More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0859 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  100 
 
 
544 aa  1128    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  31.89 
 
 
525 aa  299  8e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  32.51 
 
 
525 aa  296  5e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  30.85 
 
 
528 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  30.43 
 
 
528 aa  260  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  32 
 
 
527 aa  257  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  30.65 
 
 
511 aa  252  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  30.79 
 
 
525 aa  250  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  36.94 
 
 
441 aa  244  3e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  35.31 
 
 
445 aa  244  3e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  35.04 
 
 
445 aa  244  3.9999999999999997e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  36.67 
 
 
441 aa  241  2.9999999999999997e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  33.6 
 
 
447 aa  240  5e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  34.88 
 
 
445 aa  240  5e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  33.64 
 
 
534 aa  218  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  30.89 
 
 
534 aa  217  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  33.02 
 
 
534 aa  217  5e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  33.41 
 
 
537 aa  216  8e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  33.64 
 
 
534 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  33.18 
 
 
534 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  33.18 
 
 
534 aa  211  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  31.47 
 
 
462 aa  210  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  30.86 
 
 
449 aa  209  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  34.67 
 
 
343 aa  208  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  31.88 
 
 
459 aa  207  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  32.61 
 
 
462 aa  207  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  32.71 
 
 
537 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  31.44 
 
 
441 aa  199  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  33.05 
 
 
522 aa  198  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  30.19 
 
 
460 aa  196  7e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  31.82 
 
 
549 aa  194  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  36.36 
 
 
532 aa  191  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  32.52 
 
 
443 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  33.33 
 
 
441 aa  190  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  31.74 
 
 
568 aa  189  9e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  32.08 
 
 
489 aa  189  1e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  36.33 
 
 
550 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  33.85 
 
 
545 aa  181  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  33.23 
 
 
500 aa  180  7e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  26.1 
 
 
522 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  24.73 
 
 
542 aa  172  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  30.31 
 
 
445 aa  172  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  26.8 
 
 
546 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  24.73 
 
 
542 aa  172  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  24.73 
 
 
542 aa  172  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  29.84 
 
 
474 aa  171  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  30.21 
 
 
506 aa  171  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  32.38 
 
 
462 aa  170  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  29.57 
 
 
506 aa  167  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  27.44 
 
 
613 aa  166  9e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  28.19 
 
 
534 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  32.68 
 
 
484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  26.92 
 
 
665 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  32.68 
 
 
484 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  34.06 
 
 
412 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  28.26 
 
 
475 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  28.06 
 
 
415 aa  162  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1125  recombinase  32.47 
 
 
322 aa  158  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0324535  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0913  resolvase domain-containing protein  25.68 
 
 
554 aa  158  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.955385  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  29.11 
 
 
546 aa  158  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  25.9 
 
 
521 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  26.9 
 
 
515 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  30.56 
 
 
421 aa  154  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  30.73 
 
 
474 aa  151  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  32.16 
 
 
485 aa  150  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  26.3 
 
 
552 aa  145  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  27.88 
 
 
509 aa  144  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  31.66 
 
 
555 aa  143  9e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  31.66 
 
 
550 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  26.76 
 
 
515 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  27.99 
 
 
299 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  30.09 
 
 
558 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  27.17 
 
 
565 aa  131  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  26.2 
 
 
555 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  26.54 
 
 
579 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  26.27 
 
 
561 aa  128  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  27.27 
 
 
500 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  24.25 
 
 
500 aa  127  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  26.47 
 
 
561 aa  127  8.000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  23.05 
 
 
500 aa  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  24.04 
 
 
547 aa  125  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  25.75 
 
 
558 aa  124  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  26.27 
 
 
494 aa  124  5e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  23.29 
 
 
540 aa  118  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  23.57 
 
 
551 aa  117  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  26.73 
 
 
537 aa  117  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2997  resolvase domain-containing protein  27.68 
 
 
444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  22.91 
 
 
590 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0050  resolvase domain-containing protein  25.19 
 
 
449 aa  115  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0049  resolvase domain-containing protein  25.19 
 
 
449 aa  115  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  25.21 
 
 
519 aa  114  5e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0051  site-specific recombinase  30.51 
 
 
513 aa  114  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169299  hitchhiker  0.000782563 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  30.73 
 
 
743 aa  114  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  29.32 
 
 
442 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  27.01 
 
 
518 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  26.29 
 
 
548 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  26.4 
 
 
504 aa  109  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  25.3 
 
 
482 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  25.91 
 
 
553 aa  109  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1608  putative resolvase  25.84 
 
 
502 aa  107  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>