More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1069 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 519 aa  1084    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  58.57 
 
 		 520 aa  652    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  58 
 
 		 521 aa  650    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  59.07 
 
 		 519 aa  667    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  56.26 
 
 		 522 aa  633  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  54.53 
 
 		 522 aa  621  1e-176  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  42.08 
 
 		 553 aa  441  9.999999999999999e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  41.59 
 
 		 526 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  39.32 
 
 		 543 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  35.51 
 
 		 523 aa  306  7e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  35.33 
 
 		 523 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  36.22 
 
 		 526 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  42.61 
 
 		 442 aa  301  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  45.89 
 
 		 429 aa  295  2e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  35.98 
 
 		 522 aa  288  2e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  35.04 
 
 		 523 aa  286  5e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  35.11 
 
 		 523 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  35.71 
 
 		 518 aa  282  1e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  34.43 
 
 		 606 aa  280  6e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  34.43 
 
 		 606 aa  280  6e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  33.71 
 
 		 535 aa  276  5e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  34.38 
 
 		 522 aa  276  5e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  39.25 
 
 		 430 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  34 
 
 		 506 aa  257  4e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  31.78 
 
 		 552 aa  254  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  41.74 
 
 		 534 aa  248  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  37.24 
 
 		 431 aa  246  8e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  36.57 
 
 		 539 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  32.16 
 
 		 547 aa  206  8e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  33.77 
 
 		 511 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0420  resolvase domain-containing protein  44.91 
 
 		 342 aa  181  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000164103  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  25.78 
 
 		 506 aa  153  8.999999999999999e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1669  DNA recombinase, putative  44.44 
 
 		 165 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0494  resolvase, N-terminal domain protein  32.11 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.177718 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  27.06 
 
 		 613 aa  143  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  25.56 
 
 		 515 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  28.22 
 
 		 498 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  25.44 
 
 		 479 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  25.12 
 
 		 665 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  29.45 
 
 		 462 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  25.64 
 
 		 522 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  30.82 
 
 		 542 aa  130  6e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  30.82 
 
 		 542 aa  130  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  30.82 
 
 		 542 aa  130  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  24.86 
 
 		 535 aa  130  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  28.29 
 
 		 415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  27.07 
 
 		 496 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  28.15 
 
 		 489 aa  126  9e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  23.24 
 
 		 487 aa  126  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  28.66 
 
 		 558 aa  124  6e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  25.49 
 
 		 524 aa  123  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  24.22 
 
 		 537 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  23.76 
 
 		 509 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  28.45 
 
 		 521 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  27.74 
 
 		 546 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  27.16 
 
 		 445 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  25.15 
 
 		 525 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  26.92 
 
 		 445 aa  120  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  24.78 
 
 		 485 aa  118  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  26.23 
 
 		 525 aa  118  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  23.14 
 
 		 488 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  28.08 
 
 		 475 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  25.39 
 
 		 445 aa  116  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  26.84 
 
 		 500 aa  115  2.0000000000000002e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  24.38 
 
 		 475 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  24.47 
 
 		 515 aa  113  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  24.6 
 
 		 484 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  25.57 
 
 		 516 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  24.18 
 
 		 500 aa  110  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  24.14 
 
 		 494 aa  109  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  26.63 
 
 		 484 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  25.34 
 
 		 516 aa  109  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  28.99 
 
 		 517 aa  108  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  24.45 
 
 		 500 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2730  Recombinase  27.17 
 
 		 326 aa  108  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  28.2 
 
 		 534 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  28.62 
 
 		 534 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  28.65 
 
 		 537 aa  107  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  28.2 
 
 		 534 aa  107  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  28.2 
 
 		 534 aa  107  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  28.57 
 
 		 343 aa  106  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  26.81 
 
 		 544 aa  106  9e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  27.91 
 
 		 534 aa  104  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  25.75 
 
 		 565 aa  103  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  24.32 
 
 		 447 aa  103  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  24.6 
 
 		 465 aa  103  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  24.78 
 
 		 482 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2176  site-specific recombinase, putative  23.35 
 
 		 612 aa  102  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  26.67 
 
 		 540 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  30.89 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  27.33 
 
 		 534 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  22.83 
 
 		 527 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  23.33 
 
 		 528 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  24.67 
 
 		 485 aa  102  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  23.31 
 
 		 539 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  25.74 
 
 		 541 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  28.07 
 
 		 537 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  22.99 
 
 		 546 aa  101  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  23.22 
 
 		 528 aa  101  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  28.95 
 
 		 459 aa  100  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>