More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5404 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  100 
 
 		 738 aa  1495    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  29.27 
 
 		 540 aa  191  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  30.21 
 
 		 537 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  30.72 
 
 		 626 aa  184  8.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  30.1 
 
 		 541 aa  177  7e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3843  Resolvase domain  27.69 
 
 		 707 aa  169  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  28.22 
 
 		 542 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  28.04 
 
 		 542 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  29.45 
 
 		 562 aa  165  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  29.42 
 
 		 539 aa  162  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  27.39 
 
 		 549 aa  155  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  26.99 
 
 		 565 aa  152  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  30.42 
 
 		 546 aa  151  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  28.09 
 
 		 558 aa  147  9e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  26.62 
 
 		 552 aa  146  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4059  Resolvase domain  26.39 
 
 		 862 aa  145  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932376  normal  0.13959 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  25.08 
 
 		 578 aa  138  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  27.79 
 
 		 576 aa  138  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  25.33 
 
 		 549 aa  135  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  25.99 
 
 		 584 aa  135  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  25.23 
 
 		 551 aa  131  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  25.41 
 
 		 601 aa  130  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  28.12 
 
 		 564 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  26.22 
 
 		 569 aa  130  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  25.41 
 
 		 578 aa  130  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  25.37 
 
 		 597 aa  128  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  28.91 
 
 		 564 aa  127  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  26.35 
 
 		 662 aa  127  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0980  Resolvase domain  22.36 
 
 		 707 aa  124  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0578275 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  31.49 
 
 		 336 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2219  recombinase  26.72 
 
 		 558 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338837  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5403  Resolvase domain  31.7 
 
 		 279 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  28.09 
 
 		 542 aa  113  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  28.09 
 
 		 542 aa  113  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  28.09 
 
 		 542 aa  113  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  23.79 
 
 		 506 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  28.7 
 
 		 442 aa  102  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1759  Resolvase domain  33.48 
 
 		 251 aa  100  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.621745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  23.59 
 
 		 558 aa  97.4  9e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  30.43 
 
 		 487 aa  94.4  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  26.27 
 
 		 532 aa  93.6  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  25.3 
 
 		 522 aa  92.8  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  25.56 
 
 		 523 aa  92  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  26.48 
 
 		 496 aa  91.7  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  28.22 
 
 		 488 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  23.65 
 
 		 522 aa  89.4  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  27.3 
 
 		 479 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  29.73 
 
 		 513 aa  88.2  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0834  recombinase  29.72 
 
 		 277 aa  87  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.315619  hitchhiker  0.000339857 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  27.43 
 
 		 485 aa  86.7  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  24.3 
 
 		 431 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  26.44 
 
 		 430 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  24.94 
 
 		 523 aa  84.7  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  24.61 
 
 		 523 aa  84.7  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37130  Recombinase  27.84 
 
 		 520 aa  84.3  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  25.88 
 
 		 500 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  24.12 
 
 		 535 aa  82  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  25.53 
 
 		 515 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  20.3 
 
 		 521 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  25.23 
 
 		 586 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  24.25 
 
 		 511 aa  80.9  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  23.44 
 
 		 475 aa  80.9  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  26.98 
 
 		 613 aa  79.3  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  26.02 
 
 		 546 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  25 
 
 		 534 aa  79.3  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4799  recombinase  27.66 
 
 		 564 aa  78.6  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284934  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 		 518 aa  78.2  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  24.35 
 
 		 523 aa  77.8  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  25.37 
 
 		 519 aa  77  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  27.18 
 
 		 421 aa  76.3  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  27.53 
 
 		 543 aa  76.6  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  25.4 
 
 		 500 aa  75.5  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  27.13 
 
 		 520 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0979  Resolvase domain  21.71 
 
 		 678 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.127172 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  24.67 
 
 		 552 aa  75.1  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  25.19 
 
 		 484 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  24.8 
 
 		 524 aa  75.5  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  25.38 
 
 		 484 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  28 
 
 		 544 aa  74.7  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  25.97 
 
 		 522 aa  74.7  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4607  resolvase-like protein  26.56 
 
 		 476 aa  74.7  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  26.42 
 
 		 521 aa  74.3  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  32.78 
 
 		 546 aa  73.6  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  27.81 
 
 		 540 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  24.67 
 
 		 537 aa  73.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  27.66 
 
 		 485 aa  72.4  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  31.44 
 
 		 441 aa  72  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  23.92 
 
 		 539 aa  72  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  23.71 
 
 		 547 aa  71.6  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  24.54 
 
 		 522 aa  71.6  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  25.22 
 
 		 522 aa  71.6  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  30.56 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  28.41 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  23.21 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  26.55 
 
 		 505 aa  70.9  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  26.27 
 
 		 498 aa  70.5  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  25.82 
 
 		 511 aa  70.1  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  24.77 
 
 		 535 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  30.16 
 
 		 445 aa  70.1  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  30 
 
 		 445 aa  69.7  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>