119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0980 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0980  Resolvase domain  100 
 
 		 707 aa  1446    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0578275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  29.17 
 
 		 626 aa  178  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0979  Resolvase domain  28.03 
 
 		 678 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.127172 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  28.28 
 
 		 540 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4059  Resolvase domain  27.68 
 
 		 862 aa  147  9e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932376  normal  0.13959 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  26.49 
 
 		 537 aa  129  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  26.78 
 
 		 564 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  26.34 
 
 		 541 aa  125  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  22.36 
 
 		 738 aa  125  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3843  Resolvase domain  24.78 
 
 		 707 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  25.19 
 
 		 542 aa  120  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  25.43 
 
 		 662 aa  120  9e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  26.7 
 
 		 584 aa  120  9e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  25.95 
 
 		 542 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  26.02 
 
 		 569 aa  115  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  24.78 
 
 		 551 aa  115  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  27.97 
 
 		 578 aa  114  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  26.31 
 
 		 549 aa  112  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  26.25 
 
 		 576 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  26.42 
 
 		 552 aa  110  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  23.89 
 
 		 565 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  28.7 
 
 		 549 aa  108  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  24.83 
 
 		 558 aa  105  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  25.35 
 
 		 562 aa  103  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  27.97 
 
 		 546 aa  102  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  27.38 
 
 		 564 aa  99.8  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  27.65 
 
 		 539 aa  98.6  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2219  recombinase  22.43 
 
 		 558 aa  94.4  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338837  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  25.62 
 
 		 597 aa  89  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  22.77 
 
 		 578 aa  83.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  22.77 
 
 		 601 aa  83.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  26.82 
 
 		 515 aa  82.8  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1759  Resolvase domain  30.6 
 
 		 251 aa  75.9  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.621745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  26.27 
 
 		 511 aa  75.9  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  27.56 
 
 		 336 aa  73.6  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  28.96 
 
 		 485 aa  72.8  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  28.9 
 
 		 546 aa  72  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  22.71 
 
 		 494 aa  71.6  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  29.38 
 
 		 534 aa  70.1  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  22.97 
 
 		 506 aa  69.7  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  23.87 
 
 		 665 aa  68.9  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  23.18 
 
 		 487 aa  67.8  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  28.09 
 
 		 534 aa  67.8  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  24.03 
 
 		 479 aa  67.8  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  24.68 
 
 		 613 aa  66.6  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  28.7 
 
 		 534 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  28.35 
 
 		 534 aa  65.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37130  Recombinase  23.19 
 
 		 520 aa  65.5  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  28.35 
 
 		 534 aa  65.1  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  28.35 
 
 		 534 aa  65.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  28.35 
 
 		 537 aa  64.3  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  25.7 
 
 		 482 aa  62.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5403  Resolvase domain  26.32 
 
 		 279 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  26.19 
 
 		 509 aa  62  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  23.14 
 
 		 488 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  23.93 
 
 		 532 aa  61.2  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  25.17 
 
 		 525 aa  61.2  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  28.74 
 
 		 537 aa  60.8  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  23.85 
 
 		 534 aa  60.5  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3812  recombinase  27.58 
 
 		 523 aa  60.1  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  27.93 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3501  recombinase  27.27 
 
 		 523 aa  58.9  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  25.26 
 
 		 484 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  21.72 
 
 		 580 aa  58.2  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  32.93 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  25.26 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0834  recombinase  28.5 
 
 		 277 aa  57  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.315619  hitchhiker  0.000339857 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  24.42 
 
 		 500 aa  57.4  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4607  resolvase-like protein  25.88 
 
 		 476 aa  56.6  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  25.94 
 
 		 526 aa  56.6  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  27.63 
 
 		 521 aa  55.8  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  28.65 
 
 		 511 aa  55.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03270  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  24.11 
 
 		 426 aa  55.1  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  27.18 
 
 		 513 aa  54.7  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  24.45 
 
 		 521 aa  53.9  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  25 
 
 		 543 aa  53.9  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  27.4 
 
 		 515 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4799  recombinase  19.71 
 
 		 564 aa  52.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284934  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  30.57 
 
 		 525 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  26.75 
 
 		 525 aa  53.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  27.32 
 
 		 520 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  23.24 
 
 		 558 aa  52.4  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2603  putative resolvase  27.04 
 
 		 589 aa  52  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00221459  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2577  Resolvase domain protein  22.22 
 
 		 603 aa  51.6  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.551292 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  26.85 
 
 		 485 aa  50.8  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  29.71 
 
 		 517 aa  50.8  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  27.35 
 
 		 528 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  28.8 
 
 		 449 aa  50.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  27.35 
 
 		 528 aa  50.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  25.45 
 
 		 522 aa  50.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  30.57 
 
 		 443 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  24.73 
 
 		 552 aa  49.7  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1608  putative resolvase  23.95 
 
 		 502 aa  49.3  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  29.65 
 
 		 412 aa  48.9  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  26.77 
 
 		 519 aa  48.9  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  30.32 
 
 		 441 aa  48.5  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  23.86 
 
 		 475 aa  48.5  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  27.78 
 
 		 295 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  27.31 
 
 		 522 aa  47.8  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  22.88 
 
 		 547 aa  47.4  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>