More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0288 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  100 
 
 
500 aa  1019    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  88.96 
 
 
489 aa  900    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  37.77 
 
 
506 aa  323  6e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  41.76 
 
 
445 aa  301  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  41.99 
 
 
445 aa  300  3e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  42.03 
 
 
445 aa  299  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  41.19 
 
 
441 aa  296  4e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 
568 aa  293  5e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  39.23 
 
 
445 aa  286  5e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  43.67 
 
 
441 aa  286  7e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  40.17 
 
 
528 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  38.72 
 
 
447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  33.58 
 
 
545 aa  285  2.0000000000000002e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  40.17 
 
 
528 aa  285  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  39.29 
 
 
460 aa  282  9e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  33.4 
 
 
522 aa  282  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  35.15 
 
 
441 aa  278  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  40.69 
 
 
525 aa  278  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  40.69 
 
 
525 aa  277  3e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  35.15 
 
 
441 aa  276  7e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  41.98 
 
 
511 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  31.17 
 
 
550 aa  274  3e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  39.89 
 
 
527 aa  273  7e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  37.98 
 
 
443 aa  271  1e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  30.73 
 
 
549 aa  265  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  39.19 
 
 
462 aa  262  8.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  39.5 
 
 
449 aa  259  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  38.15 
 
 
462 aa  256  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  30.59 
 
 
532 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  37.4 
 
 
459 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  39.77 
 
 
534 aa  249  6e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  39.49 
 
 
534 aa  249  8e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  41.19 
 
 
474 aa  248  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  38.92 
 
 
534 aa  247  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  39.2 
 
 
534 aa  246  4.9999999999999997e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  41.07 
 
 
534 aa  246  8e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  40.5 
 
 
537 aa  245  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  38.15 
 
 
343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  39.2 
 
 
537 aa  245  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  38.62 
 
 
534 aa  243  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  32.67 
 
 
525 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  40.07 
 
 
299 aa  212  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  34.19 
 
 
412 aa  209  9e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  32.6 
 
 
665 aa  176  7e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  34.25 
 
 
542 aa  168  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  34.25 
 
 
542 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  32.23 
 
 
515 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  34.25 
 
 
542 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  34.4 
 
 
522 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  30.67 
 
 
613 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  33.11 
 
 
544 aa  163  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  30.86 
 
 
415 aa  161  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  31.67 
 
 
521 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  28.36 
 
 
546 aa  156  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  29.31 
 
 
534 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  31.55 
 
 
546 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  28.69 
 
 
552 aa  150  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  31.92 
 
 
462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  31.52 
 
 
484 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  31.21 
 
 
484 aa  143  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1125  recombinase  31.65 
 
 
322 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0324535  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0913  resolvase domain-containing protein  27.32 
 
 
554 aa  141  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.955385  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  29.3 
 
 
475 aa  141  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  30.39 
 
 
558 aa  139  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  27.24 
 
 
509 aa  133  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  34.89 
 
 
500 aa  133  7.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  31.68 
 
 
421 aa  128  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  30.59 
 
 
558 aa  126  7e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  27.05 
 
 
550 aa  124  5e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  27.05 
 
 
555 aa  123  6e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  28.57 
 
 
506 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1608  putative resolvase  28.08 
 
 
502 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  24.22 
 
 
500 aa  121  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  26.35 
 
 
500 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  28.65 
 
 
522 aa  118  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  28.45 
 
 
485 aa  117  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  26.84 
 
 
519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  28.21 
 
 
553 aa  113  9e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0050  resolvase domain-containing protein  24.32 
 
 
449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2498  cassette chromosome recombinase A  24.66 
 
 
449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  25.99 
 
 
494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0049  resolvase domain-containing protein  24.32 
 
 
449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  27.51 
 
 
522 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  29.61 
 
 
515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  27.3 
 
 
539 aa  110  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  26.44 
 
 
479 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  27.51 
 
 
482 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  24.92 
 
 
474 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  28.57 
 
 
272 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4608  DNA recombinase, putative  25.06 
 
 
511 aa  103  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  28.57 
 
 
546 aa  103  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  28.21 
 
 
606 aa  102  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  28.21 
 
 
606 aa  102  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0849  DNA recombinase, putative  25.07 
 
 
494 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0853  DNA recombinase, putative  25.07 
 
 
494 aa  101  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000111674 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  27.74 
 
 
743 aa  101  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  26.67 
 
 
487 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  26.48 
 
 
505 aa  100  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  25.87 
 
 
488 aa  100  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  29.48 
 
 
504 aa  99.8  9e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>