272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4059 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4059  Resolvase domain  100 
 
 		 862 aa  1743    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932376  normal  0.13959 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  26.39 
 
 		 738 aa  140  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0980  Resolvase domain  27.68 
 
 		 707 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0578275 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  27.67 
 
 		 537 aa  128  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  27.18 
 
 		 569 aa  113  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  27.4 
 
 		 578 aa  113  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  27.78 
 
 		 564 aa  111  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  24.67 
 
 		 541 aa  109  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  26.48 
 
 		 597 aa  107  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  26.52 
 
 		 562 aa  103  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  25.58 
 
 		 626 aa  102  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  25.1 
 
 		 494 aa  100  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  26.43 
 
 		 565 aa  100  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  25.72 
 
 		 601 aa  100  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  25.72 
 
 		 578 aa  99.8  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  27.19 
 
 		 540 aa  97.8  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  25.89 
 
 		 431 aa  95.5  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  27.97 
 
 		 549 aa  95.1  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  24.19 
 
 		 522 aa  94  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2219  recombinase  27.01 
 
 		 558 aa  93.2  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338837  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  26.26 
 
 		 564 aa  93.2  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  25.9 
 
 		 552 aa  93.2  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  24.91 
 
 		 549 aa  92  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  24.78 
 
 		 551 aa  92  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37130  Recombinase  27.42 
 
 		 520 aa  91.7  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  25.75 
 
 		 552 aa  91.3  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  26 
 
 		 539 aa  89.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  26 
 
 		 546 aa  89.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  24.4 
 
 		 576 aa  87.4  9e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  24.89 
 
 		 662 aa  86.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  22.88 
 
 		 522 aa  85.5  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  25.96 
 
 		 542 aa  84.7  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  24.17 
 
 		 485 aa  83.6  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  24.09 
 
 		 584 aa  83.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  24.82 
 
 		 558 aa  82  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  25.05 
 
 		 546 aa  81.6  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  26.99 
 
 		 513 aa  81.3  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  24.27 
 
 		 542 aa  80.9  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  21.62 
 
 		 518 aa  80.9  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0494  resolvase, N-terminal domain protein  25.75 
 
 		 321 aa  80.9  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.177718 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  27.51 
 
 		 546 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  27.39 
 
 		 442 aa  79.3  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  25.59 
 
 		 526 aa  78.6  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  21.54 
 
 		 523 aa  77.8  0.0000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  25.05 
 
 		 613 aa  77.4  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  20.91 
 
 		 542 aa  77.4  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  24.83 
 
 		 506 aa  77  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  20.91 
 
 		 542 aa  77.4  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  20.91 
 
 		 542 aa  76.6  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  26.4 
 
 		 506 aa  75.9  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  21.57 
 
 		 535 aa  75.1  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  21.87 
 
 		 519 aa  75.1  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  22.65 
 
 		 515 aa  75.1  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  29.05 
 
 		 515 aa  74.7  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  27.36 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  22.35 
 
 		 523 aa  74.3  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  21.77 
 
 		 553 aa  74.3  0.000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1759  Resolvase domain  30.09 
 
 		 251 aa  74.3  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.621745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  21.32 
 
 		 523 aa  73.2  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  23.54 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  22.67 
 
 		 523 aa  72  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  30.2 
 
 		 665 aa  71.2  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  24.59 
 
 		 522 aa  71.2  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  26.64 
 
 		 521 aa  71.2  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  26.6 
 
 		 504 aa  70.9  0.00000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  21.12 
 
 		 520 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  25.33 
 
 		 484 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  25.31 
 
 		 558 aa  69.3  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  24.92 
 
 		 482 aa  68.6  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  25.33 
 
 		 484 aa  68.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  25.08 
 
 		 462 aa  67.8  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  22.93 
 
 		 519 aa  67.8  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  22.84 
 
 		 521 aa  67.8  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  20.7 
 
 		 522 aa  67.4  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3501  recombinase  28.57 
 
 		 523 aa  66.6  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  23.32 
 
 		 543 aa  66.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0979  Resolvase domain  24.86 
 
 		 678 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.127172 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  26.89 
 
 		 505 aa  66.2  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3812  recombinase  28.57 
 
 		 523 aa  65.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3843  Resolvase domain  23.24 
 
 		 707 aa  65.9  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2577  Resolvase domain protein  22.66 
 
 		 603 aa  64.7  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.551292 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  22.61 
 
 		 586 aa  64.3  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  21.43 
 
 		 511 aa  64.3  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  25.97 
 
 		 475 aa  63.9  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  21.31 
 
 		 547 aa  63.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  23.19 
 
 		 539 aa  62.4  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  21.45 
 
 		 526 aa  62  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  21.88 
 
 		 534 aa  61.2  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  22.58 
 
 		 606 aa  61.2  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  22.58 
 
 		 606 aa  61.2  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0854  DNA recombinase, putative  25.6 
 
 		 543 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000136603 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0850  DNA recombinase, putative  25.6 
 
 		 543 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  22.54 
 
 		 524 aa  58.9  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1857  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  26.58 
 
 		 488 aa  58.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830217  decreased coverage  0.0036727 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  21.6 
 
 		 552 aa  58.5  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  21.15 
 
 		 539 aa  58.2  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  23.49 
 
 		 485 aa  57.8  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0845  Resolvase domain protein  24.79 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000678199  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  20.62 
 
 		 537 aa  57.4  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  25.1 
 
 		 532 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>