More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1067 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  66.92 
 
 		 523 aa  727    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 518 aa  1080    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  64.34 
 
 		 523 aa  700    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  66.86 
 
 		 522 aa  718    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  66.86 
 
 		 522 aa  729    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  66.15 
 
 		 523 aa  723    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  63.57 
 
 		 523 aa  694    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  53.77 
 
 		 506 aa  530  1e-149  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  51.23 
 
 		 535 aa  514  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  47.01 
 
 		 552 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  52.88 
 
 		 442 aa  409  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  50.39 
 
 		 431 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  41.5 
 
 		 539 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  51.83 
 
 		 430 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  44.17 
 
 		 429 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  37.09 
 
 		 519 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  36.8 
 
 		 522 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  36.1 
 
 		 522 aa  302  1e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  35.2 
 
 		 526 aa  298  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  35.32 
 
 		 606 aa  297  3e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  35.32 
 
 		 606 aa  297  3e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  34.94 
 
 		 520 aa  293  4e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  41.15 
 
 		 543 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  35.71 
 
 		 519 aa  282  1e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  33.97 
 
 		 521 aa  280  3e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  38.12 
 
 		 553 aa  266  5e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  41.06 
 
 		 526 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  35.1 
 
 		 534 aa  250  5e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0420  resolvase domain-containing protein  43.89 
 
 		 342 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000164103  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  36.13 
 
 		 511 aa  195  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  29.18 
 
 		 547 aa  188  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2215  DNA recombinase, putative  45.7 
 
 		 192 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0494  resolvase, N-terminal domain protein  33.78 
 
 		 321 aa  164  3e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.177718 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  28.61 
 
 		 498 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  26.17 
 
 		 462 aa  126  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  31.85 
 
 		 542 aa  125  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  31.85 
 
 		 542 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  31.85 
 
 		 542 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  29.75 
 
 		 535 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  27.75 
 
 		 506 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  27.81 
 
 		 558 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  24.75 
 
 		 496 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  27.35 
 
 		 479 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2698  hypothetical protein  40.52 
 
 		 194 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  27.39 
 
 		 521 aa  111  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  24.42 
 
 		 524 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  24.79 
 
 		 475 aa  110  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  30.12 
 
 		 494 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  25.96 
 
 		 487 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  25.78 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  28.02 
 
 		 527 aa  107  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  26.67 
 
 		 515 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  27.33 
 
 		 613 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  26.36 
 
 		 475 aa  104  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  28.63 
 
 		 665 aa  104  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  27.15 
 
 		 539 aa  105  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  28.7 
 
 		 586 aa  104  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  24.18 
 
 		 546 aa  104  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  30.08 
 
 		 281 aa  103  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  26.54 
 
 		 554 aa  103  8e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  27.22 
 
 		 528 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  24.12 
 
 		 558 aa  102  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  27.22 
 
 		 528 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  26.09 
 
 		 488 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  29.87 
 
 		 295 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  26.84 
 
 		 542 aa  99  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  29.33 
 
 		 459 aa  99  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  27.85 
 
 		 462 aa  98.2  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  26.9 
 
 		 522 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  24.67 
 
 		 548 aa  97.8  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  26.55 
 
 		 546 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  27.58 
 
 		 441 aa  97.1  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  27.22 
 
 		 415 aa  97.1  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0528  hypothetical protein  39.53 
 
 		 163 aa  96.7  9e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000114476 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0737  hypothetical protein  69.35 
 
 		 64 aa  96.3  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00205716 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  27 
 
 		 462 aa  95.5  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  25 
 
 		 537 aa  95.5  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  27.42 
 
 		 517 aa  95.9  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  28.57 
 
 		 343 aa  94.4  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  26.97 
 
 		 441 aa  94  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  26.42 
 
 		 540 aa  94  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  26.01 
 
 		 500 aa  92.8  1e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  26.69 
 
 		 564 aa  93.2  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  26.95 
 
 		 641 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  24.27 
 
 		 482 aa  91.7  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  26.02 
 
 		 489 aa  91.3  4e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  27.47 
 
 		 500 aa  90.9  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  26.69 
 
 		 445 aa  90.1  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  24.59 
 
 		 485 aa  89.7  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  28.22 
 
 		 283 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  24.35 
 
 		 447 aa  89.4  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  27.3 
 
 		 445 aa  89.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  26.01 
 
 		 580 aa  89.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  26.18 
 
 		 500 aa  89.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  29.97 
 
 		 272 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  26.98 
 
 		 445 aa  89  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  23.9 
 
 		 565 aa  88.2  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  23.98 
 
 		 509 aa  88.2  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2176  site-specific recombinase, putative  24.48 
 
 		 612 aa  87.8  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  26.1 
 
 		 562 aa  87.8  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>