More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0430 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  89.59 
 
 		 551 aa  966    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  100 
 
 		 540 aa  1113    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  63.5 
 
 		 565 aa  673    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  79.23 
 
 		 590 aa  877    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  55.84 
 
 		 579 aa  595  1e-169  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  53.54 
 
 		 561 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  52.34 
 
 		 547 aa  560  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  49.54 
 
 		 561 aa  526  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  49.54 
 
 		 555 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  45.56 
 
 		 518 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  43.02 
 
 		 537 aa  426  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3109  resolvase  54.29 
 
 		 377 aa  283  8.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  31.99 
 
 		 548 aa  242  1e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  30.89 
 
 		 542 aa  236  8e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  30.89 
 
 		 554 aa  236  8e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  33.12 
 
 		 506 aa  226  9e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  29.86 
 
 		 517 aa  218  2e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  29.25 
 
 		 510 aa  212  2e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  29.34 
 
 		 494 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  28.66 
 
 		 485 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  28.21 
 
 		 563 aa  173  9e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  28.35 
 
 		 496 aa  166  9e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0630  resolvase  38.8 
 
 		 247 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  28.92 
 
 		 613 aa  154  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  26.09 
 
 		 542 aa  150  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  26.09 
 
 		 542 aa  150  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  26.09 
 
 		 542 aa  150  7e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  27.9 
 
 		 546 aa  147  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  27.27 
 
 		 475 aa  145  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  28.12 
 
 		 546 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  28.41 
 
 		 528 aa  133  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  28.18 
 
 		 528 aa  131  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  25.73 
 
 		 521 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0097  resolvase domain-containing protein  35.64 
 
 		 211 aa  127  6e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.371309  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  27.07 
 
 		 665 aa  127  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  28.5 
 
 		 445 aa  126  8.000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3120  recombinase  46.62 
 
 		 173 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.964732  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  25.94 
 
 		 525 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  23.45 
 
 		 482 aa  124  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  23.46 
 
 		 522 aa  123  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  24.6 
 
 		 515 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  28.32 
 
 		 509 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  29.03 
 
 		 532 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  27.86 
 
 		 445 aa  120  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  24 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  25.51 
 
 		 525 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  27.56 
 
 		 534 aa  118  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  28.14 
 
 		 537 aa  117  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  27.11 
 
 		 534 aa  116  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  27.25 
 
 		 441 aa  116  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  27.91 
 
 		 534 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  26.52 
 
 		 441 aa  116  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  26.99 
 
 		 441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  27.88 
 
 		 534 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  26.87 
 
 		 534 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  27.59 
 
 		 443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  27.39 
 
 		 445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  24.73 
 
 		 539 aa  114  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1430  Resolvase domain protein  27.92 
 
 		 607 aa  114  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  26.9 
 
 		 534 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  25.83 
 
 		 447 aa  113  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  27.32 
 
 		 555 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  27.32 
 
 		 550 aa  110  5e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  27.47 
 
 		 429 aa  110  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  24.8 
 
 		 525 aa  110  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5028  hypothetical protein  41.4 
 
 		 185 aa  110  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.284216  normal  0.520699 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  27.16 
 
 		 504 aa  109  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  26.53 
 
 		 460 aa  109  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  26.84 
 
 		 527 aa  109  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  27.44 
 
 		 537 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  25.68 
 
 		 462 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2057  Resolvase domain protein  27.73 
 
 		 582 aa  109  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0536001  normal  0.0182288 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0845  Resolvase domain protein  30.13 
 
 		 252 aa  106  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000678199  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  26.37 
 
 		 449 aa  106  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  27.49 
 
 		 542 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  25.59 
 
 		 558 aa  104  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  24.07 
 
 		 498 aa  104  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  25.65 
 
 		 743 aa  103  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  27.07 
 
 		 562 aa  103  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  28.21 
 
 		 484 aa  103  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  26.61 
 
 		 519 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  23.04 
 
 		 511 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  25 
 
 		 558 aa  101  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  26.2 
 
 		 564 aa  100  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  27.97 
 
 		 484 aa  100  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  27.06 
 
 		 542 aa  100  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  26.92 
 
 		 565 aa  99.8  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  22.33 
 
 		 544 aa  99  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  24.54 
 
 		 519 aa  98.6  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  22.59 
 
 		 535 aa  98.2  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  24.72 
 
 		 641 aa  97.4  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  23.67 
 
 		 541 aa  97.4  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  24.23 
 
 		 459 aa  97.1  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  25.33 
 
 		 551 aa  97.1  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3036  recombinase  28.43 
 
 		 548 aa  97.1  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  27.77 
 
 		 515 aa  96.7  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  26.18 
 
 		 540 aa  96.3  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  26.33 
 
 		 522 aa  95.5  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  25.27 
 
 		 578 aa  95.5  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  25.13 
 
 		 505 aa  94.7  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>