More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1297 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 555 aa  1147    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  69.95 
 
 		 558 aa  827    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  99.81 
 
 		 550 aa  1107    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  31.28 
 
 		 506 aa  148  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  26.02 
 
 		 546 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  28.04 
 
 		 558 aa  144  5e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  31.46 
 
 		 544 aa  136  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  29.16 
 
 		 528 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  29.16 
 
 		 528 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  27.75 
 
 		 441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  26.14 
 
 		 542 aa  129  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  26.14 
 
 		 542 aa  129  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  26.14 
 
 		 542 aa  129  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  28.47 
 
 		 561 aa  128  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  27.75 
 
 		 441 aa  128  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  30.12 
 
 		 555 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  28.18 
 
 		 518 aa  127  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  28.26 
 
 		 547 aa  127  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0164  hypothetical protein  67.05 
 
 		 111 aa  126  9e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.292869  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  25.8 
 
 		 462 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  26.22 
 
 		 415 aa  125  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  27.05 
 
 		 500 aa  123  8e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  23.83 
 
 		 522 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  25.82 
 
 		 525 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  28.12 
 
 		 527 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  27.52 
 
 		 489 aa  118  1.9999999999999998e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  27.49 
 
 		 546 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  27.72 
 
 		 445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  27.09 
 
 		 517 aa  116  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  28.96 
 
 		 485 aa  115  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  27.68 
 
 		 447 aa  114  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  27.32 
 
 		 521 aa  114  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  28.27 
 
 		 445 aa  114  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  27.94 
 
 		 515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  25.75 
 
 		 743 aa  111  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  27.45 
 
 		 540 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  23.9 
 
 		 525 aa  110  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  26.49 
 
 		 494 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  24.17 
 
 		 479 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3109  resolvase  31.91 
 
 		 377 aa  109  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  24.62 
 
 		 496 aa  109  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  24.17 
 
 		 479 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  27.79 
 
 		 534 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  27.52 
 
 		 537 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  28.4 
 
 		 551 aa  107  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  24.27 
 
 		 475 aa  107  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  27.32 
 
 		 534 aa  107  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  27.52 
 
 		 534 aa  106  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  27.79 
 
 		 482 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  27.54 
 
 		 590 aa  106  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  26.43 
 
 		 485 aa  106  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  22.26 
 
 		 511 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  27.7 
 
 		 534 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  27.52 
 
 		 534 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2057  Resolvase domain protein  29.21 
 
 		 582 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0536001  normal  0.0182288 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  26.61 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  26.59 
 
 		 548 aa  105  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  27.25 
 
 		 534 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  24 
 
 		 606 aa  103  5e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  24 
 
 		 606 aa  103  5e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  26.03 
 
 		 459 aa  103  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  24.81 
 
 		 484 aa  103  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  27.02 
 
 		 537 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  25 
 
 		 484 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  25.76 
 
 		 561 aa  102  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  24.03 
 
 		 474 aa  100  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  24.13 
 
 		 537 aa  100  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  26.16 
 
 		 510 aa  100  8e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  27.68 
 
 		 441 aa  99.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  26.55 
 
 		 613 aa  99.8  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0845  Resolvase domain protein  29.34 
 
 		 252 aa  99  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000678199  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  24.64 
 
 		 460 aa  99  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  27.56 
 
 		 525 aa  97.8  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  23.88 
 
 		 534 aa  97.8  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  25.34 
 
 		 460 aa  97.4  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  27.32 
 
 		 532 aa  97.8  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  24.12 
 
 		 554 aa  97.4  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0051  site-specific recombinase  26.47 
 
 		 513 aa  97.4  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169299  hitchhiker  0.000782563 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  27.33 
 
 		 515 aa  97.1  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  23.67 
 
 		 449 aa  97.1  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  23.86 
 
 		 542 aa  96.7  9e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3523  resolvase domain protein  24.44 
 
 		 568 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.876485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  26.73 
 
 		 272 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  24.89 
 
 		 479 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2572  resolvase domain protein  24.92 
 
 		 539 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1430  Resolvase domain protein  27.68 
 
 		 607 aa  95.1  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  25.6 
 
 		 665 aa  95.1  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  26.73 
 
 		 550 aa  94.4  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  26.48 
 
 		 579 aa  94.4  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4205  resolvase domain protein  24.62 
 
 		 525 aa  94  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  25.34 
 
 		 421 aa  94  6e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  27.21 
 
 		 546 aa  92  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  26.94 
 
 		 343 aa  92  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  25.07 
 
 		 526 aa  92  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  27.09 
 
 		 462 aa  91.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  27.37 
 
 		 462 aa  91.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0231  resolvase domain-containing protein  25.34 
 
 		 519 aa  91.7  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.829739  normal  0.106092 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  23.4 
 
 		 534 aa  91.7  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  25.07 
 
 		 563 aa  91.7  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3816  recombinase  28.32 
 
 		 469 aa  91.7  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>