81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0979 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0979  Resolvase domain  100 
 
 		 678 aa  1377    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.127172 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0980  Resolvase domain  28.03 
 
 		 707 aa  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0578275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3843  Resolvase domain  24.73 
 
 		 707 aa  152  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  26.24 
 
 		 569 aa  113  9e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  24.76 
 
 		 626 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  24.72 
 
 		 552 aa  109  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  26.46 
 
 		 584 aa  108  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  25.05 
 
 		 597 aa  107  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  26.51 
 
 		 578 aa  100  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  26.01 
 
 		 662 aa  99  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  24.66 
 
 		 551 aa  98.2  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  25.34 
 
 		 540 aa  97.4  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  23.99 
 
 		 578 aa  96.7  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  23.99 
 
 		 601 aa  97.1  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  28.37 
 
 		 564 aa  94.7  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  26.16 
 
 		 546 aa  94  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  27.89 
 
 		 549 aa  92.8  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  25 
 
 		 541 aa  92  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  27.15 
 
 		 576 aa  91.3  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  25.92 
 
 		 539 aa  90.1  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  27.36 
 
 		 521 aa  89.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  28.14 
 
 		 522 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  27.16 
 
 		 520 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  24.3 
 
 		 565 aa  82.4  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  27.13 
 
 		 519 aa  82  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  27.74 
 
 		 522 aa  79  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  27.05 
 
 		 517 aa  76.6  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  29.59 
 
 		 738 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  25.44 
 
 		 537 aa  75.9  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2219  recombinase  24.5 
 
 		 558 aa  74.7  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338837  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  24.42 
 
 		 564 aa  74.3  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  23.56 
 
 		 542 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  26.39 
 
 		 562 aa  72.8  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  23.71 
 
 		 558 aa  72.4  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  23.66 
 
 		 511 aa  72  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  24.84 
 
 		 549 aa  70.9  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  23.98 
 
 		 542 aa  68.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  23.57 
 
 		 665 aa  68.2  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4059  Resolvase domain  24.86 
 
 		 862 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932376  normal  0.13959 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  27.75 
 
 		 553 aa  65.9  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  22.85 
 
 		 506 aa  65.9  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  30.26 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  26.13 
 
 		 519 aa  64.3  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  24.69 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  25.64 
 
 		 442 aa  63.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  22.4 
 
 		 494 aa  60.8  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  28.65 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  25.29 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1759  Resolvase domain  26.05 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.621745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  22.07 
 
 		 543 aa  57  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  19.76 
 
 		 485 aa  55.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  23.26 
 
 		 613 aa  56.6  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  28.36 
 
 		 546 aa  55.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  24.6 
 
 		 521 aa  56.2  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  23.53 
 
 		 482 aa  54.7  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  30.64 
 
 		 509 aa  54.7  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  21.88 
 
 		 484 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  27.24 
 
 		 522 aa  53.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5403  Resolvase domain  26.19 
 
 		 279 aa  52  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  21.88 
 
 		 484 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2051  resolvase domain-containing protein  25.09 
 
 		 494 aa  52.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37130  Recombinase  23.83 
 
 		 520 aa  51.2  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3757  Resolvase domain protein  26.74 
 
 		 341 aa  50.8  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  22.26 
 
 		 558 aa  50.8  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  24.72 
 
 		 272 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  22.4 
 
 		 547 aa  49.3  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  22.11 
 
 		 532 aa  48.1  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  23.43 
 
 		 475 aa  47.4  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  25.67 
 
 		 534 aa  47.4  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  23.7 
 
 		 526 aa  47.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2039  Recombinase  19.17 
 
 		 275 aa  47  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  19.88 
 
 		 541 aa  45.4  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  23.03 
 
 		 523 aa  45.8  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  27.84 
 
 		 295 aa  45.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  25 
 
 		 181 aa  45.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  23.58 
 
 		 485 aa  44.3  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  23.13 
 
 		 500 aa  44.3  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  23.56 
 
 		 524 aa  44.3  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  19.46 
 
 		 552 aa  44.3  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  21.91 
 
 		 523 aa  43.9  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  25.44 
 
 		 545 aa  43.9  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>