More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0592 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  100 
 
 
462 aa  952    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  36.81 
 
 
474 aa  229  6e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  42.25 
 
 
475 aa  228  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  30.8 
 
 
521 aa  204  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  37.99 
 
 
546 aa  204  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  30.04 
 
 
522 aa  192  9e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  29.9 
 
 
665 aa  191  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  30.32 
 
 
613 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  37.3 
 
 
484 aa  189  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  36.99 
 
 
484 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  28.14 
 
 
515 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  31.57 
 
 
415 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  35.05 
 
 
546 aa  182  9.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  29.18 
 
 
542 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  29.18 
 
 
542 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  29.18 
 
 
542 aa  181  4e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  35.16 
 
 
509 aa  181  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  30.16 
 
 
525 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  34.47 
 
 
525 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  29.43 
 
 
447 aa  172  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  32.2 
 
 
527 aa  169  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  34.18 
 
 
441 aa  167  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  32.99 
 
 
544 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  30.18 
 
 
525 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2997  resolvase domain-containing protein  33.63 
 
 
444 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  29.25 
 
 
515 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  29.22 
 
 
511 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  33.23 
 
 
445 aa  162  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  30.96 
 
 
421 aa  159  7e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  34.06 
 
 
534 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  27.87 
 
 
441 aa  159  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  33.23 
 
 
343 aa  158  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  34.06 
 
 
534 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  32 
 
 
445 aa  158  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  31.69 
 
 
445 aa  157  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  32.19 
 
 
537 aa  156  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  31.6 
 
 
485 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  33.44 
 
 
534 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  33.44 
 
 
534 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  34.27 
 
 
545 aa  155  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  33.12 
 
 
462 aa  155  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  33.12 
 
 
534 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  33.44 
 
 
534 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  33.44 
 
 
537 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  30 
 
 
441 aa  155  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  28.18 
 
 
528 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  28.18 
 
 
528 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  28.83 
 
 
506 aa  153  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  33.45 
 
 
443 aa  153  8e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  27.2 
 
 
558 aa  152  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  32.11 
 
 
550 aa  151  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  33.93 
 
 
506 aa  152  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  32.08 
 
 
460 aa  150  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  26.67 
 
 
539 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  37.16 
 
 
412 aa  151  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  31.92 
 
 
500 aa  149  9e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  32.49 
 
 
462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  27.76 
 
 
445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  30.56 
 
 
522 aa  148  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  28.75 
 
 
449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  31.7 
 
 
549 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  32.57 
 
 
532 aa  148  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  32.46 
 
 
441 aa  147  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  30.89 
 
 
489 aa  147  5e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  30.36 
 
 
299 aa  146  8.000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  25 
 
 
504 aa  146  9e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  31.78 
 
 
459 aa  145  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  31.34 
 
 
500 aa  144  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  30.03 
 
 
500 aa  144  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  32.34 
 
 
474 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  31.55 
 
 
500 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  30.29 
 
 
272 aa  140  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  25.82 
 
 
494 aa  139  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  28.71 
 
 
558 aa  139  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  26.81 
 
 
517 aa  138  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  28.35 
 
 
485 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  28.16 
 
 
568 aa  136  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  28.61 
 
 
511 aa  133  9e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  29.45 
 
 
519 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  24.9 
 
 
569 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  25.3 
 
 
522 aa  132  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  25.1 
 
 
551 aa  131  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  27.78 
 
 
479 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  27.78 
 
 
479 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  28.91 
 
 
561 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  30.75 
 
 
540 aa  129  9.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3623  recombinase  25.84 
 
 
515 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  26.14 
 
 
513 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  28.78 
 
 
548 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  25.29 
 
 
662 aa  128  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  27.4 
 
 
516 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  27.4 
 
 
516 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  25.84 
 
 
537 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  27.66 
 
 
523 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  24.4 
 
 
606 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  24.4 
 
 
606 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  26.65 
 
 
523 aa  127  4.0000000000000003e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  26.04 
 
 
496 aa  127  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  24.95 
 
 
597 aa  126  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  26.17 
 
 
518 aa  126  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>