More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1527 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  100 
 
 
431 aa  895    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  62.53 
 
 
552 aa  518  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  55.96 
 
 
535 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  52.19 
 
 
523 aa  422  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  51.93 
 
 
523 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  51.55 
 
 
522 aa  415  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  49 
 
 
522 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  51.12 
 
 
523 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  51.12 
 
 
523 aa  401  9.999999999999999e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  50.39 
 
 
518 aa  392  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  47.24 
 
 
539 aa  371  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  47.28 
 
 
442 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  47.59 
 
 
430 aa  317  4e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  42.86 
 
 
506 aa  310  4e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  41.88 
 
 
429 aa  293  4e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  40.94 
 
 
606 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  40.94 
 
 
606 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  40.87 
 
 
543 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  40.05 
 
 
526 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  40.71 
 
 
519 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  39.47 
 
 
522 aa  248  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  37.24 
 
 
519 aa  246  6.999999999999999e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  40.23 
 
 
520 aa  246  8e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  39.47 
 
 
522 aa  245  9.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  40.36 
 
 
521 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  37.04 
 
 
534 aa  243  7e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  39.48 
 
 
553 aa  238  2e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  38.69 
 
 
526 aa  224  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0420  resolvase domain-containing protein  50 
 
 
342 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000164103  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  35.5 
 
 
547 aa  193  6e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  35.14 
 
 
511 aa  168  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0494  resolvase, N-terminal domain protein  33.67 
 
 
321 aa  155  9e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.177718 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2698  hypothetical protein  41.72 
 
 
194 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  31.71 
 
 
506 aa  119  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  25.98 
 
 
613 aa  114  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  29.62 
 
 
498 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  26.12 
 
 
462 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  27.24 
 
 
535 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  27.52 
 
 
665 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  28.38 
 
 
558 aa  108  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  28.29 
 
 
496 aa  107  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  27.07 
 
 
542 aa  102  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  27.07 
 
 
542 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  27.07 
 
 
542 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  26.93 
 
 
521 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  28.57 
 
 
515 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  27.37 
 
 
525 aa  100  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  28.37 
 
 
525 aa  99.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  28.7 
 
 
485 aa  98.2  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  27.91 
 
 
586 aa  97.4  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  25.25 
 
 
562 aa  96.3  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  26.27 
 
 
479 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  29.29 
 
 
500 aa  95.5  1e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  25.76 
 
 
537 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4059  Resolvase domain  25.89 
 
 
862 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932376  normal  0.13959 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  29.57 
 
 
494 aa  93.6  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  28.93 
 
 
489 aa  93.2  8e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  25.3 
 
 
513 aa  92.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  25.55 
 
 
546 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  27.71 
 
 
522 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0528  hypothetical protein  38.19 
 
 
163 aa  90.9  4e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000114476 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2730  Recombinase  25.96 
 
 
326 aa  90.5  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  27.39 
 
 
415 aa  89.7  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  24.15 
 
 
546 aa  89.4  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  26.16 
 
 
534 aa  89.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  26.24 
 
 
534 aa  89.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  28.45 
 
 
281 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  25.89 
 
 
534 aa  87.8  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  25.89 
 
 
534 aa  88.2  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3888  Recombinase  29.74 
 
 
210 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.142462 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  26.3 
 
 
511 aa  87  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  25.41 
 
 
534 aa  87  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  27.16 
 
 
475 aa  87.4  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  25.89 
 
 
534 aa  86.7  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  25.89 
 
 
537 aa  86.7  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  28.15 
 
 
525 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  25.94 
 
 
445 aa  85.1  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  26.88 
 
 
445 aa  85.1  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  24.88 
 
 
532 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  24.93 
 
 
528 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  24.74 
 
 
641 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  28.81 
 
 
537 aa  84.7  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  24.93 
 
 
528 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  25.95 
 
 
522 aa  84.3  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  26.3 
 
 
445 aa  84.3  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  25.52 
 
 
527 aa  84  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4299  recombinase  26.15 
 
 
469 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347806  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3816  recombinase  26.15 
 
 
469 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3890  recombinase  26.15 
 
 
469 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  29.49 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  26.06 
 
 
539 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  23.94 
 
 
541 aa  82.4  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  28.57 
 
 
550 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4607  resolvase-like protein  24.4 
 
 
476 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  29.31 
 
 
545 aa  81.6  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  24.34 
 
 
515 aa  81.3  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  24.54 
 
 
738 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  25.06 
 
 
441 aa  80.9  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  25.5 
 
 
555 aa  80.9  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  23.6 
 
 
565 aa  80.5  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>