161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1430 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1430  Resolvase domain protein  100 
 
 		 607 aa  1247    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2057  Resolvase domain protein  45.58 
 
 		 582 aa  481  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0536001  normal  0.0182288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  38.21 
 
 		 743 aa  370  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1250  resolvase  29.23 
 
 		 524 aa  145  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3963  recombinase  27.25 
 
 		 493 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  28.04 
 
 		 565 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  28.68 
 
 		 540 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  26.1 
 
 		 561 aa  111  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  28.6 
 
 		 590 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  29.54 
 
 		 531 aa  109  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  27.54 
 
 		 551 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  27.1 
 
 		 547 aa  107  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  25.83 
 
 		 537 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  27.59 
 
 		 518 aa  104  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  25.99 
 
 		 449 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  26.18 
 
 		 561 aa  102  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  27.03 
 
 		 579 aa  102  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3109  resolvase  30.57 
 
 		 377 aa  99.4  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  25.57 
 
 		 555 aa  99  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  25.16 
 
 		 525 aa  95.9  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  27.68 
 
 		 550 aa  95.9  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  23.93 
 
 		 441 aa  95.5  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  27.68 
 
 		 555 aa  95.1  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  24.15 
 
 		 441 aa  94  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  25.18 
 
 		 613 aa  93.6  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  23.04 
 
 		 548 aa  94  8e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  25.77 
 
 		 510 aa  92.8  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  24.77 
 
 		 558 aa  92.8  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  28.33 
 
 		 509 aa  90.9  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0248  resolvase domain-containing protein  23.72 
 
 		 524 aa  90.5  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000541084  hitchhiker  0.00459613 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0231  resolvase domain-containing protein  23.93 
 
 		 519 aa  89.7  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.829739  normal  0.106092 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  21.81 
 
 		 542 aa  89.4  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  21.81 
 
 		 554 aa  89.7  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  24.74 
 
 		 459 aa  87.8  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  23.4 
 
 		 563 aa  87.8  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  25.06 
 
 		 445 aa  85.5  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  29.28 
 
 		 485 aa  85.1  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  27.43 
 
 		 545 aa  82.4  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  27.91 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  24.54 
 
 		 445 aa  82  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3805  resolvase-like protein  22.88 
 
 		 526 aa  80.9  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296715  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  26.6 
 
 		 460 aa  80.5  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  22.55 
 
 		 517 aa  79  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  25.42 
 
 		 462 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  25.12 
 
 		 445 aa  77.8  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  24.16 
 
 		 447 aa  77.4  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  25.55 
 
 		 527 aa  76.6  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  21.23 
 
 		 521 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  26.2 
 
 		 544 aa  75.1  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5133  Resolvase domain  22.79 
 
 		 539 aa  74.3  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.880179 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0737  resolvase  23.03 
 
 		 542 aa  73.6  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0547783  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  24.95 
 
 		 462 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  27.56 
 
 		 522 aa  72  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  25.95 
 
 		 534 aa  72  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  23.86 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  24.88 
 
 		 534 aa  71.6  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  25.95 
 
 		 534 aa  70.9  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  24.79 
 
 		 532 aa  70.9  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  25.87 
 
 		 534 aa  70.5  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  25.87 
 
 		 534 aa  70.5  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  25.68 
 
 		 534 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  24.58 
 
 		 665 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7140  recombinase  41.25 
 
 		 108 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190883  normal  0.28367 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  24.46 
 
 		 525 aa  70.1  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  25.13 
 
 		 474 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3523  resolvase domain protein  28.26 
 
 		 568 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.876485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  23.36 
 
 		 511 aa  69.7  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2572  resolvase domain protein  25.61 
 
 		 539 aa  68.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4205  resolvase domain protein  27.62 
 
 		 525 aa  67  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  20.93 
 
 		 542 aa  66.6  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  24.73 
 
 		 537 aa  66.6  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  24.61 
 
 		 504 aa  67  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  21.5 
 
 		 542 aa  67  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  24.65 
 
 		 494 aa  66.6  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  21.5 
 
 		 542 aa  67  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  22.98 
 
 		 462 aa  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  25.29 
 
 		 537 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  25.47 
 
 		 546 aa  65.1  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  26.21 
 
 		 549 aa  65.5  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  22.01 
 
 		 479 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  24.47 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  24.73 
 
 		 506 aa  64.3  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  23.94 
 
 		 586 aa  63.9  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  22.05 
 
 		 496 aa  63.9  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  23.58 
 
 		 506 aa  63.9  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  25.31 
 
 		 445 aa  63.5  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  21.12 
 
 		 546 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  24.35 
 
 		 525 aa  63.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  22.57 
 
 		 539 aa  63.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  23.3 
 
 		 550 aa  63.2  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3000  resolvase domain protein  21.43 
 
 		 549 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1125  recombinase  25.93 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0324535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2975  resolvase domain-containing protein  21.54 
 
 		 516 aa  61.6  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.539501  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  23.23 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  23.06 
 
 		 564 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  25.26 
 
 		 546 aa  60.1  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  21.77 
 
 		 523 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  21.25 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  22.16 
 
 		 523 aa  58.9  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  23.65 
 
 		 526 aa  58.5  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>