More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1282 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  100 
 
 		 558 aa  1155    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  68.88 
 
 		 550 aa  778    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  69.95 
 
 		 555 aa  807    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  28.71 
 
 		 462 aa  139  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  25.88 
 
 		 542 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  25.88 
 
 		 542 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  25.88 
 
 		 542 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  24.19 
 
 		 546 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  29.63 
 
 		 506 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  30.12 
 
 		 544 aa  127  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  30.59 
 
 		 500 aa  126  8.000000000000001e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  27.64 
 
 		 528 aa  126  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  27.64 
 
 		 528 aa  126  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  26.32 
 
 		 515 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  28.14 
 
 		 489 aa  121  3e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  28.98 
 
 		 441 aa  121  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  26.87 
 
 		 546 aa  121  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  26.09 
 
 		 521 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  29.48 
 
 		 494 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  28.66 
 
 		 441 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  28.05 
 
 		 558 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  25.33 
 
 		 537 aa  118  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  25.3 
 
 		 525 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  27.82 
 
 		 447 aa  117  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  25.17 
 
 		 474 aa  117  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  27.62 
 
 		 534 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  24.46 
 
 		 475 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  27.3 
 
 		 534 aa  114  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  27.25 
 
 		 665 aa  114  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  29.45 
 
 		 485 aa  113  9e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  26.54 
 
 		 460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  28.25 
 
 		 445 aa  113  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  26.61 
 
 		 537 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  27.01 
 
 		 561 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  27.68 
 
 		 445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  26.33 
 
 		 525 aa  111  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  25.9 
 
 		 534 aa  112  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  27.02 
 
 		 534 aa  111  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  27.02 
 
 		 534 aa  111  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  27.4 
 
 		 445 aa  111  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  26.74 
 
 		 534 aa  110  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  26.51 
 
 		 613 aa  110  9.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  25.59 
 
 		 484 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  25.91 
 
 		 415 aa  109  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  25.41 
 
 		 484 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  25.2 
 
 		 479 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  25.2 
 
 		 479 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  26.52 
 
 		 537 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  29.1 
 
 		 272 aa  107  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  26.82 
 
 		 459 aa  106  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  24.52 
 
 		 449 aa  105  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  23.81 
 
 		 522 aa  104  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  26.79 
 
 		 421 aa  104  5e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  24.06 
 
 		 518 aa  103  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  25.64 
 
 		 547 aa  103  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0231  resolvase domain-containing protein  25.11 
 
 		 519 aa  103  8e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.829739  normal  0.106092 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  26.12 
 
 		 527 aa  103  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0164  hypothetical protein  55.17 
 
 		 111 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.292869  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  26.27 
 
 		 561 aa  102  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  27.16 
 
 		 549 aa  102  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  23.26 
 
 		 509 aa  101  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  24.35 
 
 		 540 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  25.06 
 
 		 485 aa  100  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  26.73 
 
 		 550 aa  100  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  27.21 
 
 		 555 aa  100  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0051  site-specific recombinase  25 
 
 		 513 aa  99.8  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169299  hitchhiker  0.000782563 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  26.55 
 
 		 482 aa  99  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  23.85 
 
 		 606 aa  98.2  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  23.85 
 
 		 606 aa  98.2  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  26.96 
 
 		 441 aa  97.8  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  28.01 
 
 		 515 aa  97.4  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  25.98 
 
 		 548 aa  97.4  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  24.17 
 
 		 460 aa  97.4  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  28.53 
 
 		 545 aa  97.1  7e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  26.29 
 
 		 579 aa  97.1  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  21.8 
 
 		 511 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  21.76 
 
 		 534 aa  96.3  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  26.04 
 
 		 590 aa  95.9  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  27.01 
 
 		 531 aa  95.9  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  26.5 
 
 		 443 aa  94.7  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  24.89 
 
 		 551 aa  94.4  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  27.63 
 
 		 506 aa  94.4  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3523  resolvase domain protein  25 
 
 		 568 aa  93.6  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.876485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  25.13 
 
 		 532 aa  93.6  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1430  Resolvase domain protein  24.77 
 
 		 607 aa  93.2  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  26.54 
 
 		 743 aa  92.4  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  24.89 
 
 		 565 aa  92  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  27.17 
 
 		 441 aa  92.4  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  23.94 
 
 		 517 aa  92  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  24.64 
 
 		 522 aa  91.7  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2572  resolvase domain protein  24.39 
 
 		 539 aa  91.3  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  26.02 
 
 		 343 aa  90.5  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4205  resolvase domain protein  25.3 
 
 		 525 aa  90.5  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2057  Resolvase domain protein  27.09 
 
 		 582 aa  89.7  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0536001  normal  0.0182288 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  23.44 
 
 		 526 aa  90.1  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0845  Resolvase domain protein  27.2 
 
 		 252 aa  89.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000678199  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3109  resolvase  28 
 
 		 377 aa  89.4  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  26.64 
 
 		 568 aa  89  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  23.29 
 
 		 534 aa  88.2  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3904  Resolvase domain protein  22.01 
 
 		 460 aa  87.8  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>