282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2975 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2975  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
516 aa  1072    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.539501  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3523  resolvase domain protein  37.94 
 
 
568 aa  362  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.876485  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2572  resolvase domain protein  38.12 
 
 
539 aa  360  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4205  resolvase domain protein  38.42 
 
 
525 aa  358  9.999999999999999e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0051  site-specific recombinase  31.87 
 
 
513 aa  259  9e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169299  hitchhiker  0.000782563 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  28.89 
 
 
542 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  28.89 
 
 
542 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  28.89 
 
 
542 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3000  resolvase domain protein  24.4 
 
 
549 aa  129  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2949  site-specific recombinase  23.06 
 
 
479 aa  109  9.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000000764647  unclonable  0.00000628307 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  27.5 
 
 
546 aa  108  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  26.79 
 
 
462 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  30.11 
 
 
521 aa  107  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  26.09 
 
 
546 aa  104  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  27.91 
 
 
558 aa  104  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  26.11 
 
 
613 aa  103  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  28.05 
 
 
515 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1250  resolvase  24.09 
 
 
524 aa  99.8  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  26.81 
 
 
665 aa  99.8  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  25.23 
 
 
522 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  26.61 
 
 
474 aa  95.9  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  25.89 
 
 
415 aa  95.5  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  24.72 
 
 
445 aa  95.9  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6320  resolvase domain protein  23.5 
 
 
553 aa  94  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  25.53 
 
 
445 aa  94  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  25.15 
 
 
445 aa  92.4  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  25.3 
 
 
510 aa  91.7  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0737  resolvase  23.83 
 
 
542 aa  90.5  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0547783  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  28.88 
 
 
544 aa  89.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  26.04 
 
 
528 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  26.33 
 
 
528 aa  89.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  26.67 
 
 
504 aa  89  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3805  resolvase-like protein  23.02 
 
 
526 aa  88.2  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296715  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2997  resolvase domain-containing protein  28.75 
 
 
444 aa  87.8  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2057  Resolvase domain protein  26.3 
 
 
582 aa  87.8  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0536001  normal  0.0182288 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  25.15 
 
 
517 aa  87  7e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  26.27 
 
 
509 aa  86.7  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3963  recombinase  24.68 
 
 
493 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  29.33 
 
 
743 aa  84.7  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  27.08 
 
 
515 aa  84.7  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  25.84 
 
 
525 aa  84.3  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  25.74 
 
 
484 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  26.2 
 
 
484 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  22.06 
 
 
532 aa  82  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  24.46 
 
 
441 aa  81.6  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  27.8 
 
 
475 aa  81.3  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  24.31 
 
 
519 aa  80.9  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5133  Resolvase domain  22.38 
 
 
539 aa  80.1  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.880179 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  24.85 
 
 
343 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  24.61 
 
 
531 aa  79  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  25.62 
 
 
548 aa  78.2  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  25.23 
 
 
521 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  25.3 
 
 
447 aa  77.8  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  25.7 
 
 
545 aa  77.8  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  24.84 
 
 
485 aa  77.4  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  24.18 
 
 
441 aa  77.4  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  27.84 
 
 
506 aa  77  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  26.47 
 
 
542 aa  75.5  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  26.47 
 
 
554 aa  75.5  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  23.8 
 
 
520 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  24.33 
 
 
558 aa  75.1  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  23.96 
 
 
550 aa  74.7  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  23.96 
 
 
555 aa  74.3  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  23.22 
 
 
441 aa  73.6  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  23.56 
 
 
537 aa  72.8  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  25.88 
 
 
295 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  26.35 
 
 
482 aa  72  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  23.03 
 
 
459 aa  71.2  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  23.22 
 
 
460 aa  71.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  25.07 
 
 
561 aa  71.2  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  24.75 
 
 
500 aa  70.9  0.00000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  24.33 
 
 
527 aa  70.9  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  24.68 
 
 
498 aa  70.9  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  24.62 
 
 
522 aa  70.1  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  23.51 
 
 
412 aa  70.1  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  23.18 
 
 
552 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  22.2 
 
 
443 aa  70.1  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  27.44 
 
 
494 aa  69.7  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  23.1 
 
 
462 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  23.71 
 
 
462 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  23.19 
 
 
525 aa  67.4  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  23.04 
 
 
641 aa  67  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  26.74 
 
 
281 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  24.56 
 
 
522 aa  65.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  22.9 
 
 
525 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  22.75 
 
 
546 aa  65.1  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  22.66 
 
 
449 aa  65.1  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  22.48 
 
 
489 aa  64.3  0.000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  25.53 
 
 
496 aa  64.7  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  25.81 
 
 
299 aa  64.3  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  24.47 
 
 
540 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  28.51 
 
 
513 aa  63.2  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  25.36 
 
 
522 aa  62.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  23.7 
 
 
534 aa  62  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0248  resolvase domain-containing protein  25.14 
 
 
524 aa  62  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000541084  hitchhiker  0.00459613 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0097  resolvase domain-containing protein  31.4 
 
 
211 aa  61.6  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.371309  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  23.4 
 
 
563 aa  62  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2577  Resolvase domain protein  24.58 
 
 
603 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.551292 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  23.56 
 
 
511 aa  61.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  22.97 
 
 
549 aa  61.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>