265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2219 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2219  recombinase  100 
 
 		 558 aa  1119    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338837  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  40 
 
 		 551 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  41.29 
 
 		 578 aa  385  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  41.29 
 
 		 601 aa  385  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  40.53 
 
 		 597 aa  379  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  40.19 
 
 		 662 aa  378  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  38.7 
 
 		 569 aa  376  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  40.08 
 
 		 552 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  38.14 
 
 		 584 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  38.32 
 
 		 562 aa  348  1e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  37.19 
 
 		 578 aa  348  1e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  37.48 
 
 		 549 aa  348  1e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  38.98 
 
 		 549 aa  342  9e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  38.79 
 
 		 576 aa  341  2e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  37.7 
 
 		 565 aa  324  2e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  38.86 
 
 		 537 aa  322  8e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  37.4 
 
 		 541 aa  317  5e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  37.08 
 
 		 558 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  37.87 
 
 		 564 aa  302  1e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  36.28 
 
 		 540 aa  300  5e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  35.82 
 
 		 542 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  35.32 
 
 		 542 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  32.79 
 
 		 539 aa  240  5e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  43.73 
 
 		 336 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  33.54 
 
 		 546 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  32.65 
 
 		 564 aa  223  7e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1759  Resolvase domain  46.9 
 
 		 251 aa  195  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.621745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37130  Recombinase  33.47 
 
 		 520 aa  187  6e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0834  recombinase  40.45 
 
 		 277 aa  172  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.315619  hitchhiker  0.000339857 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  31.17 
 
 		 626 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  30.91 
 
 		 532 aa  163  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  25.83 
 
 		 506 aa  123  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  27.64 
 
 		 738 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4799  recombinase  26.4 
 
 		 564 aa  122  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284934  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  23.06 
 
 		 487 aa  115  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 485 aa  107  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  24.58 
 
 		 542 aa  107  6e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  24.79 
 
 		 542 aa  107  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  24.79 
 
 		 542 aa  107  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5403  Resolvase domain  32.29 
 
 		 279 aa  105  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  25.83 
 
 		 479 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  23.39 
 
 		 494 aa  101  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  26.32 
 
 		 561 aa  100  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  25.13 
 
 		 488 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  26.03 
 
 		 546 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  24.48 
 
 		 548 aa  95.5  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0980  Resolvase domain  23.12 
 
 		 707 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0578275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4059  Resolvase domain  26.98 
 
 		 862 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932376  normal  0.13959 
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  23.95 
 
 		 554 aa  91.7  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  25.57 
 
 		 496 aa  91.7  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  26.51 
 
 		 555 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  25.99 
 
 		 482 aa  91.7  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  27.74 
 
 		 547 aa  90.9  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  23.95 
 
 		 542 aa  90.5  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  22.08 
 
 		 521 aa  89.4  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3389  hypothetical protein  30.7 
 
 		 297 aa  90.1  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  27.89 
 
 		 526 aa  88.2  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  27.51 
 
 		 460 aa  87.8  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  24.66 
 
 		 517 aa  87  7e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  22.91 
 
 		 510 aa  84  0.000000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  27.38 
 
 		 515 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  23.39 
 
 		 484 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26050  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29.66 
 
 		 511 aa  82  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  22.18 
 
 		 539 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  25.22 
 
 		 504 aa  81.6  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3843  Resolvase domain  25.71 
 
 		 707 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  26.7 
 
 		 561 aa  81.3  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  23.39 
 
 		 484 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3623  recombinase  27.05 
 
 		 515 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  23.56 
 
 		 537 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  26.13 
 
 		 515 aa  80.1  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0979  Resolvase domain  24.67 
 
 		 678 aa  80.1  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.127172 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4607  resolvase-like protein  26.24 
 
 		 476 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  27.33 
 
 		 516 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  22.74 
 
 		 515 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  27.83 
 
 		 516 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  28.73 
 
 		 540 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  24 
 
 		 518 aa  75.9  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  25.45 
 
 		 485 aa  75.9  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  24.26 
 
 		 521 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  24.45 
 
 		 641 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  23.48 
 
 		 522 aa  74.3  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  26.76 
 
 		 522 aa  74.3  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  23.93 
 
 		 553 aa  74.3  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 580 aa  74.3  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  23.83 
 
 		 579 aa  74.3  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  24.81 
 
 		 565 aa  74.3  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  24.89 
 
 		 462 aa  73.9  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  23.9 
 
 		 498 aa  73.9  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  23.71 
 
 		 540 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1402  Recombinase  27.53 
 
 		 534 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  23.06 
 
 		 519 aa  72.4  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  24.46 
 
 		 518 aa  72.4  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  21.88 
 
 		 535 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  25.06 
 
 		 475 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  25.08 
 
 		 519 aa  72  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  25 
 
 		 552 aa  72  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  25.46 
 
 		 524 aa  72  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  22.8 
 
 		 526 aa  71.6  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  26.01 
 
 		 506 aa  71.2  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>