More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_215 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  100 
 
 		 563 aa  1157    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  46.99 
 
 		 542 aa  482  1e-135  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  47.6 
 
 		 554 aa  482  1e-135  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  45.58 
 
 		 517 aa  478  1e-133  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  47.39 
 
 		 510 aa  462  1e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  44.85 
 
 		 548 aa  451  1e-125  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0097  resolvase domain-containing protein  57.69 
 
 		 211 aa  243  7.999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.371309  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  30.43 
 
 		 547 aa  233  5e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  32.73 
 
 		 506 aa  221  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  30.67 
 
 		 485 aa  213  7e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  26.67 
 
 		 561 aa  200  6e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  32.45 
 
 		 494 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  26.52 
 
 		 561 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  28.21 
 
 		 540 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  26.91 
 
 		 590 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  26 
 
 		 537 aa  193  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  27.47 
 
 		 551 aa  189  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  27.01 
 
 		 579 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  26.81 
 
 		 565 aa  180  7e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  27.1 
 
 		 518 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  26.34 
 
 		 555 aa  173  9e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  24.72 
 
 		 509 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0096  hypothetical protein  36.82 
 
 		 261 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  28.37 
 
 		 496 aa  162  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  28.57 
 
 		 546 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  25.97 
 
 		 613 aa  158  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  24.75 
 
 		 546 aa  156  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  26.81 
 
 		 521 aa  153  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  27.98 
 
 		 522 aa  150  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  24.31 
 
 		 665 aa  149  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  27.32 
 
 		 542 aa  144  4e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  27.32 
 
 		 542 aa  144  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  27.32 
 
 		 542 aa  144  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  28.43 
 
 		 415 aa  141  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  29.52 
 
 		 482 aa  140  8.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  24.52 
 
 		 515 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  26.81 
 
 		 541 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  24.26 
 
 		 475 aa  136  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0845  Resolvase domain protein  33.48 
 
 		 252 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000678199  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  30.34 
 
 		 743 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  26.77 
 
 		 462 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  29.81 
 
 		 540 aa  130  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  26.17 
 
 		 539 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1250  resolvase  25.05 
 
 		 524 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  25.43 
 
 		 569 aa  127  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  25.38 
 
 		 578 aa  125  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0189  putative recombinase  31.94 
 
 		 521 aa  125  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.113456 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1192  putative recombinase  31.94 
 
 		 521 aa  125  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  29.56 
 
 		 515 aa  124  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  26.75 
 
 		 549 aa  124  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  28.44 
 
 		 532 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  26 
 
 		 576 aa  123  9e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0075  recombinase  29.94 
 
 		 521 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.243508  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3285  Recombinase  26.2 
 
 		 554 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  26.23 
 
 		 537 aa  121  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0034  recombinase, putative  31.21 
 
 		 518 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0192  recombinase, putative  31.21 
 
 		 518 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  26.02 
 
 		 552 aa  120  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  27.55 
 
 		 504 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0028  recombinase  29.31 
 
 		 537 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  28.01 
 
 		 558 aa  118  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3172  Recombinase  30.25 
 
 		 521 aa  118  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4807  recombinase  30.33 
 
 		 519 aa  117  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2982  putative recombinase  29.85 
 
 		 521 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  23.63 
 
 		 552 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  25.14 
 
 		 564 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  23.77 
 
 		 534 aa  115  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  23.96 
 
 		 601 aa  114  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3963  recombinase  27.46 
 
 		 493 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  23.96 
 
 		 578 aa  114  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  25 
 
 		 465 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1466  putative recombinase  28.99 
 
 		 568 aa  114  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  25.7 
 
 		 562 aa  114  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  23.69 
 
 		 551 aa  113  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  25.38 
 
 		 539 aa  113  9e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  29.97 
 
 		 526 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  27.51 
 
 		 505 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  24.74 
 
 		 525 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  26.4 
 
 		 546 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  26.62 
 
 		 524 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  26.33 
 
 		 542 aa  112  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0770  resolvase family site-specific recombinase  28.4 
 
 		 519 aa  110  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  25.9 
 
 		 489 aa  110  6e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  24.51 
 
 		 662 aa  110  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  25.23 
 
 		 584 aa  110  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  27.64 
 
 		 487 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  24.62 
 
 		 525 aa  110  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  31.11 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  26.97 
 
 		 542 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  24.39 
 
 		 498 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02510  Recombinase  27.48 
 
 		 518 aa  108  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02474  hypothetical protein  27.48 
 
 		 518 aa  108  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.665428  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2906  resolvase family site-specific recombinase  27.48 
 
 		 518 aa  108  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  24.65 
 
 		 549 aa  108  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  24.69 
 
 		 541 aa  107  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3109  resolvase  32.74 
 
 		 377 aa  106  9e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  28.69 
 
 		 511 aa  106  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  29.36 
 
 		 534 aa  106  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  27.76 
 
 		 522 aa  106  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  24.23 
 
 		 597 aa  106  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>