More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_0419 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  64.34 
 
 
518 aa  700    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  100 
 
 
523 aa  1076    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  70.83 
 
 
522 aa  773    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  71.07 
 
 
523 aa  781    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  92.91 
 
 
523 aa  1006    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  71.84 
 
 
523 aa  786    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  70.11 
 
 
522 aa  762    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  53.23 
 
 
535 aa  548  1e-154  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  52.01 
 
 
506 aa  496  1e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  46.84 
 
 
552 aa  488  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  52.19 
 
 
431 aa  422  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  44.76 
 
 
539 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  50.25 
 
 
442 aa  393  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  51.58 
 
 
430 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  46.18 
 
 
429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  37.59 
 
 
526 aa  330  4e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  37.94 
 
 
606 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  37.94 
 
 
606 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  38.96 
 
 
543 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  36.56 
 
 
519 aa  309  8e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  36.4 
 
 
520 aa  306  6e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  35.34 
 
 
522 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  35.33 
 
 
519 aa  303  5.000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  41.83 
 
 
522 aa  296  8e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  36.24 
 
 
521 aa  288  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  35.16 
 
 
526 aa  279  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  36.19 
 
 
553 aa  258  1e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  36.28 
 
 
534 aa  246  8e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0420  resolvase domain-containing protein  46.04 
 
 
342 aa  227  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000164103  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2215  DNA recombinase, putative  58.92 
 
 
192 aa  225  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  32.33 
 
 
547 aa  212  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  35.08 
 
 
511 aa  188  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0494  resolvase, N-terminal domain protein  32.11 
 
 
321 aa  167  5.9999999999999996e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.177718 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  30.3 
 
 
542 aa  134  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  27.99 
 
 
498 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  30.3 
 
 
542 aa  134  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  30.3 
 
 
542 aa  134  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  30.61 
 
 
506 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  28.66 
 
 
521 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2698  hypothetical protein  42.41 
 
 
194 aa  128  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  27.66 
 
 
462 aa  127  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  30.82 
 
 
535 aa  127  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  26.85 
 
 
475 aa  125  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  26.67 
 
 
496 aa  124  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  27.68 
 
 
479 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  25.66 
 
 
665 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  24.64 
 
 
475 aa  117  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  26.78 
 
 
548 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  25.07 
 
 
613 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  24.23 
 
 
447 aa  113  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  28.65 
 
 
522 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  28.3 
 
 
542 aa  111  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  27.66 
 
 
554 aa  111  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  31.18 
 
 
539 aa  111  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  28.02 
 
 
415 aa  110  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  23.91 
 
 
546 aa  108  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  24.95 
 
 
546 aa  107  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  25.69 
 
 
524 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  25.91 
 
 
494 aa  107  7e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  24.21 
 
 
515 aa  106  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  26.03 
 
 
462 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  24.6 
 
 
537 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  26.02 
 
 
517 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  24.66 
 
 
509 aa  105  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  27.76 
 
 
487 aa  104  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  29.87 
 
 
459 aa  103  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  32.17 
 
 
295 aa  103  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  25.62 
 
 
462 aa  103  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  24.56 
 
 
500 aa  101  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  28.62 
 
 
343 aa  101  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  24.56 
 
 
445 aa  100  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  24.78 
 
 
421 aa  100  7e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  24.1 
 
 
500 aa  100  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  25.5 
 
 
527 aa  100  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  23.79 
 
 
586 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  27.78 
 
 
281 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  23.92 
 
 
528 aa  97.8  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  24.56 
 
 
445 aa  97.4  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2176  site-specific recombinase, putative  25.05 
 
 
612 aa  97.1  7e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0737  hypothetical protein  70.97 
 
 
64 aa  97.1  7e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00205716 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  25.06 
 
 
511 aa  97.1  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  24.02 
 
 
528 aa  96.7  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  26.07 
 
 
441 aa  96.7  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  27.16 
 
 
488 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  25.13 
 
 
534 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  25.13 
 
 
537 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  25.38 
 
 
534 aa  95.9  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  24.06 
 
 
445 aa  95.9  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  23.75 
 
 
510 aa  94.7  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  25.13 
 
 
534 aa  94.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  24.81 
 
 
534 aa  94  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  25.06 
 
 
547 aa  94  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  24.87 
 
 
534 aa  94  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  25.13 
 
 
537 aa  93.6  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  25.32 
 
 
558 aa  93.6  9e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  24.8 
 
 
525 aa  93.6  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  24.87 
 
 
534 aa  93.2  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  24.48 
 
 
563 aa  92.4  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  24.51 
 
 
558 aa  92  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  24.23 
 
 
485 aa  91.7  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>