aa  207  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2219  recombinase  32.65 
 
 		 558 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338837  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  33.48 
 
 		 546 aa  201  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  30.04 
 
 		 540 aa  200  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37130  Recombinase  31.1 
 
 		 520 aa  170  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  37.41 
 
 		 336 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  29.68 
 
 		 532 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  29.71 
 
 		 626 aa  150  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1759  Resolvase domain  38.74 
 
 		 251 aa  139  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.621745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4799  recombinase  33.72 
 
 		 564 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284934  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  26 
 
 		 494 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0834  recombinase  38.24 
 
 		 277 aa  135  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.315619  hitchhiker  0.000339857 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  30.33 
 
 		 738 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0980  Resolvase domain  26.61 
 
 		 707 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0578275 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  22.52 
 
 		 542 aa  113  8.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  22.31 
 
 		 542 aa  113  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  22.31 
 
 		 542 aa  113  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  28.12 
 
 		 511 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 415 aa  110  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1541  recombinase  34.13 
 
 		 414 aa  110  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.343961  normal  0.0432678 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  23.16 
 
 		 522 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  26.61 
 
 		 517 aa  108  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  22.9 
 
 		 506 aa  107  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  26.24 
 
 		 548 aa  105  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4059  Resolvase domain  28.48 
 
 		 862 aa  103  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932376  normal  0.13959 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  25.46 
 
 		 510 aa  101  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  26.26 
 
 		 554 aa  98.6  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  26.17 
 
 		 542 aa  97.8  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  23.49 
 
 		 462 aa  97.4  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  26.39 
 
 		 539 aa  95.1  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  23.24 
 
 		 485 aa  94.7  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  24.3 
 
 		 521 aa  94.4  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  24.88 
 
 		 482 aa  94  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5403  Resolvase domain  28.67 
 
 		 279 aa  93.6  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  24.08 
 
 		 546 aa  93.6  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  26.69 
 
 		 518 aa  93.2  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  21.91 
 
 		 535 aa  92.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  22.38 
 
 		 496 aa  92  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  22.32 
 
 		 500 aa  92  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  22.08 
 
 		 515 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  24.86 
 
 		 504 aa  90.5  8e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  23.33 
 
 		 606 aa  89.7  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 537 aa  89.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  23.33 
 
 		 606 aa  89.7  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  24.13 
 
 		 429 aa  88.6  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  27.17 
 
 		 535 aa  88.6  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  26.97 
 
 		 522 aa  88.6  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  27.63 
 
 		 521 aa  87.8  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3285  Recombinase  24.23 
 
 		 554 aa  87.8  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  27.96 
 
 		 641 aa  87.4  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  26.87 
 
 		 553 aa  87.4  7e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  24.47 
 
 		 522 aa  87  8e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  27.33 
 
 		 523 aa  87  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  27.3 
 
 		 520 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  23.82 
 
 		 505 aa  86.3  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  27.95 
 
 		 547 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  26.74 
 
 		 552 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  29.92 
 
 		 540 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  26.97 
 
 		 522 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  26.59 
 
 		 523 aa  85.9  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  24.47 
 
 		 534 aa  84.7  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  21.84 
 
 		 558 aa  84.7  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  23.13 
 
 		 550 aa  83.6  0.000000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  26.91 
 
 		 523 aa  83.6  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  23.86 
 
 		 498 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  23.93 
 
 		 523 aa  82.8  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5207  Resolvase domain protein  26.53 
 
 		 598 aa  82.4  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  24.68 
 
 		 563 aa  82.4  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  25.08 
 
 		 519 aa  82  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  21.59 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  22.2 
 
 		 522 aa  81.6  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  21.69 
 
 		 539 aa  80.9  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  25.8 
 
 		 465 aa  80.5  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  26.34 
 
 		 515 aa  80.1  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  23.17 
 
 		 524 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  24.53 
 
 		 586 aa  79  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  23.91 
 
 		 551 aa  79.3  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  26.97 
 
 		 462 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  24.1 
 
 		 528 aa  78.2  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>