More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2219 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2219  recombinase  100 
 
 		 541 aa  1103    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  46.14 
 
 		 540 aa  481  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  46.06 
 
 		 539 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  48.12 
 
 		 546 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  45.51 
 
 		 542 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  45.8 
 
 		 542 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  45.39 
 
 		 537 aa  432  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  41.05 
 
 		 551 aa  401  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  39.58 
 
 		 578 aa  380  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  39.96 
 
 		 662 aa  376  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  38.86 
 
 		 569 aa  378  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  39.85 
 
 		 584 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  38.02 
 
 		 552 aa  371  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  39.75 
 
 		 549 aa  365  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  38.43 
 
 		 597 aa  357  2.9999999999999997e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  39.27 
 
 		 576 aa  353  5.9999999999999994e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  38.75 
 
 		 549 aa  352  1e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  38.14 
 
 		 578 aa  346  6e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  38.14 
 
 		 601 aa  346  6e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  41.05 
 
 		 558 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  36.68 
 
 		 562 aa  327  4.0000000000000003e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  36.41 
 
 		 565 aa  326  8.000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  38.7 
 
 		 564 aa  318  1e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2219  recombinase  37.4 
 
 		 558 aa  296  5e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338837  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  47.75 
 
 		 336 aa  262  1e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  31.31 
 
 		 564 aa  242  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37130  Recombinase  35.68 
 
 		 520 aa  218  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0834  recombinase  49.52 
 
 		 277 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.315619  hitchhiker  0.000339857 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  33.09 
 
 		 532 aa  213  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  29.85 
 
 		 626 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1759  Resolvase domain  44.44 
 
 		 251 aa  182  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.621745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  30.1 
 
 		 738 aa  172  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  26.48 
 
 		 521 aa  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  27.98 
 
 		 485 aa  144  5e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  25.72 
 
 		 506 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  28.73 
 
 		 517 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  27.63 
 
 		 515 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  27.19 
 
 		 546 aa  137  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  25.33 
 
 		 542 aa  132  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  25.11 
 
 		 542 aa  130  8.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  25.11 
 
 		 542 aa  130  8.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  26.46 
 
 		 510 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  26.25 
 
 		 479 aa  128  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  25.9 
 
 		 522 aa  127  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3843  Resolvase domain  28.88 
 
 		 707 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  27.76 
 
 		 511 aa  120  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  26.61 
 
 		 563 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  27.75 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  24.6 
 
 		 534 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  25.48 
 
 		 494 aa  118  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  26.03 
 
 		 462 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  26.43 
 
 		 482 aa  117  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  25.97 
 
 		 496 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0980  Resolvase domain  26.34 
 
 		 707 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0578275 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3389  hypothetical protein  31.25 
 
 		 297 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  29.55 
 
 		 522 aa  113  7.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  26.04 
 
 		 487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  27.59 
 
 		 547 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  24.43 
 
 		 548 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4799  recombinase  27.69 
 
 		 564 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284934  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  25.14 
 
 		 522 aa  111  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  28.61 
 
 		 539 aa  109  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  24.89 
 
 		 542 aa  108  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  24.89 
 
 		 554 aa  108  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  28.53 
 
 		 516 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  28.24 
 
 		 516 aa  107  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  25.8 
 
 		 488 aa  107  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5403  Resolvase domain  31.05 
 
 		 279 aa  106  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4059  Resolvase domain  24.67 
 
 		 862 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932376  normal  0.13959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  28.29 
 
 		 546 aa  104  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  28.71 
 
 		 484 aa  103  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  25.11 
 
 		 535 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  24.74 
 
 		 515 aa  103  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  26.11 
 
 		 552 aa  101  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  29.4 
 
 		 484 aa  101  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  22.93 
 
 		 475 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  24.94 
 
 		 606 aa  99.4  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  27.32 
 
 		 519 aa  99.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  24.94 
 
 		 606 aa  99.4  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3285  Recombinase  26.81 
 
 		 554 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  28.17 
 
 		 613 aa  99  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  28.09 
 
 		 558 aa  97.1  8e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  23.88 
 
 		 517 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  27.15 
 
 		 561 aa  94.7  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  25.75 
 
 		 579 aa  94.7  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  26.19 
 
 		 515 aa  94  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.667193 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02510  Recombinase  27.95 
 
 		 518 aa  93.6  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02474  hypothetical protein  27.95 
 
 		 518 aa  93.6  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.665428  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2906  resolvase family site-specific recombinase  27.95 
 
 		 518 aa  93.6  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0034  recombinase, putative  28.45 
 
 		 518 aa  93.6  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0192  recombinase, putative  28.45 
 
 		 518 aa  93.6  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  26.71 
 
 		 521 aa  93.2  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3623  recombinase  26.19 
 
 		 515 aa  92.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0979  Resolvase domain  25 
 
 		 678 aa  92  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.127172 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0845  Resolvase domain protein  28.99 
 
 		 252 aa  92.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000678199  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  27.59 
 
 		 665 aa  92  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  25.48 
 
 		 537 aa  90.5  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0770  resolvase family site-specific recombinase  29.68 
 
 		 519 aa  90.1  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  24.92 
 
 		 520 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3109  Recombinase  30.27 
 
 		 497 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183661  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>