More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0190 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  100 
 
 
537 aa  1094    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  40.13 
 
 
475 aa  329  6e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  30 
 
 
539 aa  210  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  32.15 
 
 
498 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  27.36 
 
 
541 aa  192  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  28.65 
 
 
550 aa  191  2.9999999999999997e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3285  Recombinase  26.91 
 
 
554 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2176  site-specific recombinase, putative  26.54 
 
 
612 aa  170  6e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  26.83 
 
 
551 aa  168  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  26.67 
 
 
479 aa  146  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  26.73 
 
 
487 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  28.14 
 
 
516 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  27.87 
 
 
516 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  25.25 
 
 
488 aa  134  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  24.18 
 
 
547 aa  130  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  25.29 
 
 
522 aa  126  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  24.2 
 
 
522 aa  124  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  25.48 
 
 
534 aa  124  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  24.85 
 
 
506 aa  123  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  24.22 
 
 
519 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  23.66 
 
 
519 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  25.3 
 
 
526 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  23.75 
 
 
606 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  23.75 
 
 
606 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  25.15 
 
 
517 aa  120  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  24.8 
 
 
542 aa  118  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  24.8 
 
 
542 aa  117  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  24.8 
 
 
542 aa  117  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  23.4 
 
 
521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  25.11 
 
 
485 aa  114  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08120  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  31.37 
 
 
274 aa  114  5e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  normal  0.202082 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  26.1 
 
 
494 aa  111  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  24.06 
 
 
462 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  23.71 
 
 
520 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  25.93 
 
 
522 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  26.72 
 
 
523 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  25.4 
 
 
523 aa  110  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  22.76 
 
 
546 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  25.13 
 
 
515 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  23.99 
 
 
475 aa  108  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  26.25 
 
 
484 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  25.65 
 
 
429 aa  107  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  27.74 
 
 
515 aa  107  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  26.65 
 
 
523 aa  107  6e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  26.25 
 
 
484 aa  106  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  24.67 
 
 
415 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  24.6 
 
 
523 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  26.1 
 
 
442 aa  104  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  23.15 
 
 
553 aa  104  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  25.14 
 
 
496 aa  103  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  25.13 
 
 
521 aa  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  23.98 
 
 
543 aa  103  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  26.57 
 
 
522 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  23.82 
 
 
535 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  24.73 
 
 
517 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  23.54 
 
 
613 aa  100  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  27.98 
 
 
511 aa  99.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  26.67 
 
 
504 aa  99.8  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  27.14 
 
 
549 aa  99  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  25.32 
 
 
534 aa  98.6  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  25.35 
 
 
558 aa  98.2  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  23.18 
 
 
534 aa  98.2  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  23.44 
 
 
534 aa  97.8  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  26.65 
 
 
522 aa  97.8  5e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  25.46 
 
 
535 aa  96.3  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 
518 aa  95.5  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3310  recombinase family  25 
 
 
501 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.19852  hitchhiker  0.000000416205 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  24.04 
 
 
504 aa  95.5  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  25.65 
 
 
526 aa  95.5  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  25.76 
 
 
431 aa  95.9  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  23.18 
 
 
534 aa  95.9  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  22.92 
 
 
534 aa  95.1  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  22.92 
 
 
534 aa  95.1  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  22.66 
 
 
537 aa  94  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  25 
 
 
569 aa  93.2  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  24.32 
 
 
546 aa  92.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  22.66 
 
 
534 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  21.56 
 
 
513 aa  92.4  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  24.41 
 
 
565 aa  92  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  22.92 
 
 
537 aa  91.7  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  23.73 
 
 
586 aa  91.3  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  25.48 
 
 
541 aa  90.5  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  27.27 
 
 
558 aa  90.1  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  23.53 
 
 
524 aa  89.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  25 
 
 
505 aa  89.4  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  25.87 
 
 
474 aa  89  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1501  hypothetical protein  26.52 
 
 
512 aa  88.2  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.420622  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  24.78 
 
 
578 aa  88.6  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  23.84 
 
 
537 aa  87.4  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  24.07 
 
 
430 aa  87  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  22.31 
 
 
510 aa  84.3  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  24.48 
 
 
552 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  21.75 
 
 
525 aa  84.3  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  21.75 
 
 
525 aa  84  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  21.12 
 
 
528 aa  84  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  21.12 
 
 
528 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  21.52 
 
 
506 aa  83.6  0.000000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  24.7 
 
 
578 aa  83.6  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  24.7 
 
 
601 aa  83.2  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  21.28 
 
 
551 aa  82.4  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>