More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0338 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  100 
 
 
498 aa  1030    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  32.15 
 
 
537 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  28.76 
 
 
541 aa  193  8e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  30.07 
 
 
475 aa  188  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  29.95 
 
 
535 aa  169  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  27.62 
 
 
539 aa  162  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  25.73 
 
 
551 aa  159  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  25.59 
 
 
550 aa  157  4e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  28.85 
 
 
524 aa  156  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  30.88 
 
 
522 aa  152  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  32.87 
 
 
429 aa  151  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  31.79 
 
 
586 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  28.4 
 
 
519 aa  150  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  30.25 
 
 
522 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2176  site-specific recombinase, putative  26.69 
 
 
612 aa  147  5e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  27.5 
 
 
523 aa  146  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  26.68 
 
 
523 aa  145  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  28.65 
 
 
526 aa  144  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  28.05 
 
 
553 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  25.97 
 
 
479 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  26.64 
 
 
534 aa  139  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  27.24 
 
 
523 aa  139  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3285  Recombinase  28.1 
 
 
554 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  25.39 
 
 
488 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  28.81 
 
 
521 aa  136  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  28.22 
 
 
519 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  28.61 
 
 
520 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  25.29 
 
 
487 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  27.99 
 
 
523 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  26.02 
 
 
606 aa  131  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  28.84 
 
 
522 aa  131  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  26.02 
 
 
606 aa  131  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  28.61 
 
 
518 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  30.58 
 
 
558 aa  126  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  26.33 
 
 
526 aa  124  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  24.24 
 
 
522 aa  124  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  24.24 
 
 
547 aa  124  6e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  23.94 
 
 
515 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  27.25 
 
 
548 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  25 
 
 
517 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  25.05 
 
 
515 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  25 
 
 
542 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  25 
 
 
554 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0050  resolvase domain-containing protein  25.82 
 
 
449 aa  117  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0049  resolvase domain-containing protein  25.82 
 
 
449 aa  117  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  27.81 
 
 
475 aa  117  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2498  cassette chromosome recombinase A  25.82 
 
 
449 aa  116  7.999999999999999e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  23.89 
 
 
509 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  27.74 
 
 
552 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  25.59 
 
 
517 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  25.81 
 
 
547 aa  114  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  29.62 
 
 
431 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  26.57 
 
 
462 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  24.34 
 
 
546 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  25.48 
 
 
511 aa  110  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  23.4 
 
 
500 aa  110  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  23.58 
 
 
522 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  27.67 
 
 
516 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  23.55 
 
 
535 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  27.36 
 
 
516 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  23.76 
 
 
534 aa  108  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  26.01 
 
 
485 aa  107  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  26.3 
 
 
543 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  27.3 
 
 
515 aa  106  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  23.55 
 
 
500 aa  106  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  23.66 
 
 
613 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  25.65 
 
 
442 aa  105  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  24.95 
 
 
558 aa  104  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  25.74 
 
 
506 aa  104  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  25.69 
 
 
561 aa  104  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  25.07 
 
 
506 aa  104  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1691  resolvase domain-containing protein  23.08 
 
 
491 aa  103  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0333311  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  24.94 
 
 
484 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  26.51 
 
 
415 aa  103  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  24.71 
 
 
484 aa  103  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3888  Recombinase  27.82 
 
 
488 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489882  normal  0.0312397 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  22.51 
 
 
665 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  25.45 
 
 
540 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1501  hypothetical protein  25.67 
 
 
512 aa  102  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.420622  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  23.79 
 
 
542 aa  102  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  23.98 
 
 
494 aa  102  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4097  Recombinase  26.37 
 
 
575 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667971  normal  0.110676 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  23.79 
 
 
542 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  23.79 
 
 
542 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  22.51 
 
 
504 aa  100  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  27.43 
 
 
521 aa  100  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  25.05 
 
 
537 aa  100  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  24.62 
 
 
465 aa  99.8  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0138  resolvase family site-specific recombinase  25.69 
 
 
516 aa  99.4  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  26.36 
 
 
539 aa  99.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  30.18 
 
 
580 aa  99.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08120  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  27.95 
 
 
274 aa  98.2  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  normal  0.202082 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  27.3 
 
 
534 aa  97.8  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  26.76 
 
 
430 aa  97.8  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  24.51 
 
 
626 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  25.82 
 
 
510 aa  96.7  9e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  27.03 
 
 
549 aa  96.7  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  24.75 
 
 
552 aa  95.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  22.07 
 
 
447 aa  95.5  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  27.5 
 
 
537 aa  94.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>