More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2336 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  100 
 
 
532 aa  1068    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  33.08 
 
 
578 aa  227  4e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  33.71 
 
 
576 aa  219  8.999999999999998e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  32.78 
 
 
549 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  32.1 
 
 
565 aa  216  7e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  32.33 
 
 
662 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  32.53 
 
 
551 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  32.7 
 
 
569 aa  214  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37130  Recombinase  32.36 
 
 
520 aa  214  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  33.09 
 
 
541 aa  213  7e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  35.89 
 
 
540 aa  207  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  31.23 
 
 
597 aa  207  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  31.63 
 
 
562 aa  205  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  31.2 
 
 
578 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  33.27 
 
 
537 aa  205  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  31.2 
 
 
601 aa  205  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  31.14 
 
 
549 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  31.62 
 
 
558 aa  201  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  31.68 
 
 
552 aa  201  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  31.56 
 
 
584 aa  199  9e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  33.4 
 
 
542 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  34.14 
 
 
546 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  33.94 
 
 
539 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  32.53 
 
 
542 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  35.14 
 
 
564 aa  181  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1541  recombinase  41.29 
 
 
414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.343961  normal  0.0432678 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  29.68 
 
 
564 aa  156  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  34.22 
 
 
336 aa  145  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2219  recombinase  30.91 
 
 
558 aa  140  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338837  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  23.56 
 
 
506 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  22.95 
 
 
515 aa  127  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  23.97 
 
 
485 aa  126  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  27.49 
 
 
517 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  26.94 
 
 
496 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1759  Resolvase domain  35.93 
 
 
251 aa  119  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.621745  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  21.71 
 
 
534 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  27.94 
 
 
626 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  22.14 
 
 
542 aa  117  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  28.57 
 
 
540 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  22.14 
 
 
542 aa  117  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  22.14 
 
 
542 aa  116  7.999999999999999e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  22.75 
 
 
522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  23.01 
 
 
482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  29.5 
 
 
534 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  23.78 
 
 
521 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  26.79 
 
 
475 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  27.2 
 
 
488 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  26.84 
 
 
542 aa  111  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  26.84 
 
 
554 aa  111  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  24.85 
 
 
546 aa  111  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  29.85 
 
 
547 aa  111  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  26.92 
 
 
511 aa  111  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  29.28 
 
 
534 aa  111  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  24.87 
 
 
494 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  26.1 
 
 
487 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  26.08 
 
 
510 aa  109  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  28.5 
 
 
534 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  28.85 
 
 
534 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  28.85 
 
 
534 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  24.05 
 
 
415 aa  108  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  28.47 
 
 
534 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  28.76 
 
 
537 aa  107  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  28.05 
 
 
561 aa  107  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  28.54 
 
 
537 aa  106  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  28.63 
 
 
509 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  28.53 
 
 
484 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  26.4 
 
 
563 aa  102  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  28.22 
 
 
484 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  26.03 
 
 
539 aa  100  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  27.32 
 
 
518 aa  100  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  23.2 
 
 
558 aa  99.4  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  27.11 
 
 
590 aa  97.4  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  27.4 
 
 
551 aa  97.4  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0834  recombinase  32.89 
 
 
277 aa  97.1  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.315619  hitchhiker  0.000339857 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  25.19 
 
 
548 aa  97.1  8e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  25.79 
 
 
561 aa  96.3  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  26.91 
 
 
546 aa  96.3  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3285  Recombinase  22.84 
 
 
554 aa  96.3  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  25.1 
 
 
613 aa  94.4  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  24.74 
 
 
552 aa  93.6  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0913  resolvase domain-containing protein  25.29 
 
 
554 aa  90.5  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.955385  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  23.92 
 
 
606 aa  90.1  8e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  23.92 
 
 
606 aa  90.1  8e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  26.27 
 
 
738 aa  90.1  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  26.22 
 
 
555 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  26.3 
 
 
500 aa  89.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  27.32 
 
 
565 aa  89  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  25.26 
 
 
498 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  25.07 
 
 
429 aa  88.2  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  25.88 
 
 
505 aa  87.8  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  20.97 
 
 
534 aa  87.8  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  23.64 
 
 
447 aa  87  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  24.31 
 
 
550 aa  87  7e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  24.14 
 
 
479 aa  87  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2537  recombinase  28.05 
 
 
556 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  20.54 
 
 
504 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  25.07 
 
 
579 aa  85.9  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  25.2 
 
 
441 aa  85.9  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  28.38 
 
 
540 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2732  recombinase  28.77 
 
 
583 aa  84  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>