More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1609 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  63.92 
 
 
520 aa  726    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  65.77 
 
 
519 aa  744    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  100 
 
 
522 aa  1082    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  94.06 
 
 
522 aa  1024    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  64.3 
 
 
521 aa  729    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  56.26 
 
 
519 aa  633  1e-180  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  42.86 
 
 
553 aa  447  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  44.34 
 
 
526 aa  431  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  42.62 
 
 
543 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  39.26 
 
 
523 aa  320  3.9999999999999996e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  39.26 
 
 
523 aa  319  7e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  44.9 
 
 
442 aa  313  6.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  35.98 
 
 
523 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  36.8 
 
 
518 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  35.34 
 
 
523 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  36.36 
 
 
535 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  36.78 
 
 
522 aa  303  5.000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  46.33 
 
 
429 aa  297  3e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  35.56 
 
 
526 aa  295  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  36.06 
 
 
522 aa  289  7e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  35.5 
 
 
606 aa  278  1e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  35.5 
 
 
606 aa  278  1e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  38.68 
 
 
534 aa  276  7e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  44.57 
 
 
430 aa  273  7e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  34.2 
 
 
552 aa  266  8.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  33.65 
 
 
539 aa  265  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  33.4 
 
 
506 aa  256  6e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  39.47 
 
 
431 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  37.79 
 
 
511 aa  203  7e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  36.05 
 
 
547 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0420  resolvase domain-containing protein  42.67 
 
 
342 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000164103  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1669  DNA recombinase, putative  46.06 
 
 
165 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  27.89 
 
 
515 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  31.53 
 
 
479 aa  155  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  25.54 
 
 
613 aa  150  6e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  30.25 
 
 
498 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  29.8 
 
 
558 aa  145  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0494  resolvase, N-terminal domain protein  33.7 
 
 
321 aa  143  9e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.177718 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  26.52 
 
 
506 aa  140  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  25.35 
 
 
487 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  28.78 
 
 
542 aa  137  7.000000000000001e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  28.78 
 
 
542 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  28.78 
 
 
542 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  29.7 
 
 
415 aa  134  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  28.61 
 
 
522 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  26.8 
 
 
521 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  27.69 
 
 
496 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  29.26 
 
 
488 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  29.17 
 
 
485 aa  127  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  23.78 
 
 
665 aa  127  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  29.84 
 
 
535 aa  124  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  25.26 
 
 
475 aa  124  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  24.2 
 
 
537 aa  124  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  26.4 
 
 
539 aa  124  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  23.43 
 
 
509 aa  123  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  29.37 
 
 
517 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  25.97 
 
 
528 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  29.12 
 
 
489 aa  119  9.999999999999999e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  25.17 
 
 
445 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  26.42 
 
 
441 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  31.42 
 
 
462 aa  118  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  25.58 
 
 
528 aa  117  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  26.67 
 
 
462 aa  117  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  26 
 
 
441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  26.54 
 
 
527 aa  114  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  30.54 
 
 
462 aa  113  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  25.9 
 
 
447 aa  113  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  24.64 
 
 
445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  27.51 
 
 
500 aa  112  2.0000000000000002e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  24.84 
 
 
546 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  24.41 
 
 
445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  26.25 
 
 
546 aa  111  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  25.14 
 
 
541 aa  111  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  24.91 
 
 
541 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  24.62 
 
 
525 aa  111  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  26.22 
 
 
525 aa  110  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  26.45 
 
 
482 aa  110  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  29.39 
 
 
343 aa  110  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  24.27 
 
 
460 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  27.19 
 
 
524 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  26.85 
 
 
515 aa  109  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  24.89 
 
 
504 aa  108  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  25.2 
 
 
484 aa  107  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  23.11 
 
 
475 aa  107  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  29.87 
 
 
459 aa  106  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  27.62 
 
 
537 aa  106  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  24.85 
 
 
484 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  27.6 
 
 
272 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  31.91 
 
 
295 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  25.1 
 
 
485 aa  103  7e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  31.06 
 
 
281 aa  103  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  29.27 
 
 
441 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  26.92 
 
 
580 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  27.18 
 
 
510 aa  101  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  27.69 
 
 
534 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1525  Recombinase  24.35 
 
 
299 aa  100  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000398733  hitchhiker  0.000531049 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  28 
 
 
534 aa  100  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  26.76 
 
 
537 aa  100  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  27.38 
 
 
534 aa  99.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  29.57 
 
 
283 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>