More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2432 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 281 aa  569  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  54.26 
 
 		 295 aa  292  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  54.8 
 
 		 283 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  41.22 
 
 		 665 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  37.45 
 
 		 613 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  32.45 
 
 		 521 aa  138  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  30.68 
 
 		 542 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  30.68 
 
 		 542 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  30.3 
 
 		 542 aa  127  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  33.46 
 
 		 462 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  31.11 
 
 		 546 aa  125  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  29.91 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  36.17 
 
 		 546 aa  119  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  32.05 
 
 		 515 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  28.87 
 
 		 522 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  30.34 
 
 		 475 aa  112  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  31.82 
 
 		 522 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  29.55 
 
 		 522 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  33.73 
 
 		 509 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  29.28 
 
 		 415 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  36.44 
 
 		 513 aa  106  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  30.04 
 
 		 558 aa  105  6e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  35.93 
 
 		 525 aa  105  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  35.93 
 
 		 525 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  30.08 
 
 		 518 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  28.05 
 
 		 523 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0738  resolvase domain-containing protein  31.73 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0136169  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  33.46 
 
 		 515 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  31.06 
 
 		 522 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  32.78 
 
 		 441 aa  102  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  27.24 
 
 		 523 aa  102  9e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  36.16 
 
 		 462 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  31.99 
 
 		 511 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  35.71 
 
 		 462 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  27.59 
 
 		 523 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  32.03 
 
 		 429 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  31.8 
 
 		 537 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  30.64 
 
 		 522 aa  100  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  27.57 
 
 		 526 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  31.32 
 
 		 534 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  27.24 
 
 		 523 aa  99.4  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  31.45 
 
 		 537 aa  98.6  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  35.05 
 
 		 343 aa  99  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  28.93 
 
 		 506 aa  98.2  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3067  resolvase  30.08 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00040652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  31.82 
 
 		 484 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  31.45 
 
 		 534 aa  97.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  31.1 
 
 		 534 aa  97.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  27.49 
 
 		 543 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  30.74 
 
 		 534 aa  97.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  31.45 
 
 		 534 aa  97.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  31.12 
 
 		 534 aa  97.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  31.82 
 
 		 484 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  30.83 
 
 		 443 aa  97.1  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2222  putative site-specific recombinase, resolvase family  30.26 
 
 		 261 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.61199e-51 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  30.08 
 
 		 517 aa  96.7  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  31.02 
 
 		 485 aa  96.3  5e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  30.24 
 
 		 547 aa  96.3  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  28.86 
 
 		 494 aa  95.9  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  28.78 
 
 		 519 aa  95.5  8e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  26.94 
 
 		 580 aa  95.5  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  29.8 
 
 		 521 aa  95.5  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  32.03 
 
 		 568 aa  94.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3757  Resolvase domain protein  32.94 
 
 		 341 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  27.47 
 
 		 535 aa  94  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2033  resolvase domain-containing protein  31.17 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  29.73 
 
 		 430 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  29.39 
 
 		 520 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1994  resolvase  31.17 
 
 		 261 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.854383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1857  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  31.33 
 
 		 488 aa  92  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830217  decreased coverage  0.0036727 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  32.22 
 
 		 545 aa  92  9e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2045  resolvase family site-specific recombinase  29.72 
 
 		 260 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  32.52 
 
 		 550 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  27.12 
 
 		 526 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2201  resolvase family site-specific recombinase  29.72 
 
 		 260 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  32.11 
 
 		 549 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  28.78 
 
 		 534 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  31.78 
 
 		 441 aa  90.9  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  30.34 
 
 		 460 aa  90.1  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  27.19 
 
 		 442 aa  90.1  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  27.13 
 
 		 482 aa  90.1  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  33.33 
 
 		 459 aa  89  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  32.73 
 
 		 380 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  30.69 
 
 		 506 aa  89.4  7e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  28.45 
 
 		 431 aa  89  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3978  resolvase domain-containing protein  27.55 
 
 		 258 aa  89  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  31.02 
 
 		 540 aa  88.6  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  29.39 
 
 		 449 aa  88.6  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  27.23 
 
 		 553 aa  88.6  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3904  Resolvase domain protein  29.87 
 
 		 460 aa  88.2  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  30.41 
 
 		 445 aa  88.2  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  27.35 
 
 		 504 aa  88.6  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  28.76 
 
 		 500 aa  87.8  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1941  putative site-specific recombinase, resolvase family  28.36 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.292978  normal  0.0530197 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5600  DNA recombinase, putative, truncation  27.17 
 
 		 282 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1452  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7041  hypothetical protein  34.88 
 
 		 224 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.414192 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  31.44 
 
 		 522 aa  87.8  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  27.17 
 
 		 552 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  33.05 
 
 		 445 aa  86.7  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  25.28 
 
 		 558 aa  86.7  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>