More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3989 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  66.39 
 
 		 665 aa  763    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  100 
 
 		 613 aa  1244    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  51.6 
 
 		 546 aa  490  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  41.32 
 
 		 509 aa  341  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  31.81 
 
 		 525 aa  217  5e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  31.88 
 
 		 525 aa  213  9e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  28.22 
 
 		 515 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  29.89 
 
 		 521 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  34.56 
 
 		 511 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  33.25 
 
 		 445 aa  194  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  32.87 
 
 		 527 aa  194  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  32.16 
 
 		 528 aa  193  8e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  32.16 
 
 		 528 aa  193  9e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  32.99 
 
 		 445 aa  192  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  30.32 
 
 		 462 aa  191  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  34.1 
 
 		 447 aa  190  5.999999999999999e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  32.6 
 
 		 542 aa  190  8e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  32.74 
 
 		 445 aa  190  8e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  32.6 
 
 		 542 aa  189  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  32.6 
 
 		 542 aa  189  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  34.23 
 
 		 443 aa  189  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  34.71 
 
 		 441 aa  186  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  31.12 
 
 		 475 aa  185  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  32.81 
 
 		 525 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  34.41 
 
 		 549 aa  180  5.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  30.42 
 
 		 441 aa  177  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  30.69 
 
 		 441 aa  176  9e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  34.64 
 
 		 441 aa  176  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  33.08 
 
 		 460 aa  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  33.99 
 
 		 459 aa  170  6e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  33.98 
 
 		 445 aa  170  6e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  34.89 
 
 		 545 aa  169  9e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  34.34 
 
 		 537 aa  167  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  29.14 
 
 		 489 aa  167  5e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  36.02 
 
 		 522 aa  167  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  33.42 
 
 		 537 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  33.88 
 
 		 534 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  25.99 
 
 		 517 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  30.67 
 
 		 500 aa  165  2.0000000000000002e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  33.61 
 
 		 534 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 534 aa  166  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 534 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 534 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  32.59 
 
 		 449 aa  162  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  33.94 
 
 		 343 aa  161  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  33.06 
 
 		 534 aa  161  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  30.7 
 
 		 515 aa  161  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  36.09 
 
 		 532 aa  160  5e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  37.18 
 
 		 299 aa  160  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  32.41 
 
 		 462 aa  160  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  32.54 
 
 		 412 aa  160  8e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 510 aa  159  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  25.15 
 
 		 522 aa  159  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  31.55 
 
 		 546 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  31.34 
 
 		 568 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  32.32 
 
 		 462 aa  156  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  28.77 
 
 		 415 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  25.97 
 
 		 554 aa  155  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  35.08 
 
 		 550 aa  155  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  25.83 
 
 		 542 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  25.54 
 
 		 522 aa  150  8e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  27.44 
 
 		 544 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  28.92 
 
 		 540 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  31.56 
 
 		 474 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  32.5 
 
 		 474 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  25.97 
 
 		 522 aa  147  4.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  26.29 
 
 		 548 aa  147  6e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  35.19 
 
 		 506 aa  146  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  28.92 
 
 		 561 aa  145  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  38.28 
 
 		 281 aa  145  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  27.06 
 
 		 519 aa  143  8e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  24.9 
 
 		 547 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0913  resolvase domain-containing protein  24.65 
 
 		 554 aa  142  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.955385  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  35.14 
 
 		 421 aa  141  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  28.95 
 
 		 590 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  27.7 
 
 		 552 aa  139  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  24.64 
 
 		 534 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  29.15 
 
 		 551 aa  139  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  25.07 
 
 		 534 aa  139  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  23.03 
 
 		 558 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  24.84 
 
 		 520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  25.31 
 
 		 521 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  28.37 
 
 		 485 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  27.41 
 
 		 565 aa  135  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  25.89 
 
 		 553 aa  134  3e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  25.97 
 
 		 563 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  28.79 
 
 		 547 aa  134  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  28.24 
 
 		 506 aa  134  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  31.61 
 
 		 484 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  27.51 
 
 		 561 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  28.99 
 
 		 484 aa  128  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  26.92 
 
 		 519 aa  128  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  26.39 
 
 		 555 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  28.21 
 
 		 485 aa  127  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  24.58 
 
 		 482 aa  127  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  30.49 
 
 		 606 aa  126  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  30.49 
 
 		 606 aa  126  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0050  resolvase domain-containing protein  25.39 
 
 		 449 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0049  resolvase domain-containing protein  25.39 
 
 		 449 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  27.24 
 
 		 586 aa  125  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>