More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3623 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3623  recombinase  100 
 
 
515 aa  1060    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  96.89 
 
 
515 aa  1009    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  61.15 
 
 
517 aa  625  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  42.94 
 
 
504 aa  384  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  39.42 
 
 
515 aa  335  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  38.58 
 
 
516 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  38.39 
 
 
516 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3310  recombinase family  32.23 
 
 
501 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.19852  hitchhiker  0.000000416205 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1501  hypothetical protein  30.26 
 
 
512 aa  142  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.420622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1691  resolvase domain-containing protein  27.58 
 
 
491 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0333311  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  26.59 
 
 
462 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  27.91 
 
 
552 aa  119  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  27.11 
 
 
475 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  23.44 
 
 
613 aa  113  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  24.22 
 
 
562 aa  110  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  26.29 
 
 
546 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  31.25 
 
 
505 aa  108  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  30.6 
 
 
542 aa  106  9e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  27.25 
 
 
551 aa  106  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  28.57 
 
 
515 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  30.22 
 
 
542 aa  105  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  25.46 
 
 
569 aa  104  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  30.22 
 
 
542 aa  105  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  26.75 
 
 
597 aa  103  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  24.23 
 
 
578 aa  103  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  24.23 
 
 
601 aa  103  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  25.19 
 
 
522 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  27.41 
 
 
549 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  27.55 
 
 
479 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  23.66 
 
 
484 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  23.47 
 
 
484 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  29.89 
 
 
487 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  25.34 
 
 
506 aa  99.8  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  26.42 
 
 
662 aa  98.2  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  25.9 
 
 
558 aa  97.8  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  26.91 
 
 
447 aa  97.1  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  27.11 
 
 
415 aa  95.5  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2176  site-specific recombinase, putative  26.03 
 
 
612 aa  95.1  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  20.88 
 
 
665 aa  95.1  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  25.16 
 
 
521 aa  95.1  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  23.76 
 
 
558 aa  94.4  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  26.41 
 
 
539 aa  93.6  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  30 
 
 
488 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  26.19 
 
 
541 aa  92.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  26.69 
 
 
441 aa  92  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  27.3 
 
 
489 aa  91.7  3e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  23.72 
 
 
547 aa  91.7  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  24.73 
 
 
527 aa  91.7  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  26.69 
 
 
441 aa  90.1  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  24.78 
 
 
565 aa  90.1  9e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  27.1 
 
 
578 aa  89.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  21.93 
 
 
546 aa  89.4  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  26.21 
 
 
584 aa  89.7  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  25.06 
 
 
540 aa  89  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2325  recombinase  23.37 
 
 
697 aa  89  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  25.71 
 
 
528 aa  89  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  25.71 
 
 
528 aa  89  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  26.93 
 
 
500 aa  88.6  3e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  26.33 
 
 
550 aa  87.8  4e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0913  resolvase domain-containing protein  23.45 
 
 
554 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.955385  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  25.09 
 
 
606 aa  85.5  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  23.31 
 
 
494 aa  85.5  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  25.06 
 
 
542 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  22.79 
 
 
534 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  25.09 
 
 
606 aa  85.5  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  25.68 
 
 
498 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  25.09 
 
 
485 aa  85.1  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  28.34 
 
 
564 aa  84.3  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  24.25 
 
 
551 aa  84  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  23.11 
 
 
421 aa  84  0.000000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  23.71 
 
 
552 aa  83.2  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  22.76 
 
 
537 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  22.84 
 
 
518 aa  81.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  23.08 
 
 
561 aa  82  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  24.69 
 
 
546 aa  80.9  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  26.79 
 
 
511 aa  80.9  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  22.83 
 
 
576 aa  80.5  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  24.2 
 
 
537 aa  80.1  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  24.91 
 
 
445 aa  80.1  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  24.83 
 
 
445 aa  79  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  24.57 
 
 
445 aa  78.6  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  22.46 
 
 
511 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  28.02 
 
 
513 aa  77  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  20.99 
 
 
509 aa  76.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  24.34 
 
 
561 aa  76.3  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  24.57 
 
 
542 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  24.18 
 
 
553 aa  75.5  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  23.99 
 
 
441 aa  75.5  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  22.57 
 
 
547 aa  74.7  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  28.37 
 
 
522 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  24.52 
 
 
526 aa  73.9  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  24.61 
 
 
541 aa  73.9  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  23.01 
 
 
475 aa  73.9  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  20.96 
 
 
555 aa  73.9  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  22.17 
 
 
515 aa  73.6  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  22.9 
 
 
546 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  28.21 
 
 
522 aa  72.8  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  23.86 
 
 
539 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0049  resolvase domain-containing protein  22.27 
 
 
449 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  26.4 
 
 
522 aa  72  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>