More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0628 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  97.38 
 
 		 534 aa  1014    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  97 
 
 		 534 aa  1012    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  100 
 
 		 534 aa  1080    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  95.86 
 
 		 534 aa  1006    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  95.86 
 
 		 537 aa  979    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  97.19 
 
 		 534 aa  1024    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  97.19 
 
 		 534 aa  1017    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  96.8 
 
 		 537 aa  1006    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  45.09 
 
 		 525 aa  397  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0881  resolvase family site-specific recombinase  94.52 
 
 		 219 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00811311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  41.83 
 
 		 525 aa  358  9.999999999999999e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  42.23 
 
 		 525 aa  352  7e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  39.42 
 
 		 511 aa  340  5e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  47.47 
 
 		 441 aa  330  3e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  42.34 
 
 		 445 aa  323  4e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  42.09 
 
 		 445 aa  322  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  46.05 
 
 		 445 aa  319  7e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  37.99 
 
 		 528 aa  314  2.9999999999999996e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  37.8 
 
 		 528 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  38.16 
 
 		 527 aa  313  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  42.78 
 
 		 447 aa  312  7.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  45.04 
 
 		 506 aa  299  1e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  45.41 
 
 		 441 aa  293  6e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  44.23 
 
 		 568 aa  290  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  45.71 
 
 		 445 aa  290  6e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  41.82 
 
 		 460 aa  289  9e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  42.93 
 
 		 443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0764  hypothetical protein  87.5 
 
 		 220 aa  280  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0620  hypothetical protein  87.5 
 
 		 220 aa  280  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.761062 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  42.33 
 
 		 549 aa  277  3e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  44.63 
 
 		 522 aa  276  7e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  40.16 
 
 		 441 aa  275  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  46.23 
 
 		 532 aa  273  7e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  40.27 
 
 		 441 aa  273  8.000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  42.66 
 
 		 462 aa  272  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  40.23 
 
 		 449 aa  272  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  39.79 
 
 		 550 aa  271  2e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  37.87 
 
 		 545 aa  271  2.9999999999999997e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  41.83 
 
 		 462 aa  270  7e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  41.6 
 
 		 459 aa  261  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  40.05 
 
 		 474 aa  252  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  38.1 
 
 		 489 aa  248  2e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  41.06 
 
 		 343 aa  246  6e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  38.62 
 
 		 500 aa  243  7e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  42.91 
 
 		 299 aa  207  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  38.63 
 
 		 412 aa  205  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  28.57 
 
 		 544 aa  183  7e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  26.43 
 
 		 521 aa  176  8e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  25.58 
 
 		 515 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  32.61 
 
 		 546 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  30.06 
 
 		 665 aa  164  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  27.25 
 
 		 534 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  25.38 
 
 		 546 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  33.06 
 
 		 613 aa  161  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  32.05 
 
 		 509 aa  159  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  25.95 
 
 		 522 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  31.2 
 
 		 475 aa  157  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0913  resolvase domain-containing protein  26.67 
 
 		 554 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.955385  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  33.12 
 
 		 462 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1125  recombinase  37.19 
 
 		 322 aa  154  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0324535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  27.58 
 
 		 552 aa  154  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  26.19 
 
 		 542 aa  153  7e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  26.19 
 
 		 542 aa  153  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  26.19 
 
 		 542 aa  153  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  32.6 
 
 		 515 aa  150  8e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  36.99 
 
 		 500 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  32.6 
 
 		 484 aa  136  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  32.6 
 
 		 484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  26.59 
 
 		 561 aa  134  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  28.08 
 
 		 474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  31.06 
 
 		 485 aa  131  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  23.12 
 
 		 558 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  27.49 
 
 		 415 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1608  putative resolvase  35.93 
 
 		 502 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  29.7 
 
 		 421 aa  122  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  28.46 
 
 		 547 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  28.79 
 
 		 272 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  26.03 
 
 		 539 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  26.74 
 
 		 565 aa  114  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  27.53 
 
 		 504 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  27.08 
 
 		 590 aa  111  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  25.9 
 
 		 558 aa  111  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  27.07 
 
 		 553 aa  110  6e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  27.49 
 
 		 540 aa  110  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  27.74 
 
 		 546 aa  110  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  27.47 
 
 		 485 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  28.85 
 
 		 532 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  26.44 
 
 		 579 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  27.11 
 
 		 606 aa  108  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  27.11 
 
 		 606 aa  108  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  24.05 
 
 		 561 aa  107  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  26.16 
 
 		 535 aa  107  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  28.07 
 
 		 479 aa  107  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  28.07 
 
 		 479 aa  107  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  26.52 
 
 		 506 aa  107  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  27.52 
 
 		 555 aa  106  8e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  31.78 
 
 		 460 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  27.52 
 
 		 550 aa  106  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2577  Resolvase domain protein  25.98 
 
 		 603 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.551292 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  28.31 
 
 		 551 aa  106  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>