74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0528 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0528  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  328  2e-89  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000114476 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0494  resolvase, N-terminal domain protein  90.23 
 
 		 321 aa  245  2e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.177718 
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  39.84 
 
 		 518 aa  97.1  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  39.13 
 
 		 442 aa  95.5  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  39.84 
 
 		 552 aa  94  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  39.45 
 
 		 539 aa  94  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  39.45 
 
 		 521 aa  93.2  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  39.45 
 
 		 520 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  39.13 
 
 		 430 aa  92.8  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  38.19 
 
 		 431 aa  92  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  36.72 
 
 		 522 aa  89.7  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  37.96 
 
 		 519 aa  89.4  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  35.16 
 
 		 523 aa  88.2  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  37.39 
 
 		 543 aa  87.8  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  37.3 
 
 		 526 aa  87.8  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  35.94 
 
 		 522 aa  87.4  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  35.16 
 
 		 523 aa  86.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  34.62 
 
 		 429 aa  85.9  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  35.66 
 
 		 523 aa  85.1  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  34.88 
 
 		 523 aa  85.1  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  36.36 
 
 		 526 aa  84.3  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  35.11 
 
 		 519 aa  83.6  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  37.39 
 
 		 535 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  36.11 
 
 		 522 aa  82  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  38.18 
 
 		 534 aa  81.6  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  34.21 
 
 		 606 aa  81.6  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  34.21 
 
 		 606 aa  81.6  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  35.65 
 
 		 506 aa  80.5  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  35.19 
 
 		 522 aa  79.3  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0420  resolvase domain-containing protein  36.45 
 
 		 342 aa  77.4  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000164103  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  32.73 
 
 		 547 aa  68.6  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  30.28 
 
 		 553 aa  65.5  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0728  hypothetical protein  87.88 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00271301 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0737  hypothetical protein  41.38 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00205716 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  28.23 
 
 		 511 aa  54.3  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  29.31 
 
 		 539 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  28.68 
 
 		 195 aa  52  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4205  resolvase domain protein  26.15 
 
 		 525 aa  50.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2572  resolvase domain protein  26.15 
 
 		 539 aa  49.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  26.83 
 
 		 462 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  29.06 
 
 		 281 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3000  resolvase domain protein  31.52 
 
 		 549 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1467  resolvase-like protein  30.86 
 
 		 196 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  26.32 
 
 		 558 aa  45.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2176  site-specific recombinase, putative  27.01 
 
 		 612 aa  45.1  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  24.74 
 
 		 546 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0545  hypothetical protein  31.73 
 
 		 186 aa  44.7  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0606652 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  23.48 
 
 		 613 aa  44.7  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2975  resolvase domain-containing protein  25.26 
 
 		 516 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.539501  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4272  resolvase-like protein  25.56 
 
 		 149 aa  44.3  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  33.33 
 
 		 181 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  31.96 
 
 		 185 aa  44.3  0.0008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  19.79 
 
 		 542 aa  42.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  19.79 
 
 		 542 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  19.79 
 
 		 542 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  26.83 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  26.83 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3523  resolvase domain protein  25.38 
 
 		 568 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.876485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  30.34 
 
 		 185 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 183 aa  42.4  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4059  Resolvase domain  21.3 
 
 		 862 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932376  normal  0.13959 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  25.29 
 
 		 494 aa  41.6  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  28.4 
 
 		 195 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  29.29 
 
 		 199 aa  42  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  30 
 
 		 184 aa  41.6  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  22.12 
 
 		 665 aa  41.6  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  26.98 
 
 		 193 aa  41.2  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  31.67 
 
 		 196 aa  41.2  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2721  recombinase  27.78 
 
 		 500 aa  41.2  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.79843 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  33.33 
 
 		 183 aa  41.2  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  30 
 
 		 201 aa  41.2  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  31.67 
 
 		 196 aa  41.2  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  27.36 
 
 		 192 aa  41.2  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  28.83 
 
 		 561 aa  40.4  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>