More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0594 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  100 
 
 
525 aa  1071    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  45.49 
 
 
534 aa  392  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  43.51 
 
 
525 aa  392  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  44.89 
 
 
534 aa  390  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  42.74 
 
 
511 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  45.29 
 
 
534 aa  390  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  45.29 
 
 
534 aa  388  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  45.09 
 
 
537 aa  388  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  45.09 
 
 
534 aa  387  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  44.89 
 
 
537 aa  386  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  43.71 
 
 
525 aa  382  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  44.69 
 
 
534 aa  383  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  40 
 
 
528 aa  356  5e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  39.71 
 
 
528 aa  355  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  39.8 
 
 
527 aa  347  3e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  45.62 
 
 
445 aa  343  5e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  45.36 
 
 
445 aa  341  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  44.3 
 
 
445 aa  332  8e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  48.63 
 
 
568 aa  331  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  43.44 
 
 
447 aa  330  5.0000000000000004e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  46.01 
 
 
441 aa  321  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  46.01 
 
 
441 aa  318  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  46.01 
 
 
441 aa  317  3e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  49.58 
 
 
522 aa  317  4e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  44.33 
 
 
445 aa  311  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  43.44 
 
 
459 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  41.03 
 
 
449 aa  304  3.0000000000000004e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  46.56 
 
 
506 aa  301  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  43.98 
 
 
443 aa  300  3e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  47.29 
 
 
545 aa  300  5e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  42.89 
 
 
462 aa  298  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  47.26 
 
 
532 aa  297  2e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  43.24 
 
 
549 aa  298  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  41.94 
 
 
441 aa  297  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  43.31 
 
 
462 aa  296  8e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  46.61 
 
 
550 aa  296  9e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  44.05 
 
 
460 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  45.1 
 
 
343 aa  278  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  44.1 
 
 
474 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  42.91 
 
 
299 aa  232  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  39.89 
 
 
412 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  30.23 
 
 
544 aa  227  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  32.5 
 
 
489 aa  217  4e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  32.67 
 
 
500 aa  215  1.9999999999999998e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  29.09 
 
 
546 aa  186  8e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  32.81 
 
 
613 aa  182  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  31.19 
 
 
665 aa  178  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  30.38 
 
 
475 aa  168  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  30.18 
 
 
462 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  25.95 
 
 
546 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1125  recombinase  34.41 
 
 
322 aa  154  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0324535  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0913  resolvase domain-containing protein  24.95 
 
 
554 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.955385  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  23.72 
 
 
515 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  24.45 
 
 
534 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  22.39 
 
 
521 aa  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  25 
 
 
552 aa  144  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  30.44 
 
 
515 aa  142  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  22.78 
 
 
522 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  24.82 
 
 
500 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  28.61 
 
 
542 aa  130  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  28.61 
 
 
542 aa  130  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  28.61 
 
 
542 aa  130  6e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  28.49 
 
 
531 aa  129  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  26.36 
 
 
509 aa  127  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  25.06 
 
 
421 aa  127  6e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  31.25 
 
 
485 aa  127  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  25.18 
 
 
415 aa  126  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  26.83 
 
 
743 aa  125  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  28.6 
 
 
484 aa  123  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  30.95 
 
 
484 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  27.86 
 
 
547 aa  120  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  25.15 
 
 
485 aa  118  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  26.01 
 
 
590 aa  118  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  28.09 
 
 
561 aa  118  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  27.19 
 
 
474 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1608  putative resolvase  40.68 
 
 
502 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  26.16 
 
 
494 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  25.61 
 
 
565 aa  113  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  26.4 
 
 
555 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  24.8 
 
 
540 aa  110  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  21.9 
 
 
506 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3150  Resolvase domain protein  23.59 
 
 
532 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.617817  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  25.6 
 
 
551 aa  106  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  26.34 
 
 
579 aa  106  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0051  site-specific recombinase  26.44 
 
 
513 aa  106  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169299  hitchhiker  0.000782563 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  23.57 
 
 
558 aa  103  5e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  26.81 
 
 
546 aa  102  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  38.61 
 
 
194 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  25.3 
 
 
519 aa  102  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  26.72 
 
 
523 aa  101  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  23.2 
 
 
606 aa  100  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  23.2 
 
 
606 aa  100  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  25.24 
 
 
537 aa  100  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  26.58 
 
 
523 aa  100  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  25.1 
 
 
522 aa  100  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4374  Resolvase domain  36 
 
 
216 aa  99.8  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  21.6 
 
 
548 aa  99.4  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  22.41 
 
 
542 aa  97.8  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  21.75 
 
 
554 aa  98.2  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  27.56 
 
 
555 aa  97.4  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>