258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3904 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3904  Resolvase domain protein  100 
 
 		 460 aa  947    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1448  recombinase  36.32 
 
 		 467 aa  290  4e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3816  recombinase  36.13 
 
 		 469 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3890  recombinase  36.13 
 
 		 469 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4299  recombinase  36.13 
 
 		 469 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347806  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1857  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  35.24 
 
 		 488 aa  256  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830217  decreased coverage  0.0036727 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  32.54 
 
 		 460 aa  231  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3518  recombinase  32.53 
 
 		 460 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0489876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3591  recombinase  32.31 
 
 		 460 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2519  Resolvase domain protein  34.7 
 
 		 494 aa  220  3.9999999999999997e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3568  Resolvase domain protein  34.31 
 
 		 484 aa  208  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  30.26 
 
 		 479 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  30.26 
 
 		 479 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4166  recombinase  31.62 
 
 		 460 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167071  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1234  Resolvase domain protein  29.72 
 
 		 467 aa  178  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0615  Resolvase domain protein  29.32 
 
 		 461 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  30.07 
 
 		 465 aa  169  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20310  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  30.43 
 
 		 458 aa  156  9e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0744834  normal  0.198251 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06210  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29.19 
 
 		 458 aa  144  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2721  recombinase  26.03 
 
 		 500 aa  127  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.79843 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07990  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  25.57 
 
 		 529 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2373  recombinase  27.71 
 
 		 497 aa  113  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0393  recombinase  25.2 
 
 		 522 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26050  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  24.8 
 
 		 511 aa  109  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6293  recombinase  27.61 
 
 		 385 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  26.76 
 
 		 475 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  26.02 
 
 		 421 aa  106  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1974  Resolvase domain protein  26.61 
 
 		 503 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665076  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  23.94 
 
 		 462 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4124  recombinase  27.42 
 
 		 432 aa  100  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  25.28 
 
 		 272 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2051  resolvase domain-containing protein  21.59 
 
 		 494 aa  98.2  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4207  Recombinase  24.17 
 
 		 506 aa  97.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0141412 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20360  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  25.49 
 
 		 539 aa  94  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872003  normal  0.144817 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2529  recombinase  24.53 
 
 		 501 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20150  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  25.21 
 
 		 569 aa  89  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.339427  normal  0.32342 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  29.87 
 
 		 281 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  22.01 
 
 		 558 aa  87.8  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  25.17 
 
 		 546 aa  86.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  25 
 
 		 550 aa  85.5  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 555 aa  85.9  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  25.23 
 
 		 485 aa  82.4  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  24.92 
 
 		 517 aa  82.4  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  22.7 
 
 		 500 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2591  Resolvase domain protein  24.08 
 
 		 490 aa  82  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0023015  hitchhiker  0.000000886482 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  20.85 
 
 		 519 aa  81.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  27.27 
 
 		 544 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  20.39 
 
 		 521 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  21.04 
 
 		 520 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2551  recombinase  24.18 
 
 		 412 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  26.32 
 
 		 500 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  24.25 
 
 		 447 aa  79.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  24.37 
 
 		 485 aa  79  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  21.19 
 
 		 542 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  21.19 
 
 		 542 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  26.3 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  22.22 
 
 		 500 aa  77.8  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  21.19 
 
 		 542 aa  77.4  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  21.54 
 
 		 519 aa  75.5  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  21.41 
 
 		 522 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  21.5 
 
 		 488 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  21.97 
 
 		 553 aa  73.9  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  23.62 
 
 		 522 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  21.01 
 
 		 526 aa  73.2  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3963  recombinase  24.68 
 
 		 493 aa  73.2  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  25.52 
 
 		 552 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  25.43 
 
 		 613 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  23.62 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  19.59 
 
 		 498 aa  73.2  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  22.04 
 
 		 482 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2057  Resolvase domain protein  25.79 
 
 		 582 aa  72  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0536001  normal  0.0182288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  24.01 
 
 		 534 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  24.01 
 
 		 537 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  20.85 
 
 		 535 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  24.34 
 
 		 534 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  27.73 
 
 		 665 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  21.94 
 
 		 526 aa  71.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  24.38 
 
 		 550 aa  70.9  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  24.01 
 
 		 534 aa  70.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2571  recombinase  24.93 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  22.78 
 
 		 558 aa  70.5  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  24.01 
 
 		 534 aa  70.5  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  23.81 
 
 		 515 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  24.01 
 
 		 534 aa  70.1  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  22.98 
 
 		 510 aa  69.3  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  26.74 
 
 		 546 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  24.41 
 
 		 474 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1907  Recombinase  25.08 
 
 		 452 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  23.93 
 
 		 534 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  21.04 
 
 		 487 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  20.2 
 
 		 522 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  24.74 
 
 		 489 aa  67.8  0.0000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  27.39 
 
 		 531 aa  68.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  23.93 
 
 		 537 aa  68.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  19.87 
 
 		 522 aa  67.4  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4086  hypothetical protein  27.91 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0913  resolvase domain-containing protein  26.78 
 
 		 554 aa  67  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.955385  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0231  resolvase domain-containing protein  23.31 
 
 		 519 aa  67  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.829739  normal  0.106092 
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  21.84 
 
 		 554 aa  66.6  0.0000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  21.84 
 
 		 542 aa  66.2  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>