More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2081 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2081  recombinase  100 
 
 		 441 aa  902    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  68.52 
 
 		 445 aa  615  1e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  69.61 
 
 		 443 aa  606  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  52.15 
 
 		 445 aa  466  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  51.7 
 
 		 445 aa  466  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  51.93 
 
 		 445 aa  465  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  52.08 
 
 		 447 aa  459  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  51.92 
 
 		 459 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  54.67 
 
 		 460 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  54.27 
 
 		 441 aa  445  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  52.34 
 
 		 462 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  52.1 
 
 		 462 aa  437  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  50.47 
 
 		 449 aa  435  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  46.67 
 
 		 441 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  46.8 
 
 		 441 aa  422  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  52.94 
 
 		 474 aa  411  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  50.71 
 
 		 568 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  58.18 
 
 		 343 aa  386  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  56.62 
 
 		 522 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  50.14 
 
 		 528 aa  359  5e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  50.14 
 
 		 528 aa  358  8e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  52.94 
 
 		 545 aa  356  3.9999999999999996e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  49.32 
 
 		 527 aa  347  3e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  48.93 
 
 		 549 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  50.29 
 
 		 550 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  50.43 
 
 		 506 aa  335  9e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  49.05 
 
 		 511 aa  334  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  48.41 
 
 		 525 aa  331  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  49.58 
 
 		 532 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  47.49 
 
 		 525 aa  327  3e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  45.93 
 
 		 534 aa  301  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  46.46 
 
 		 534 aa  301  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  45.93 
 
 		 534 aa  298  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  45.67 
 
 		 534 aa  297  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  46.19 
 
 		 537 aa  296  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  45.67 
 
 		 534 aa  297  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  41.94 
 
 		 525 aa  297  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  45.41 
 
 		 534 aa  293  6e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  45.45 
 
 		 537 aa  292  8e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 299 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  42.23 
 
 		 489 aa  289  6e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  43.67 
 
 		 500 aa  286  5.999999999999999e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  44.9 
 
 		 412 aa  277  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2833  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  85.62 
 
 		 154 aa  276  5e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1125  recombinase  44.59 
 
 		 322 aa  258  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0324535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  35.31 
 
 		 665 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  34.64 
 
 		 613 aa  176  9e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  32.35 
 
 		 544 aa  169  7e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  32.59 
 
 		 546 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  29.06 
 
 		 542 aa  150  4e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  28.81 
 
 		 542 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  28.81 
 
 		 542 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  32.46 
 
 		 462 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  31.65 
 
 		 509 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  27.69 
 
 		 515 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  27.59 
 
 		 546 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  31.85 
 
 		 552 aa  139  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  36.7 
 
 		 500 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  25.05 
 
 		 534 aa  137  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  38.15 
 
 		 515 aa  136  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0913  resolvase domain-containing protein  28.16 
 
 		 554 aa  136  8e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.955385  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  30.42 
 
 		 475 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  26.44 
 
 		 521 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  29.87 
 
 		 522 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  27.76 
 
 		 415 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  30.27 
 
 		 484 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  30.27 
 
 		 484 aa  119  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  31.14 
 
 		 553 aa  118  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  26.67 
 
 		 558 aa  117  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  31.01 
 
 		 485 aa  116  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  31.13 
 
 		 474 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  27.08 
 
 		 506 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1608  putative resolvase  35.15 
 
 		 502 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  28.36 
 
 		 272 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  30.79 
 
 		 421 aa  110  6e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  27.91 
 
 		 547 aa  110  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  26.9 
 
 		 482 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  27.16 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  29.27 
 
 		 522 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  26.79 
 
 		 500 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  32.77 
 
 		 281 aa  101  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  27.6 
 
 		 522 aa  100  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  27.68 
 
 		 550 aa  100  7e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  27.68 
 
 		 555 aa  100  7e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  26.99 
 
 		 561 aa  99.8  9e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  25.56 
 
 		 519 aa  99.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  25.83 
 
 		 494 aa  99  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2997  resolvase domain-containing protein  28.12 
 
 		 444 aa  98.6  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  26.13 
 
 		 479 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  26.96 
 
 		 558 aa  97.8  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1857  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  31.45 
 
 		 488 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830217  decreased coverage  0.0036727 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  27.88 
 
 		 465 aa  97.4  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  26.94 
 
 		 551 aa  96.7  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  25.75 
 
 		 579 aa  96.7  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  24.87 
 
 		 590 aa  96.3  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  29.83 
 
 		 519 aa  94.7  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  24.8 
 
 		 540 aa  94  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  27.86 
 
 		 743 aa  94  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  27.95 
 
 		 500 aa  93.6  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  27.57 
 
 		 555 aa  93.6  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>