269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1250 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1250  resolvase  100 
 
 
524 aa  1085    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3963  recombinase  39.75 
 
 
493 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0231  resolvase domain-containing protein  25.25 
 
 
519 aa  182  1e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.829739  normal  0.106092 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  29.19 
 
 
531 aa  166  9e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  27.59 
 
 
743 aa  156  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1430  Resolvase domain protein  29.15 
 
 
607 aa  145  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  27.51 
 
 
510 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2057  Resolvase domain protein  25.64 
 
 
582 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0536001  normal  0.0182288 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  24.64 
 
 
515 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  24.6 
 
 
522 aa  127  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  27.79 
 
 
554 aa  126  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  27.79 
 
 
542 aa  125  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  24.52 
 
 
546 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  27.42 
 
 
415 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  27.05 
 
 
517 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0737  resolvase  27.78 
 
 
542 aa  120  9e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0547783  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0051  site-specific recombinase  24.64 
 
 
513 aa  119  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169299  hitchhiker  0.000782563 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5133  Resolvase domain  25.36 
 
 
539 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.880179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3805  resolvase-like protein  23.83 
 
 
526 aa  110  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296715  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  27.2 
 
 
542 aa  110  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3000  resolvase domain protein  24.22 
 
 
549 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  26.82 
 
 
542 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  26.82 
 
 
542 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  26.4 
 
 
563 aa  107  8e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  26.3 
 
 
521 aa  104  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  25.98 
 
 
494 aa  103  7e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  30.24 
 
 
548 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  27.4 
 
 
506 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0248  resolvase domain-containing protein  23.04 
 
 
524 aa  100  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000541084  hitchhiker  0.00459613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2975  resolvase domain-containing protein  24.09 
 
 
516 aa  99.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.539501  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  25.71 
 
 
509 aa  99  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  27.35 
 
 
482 aa  97.8  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  25.16 
 
 
462 aa  97.4  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  27.7 
 
 
445 aa  95.9  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  25.72 
 
 
546 aa  95.5  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  24.63 
 
 
613 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  27.22 
 
 
445 aa  94  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  26.13 
 
 
485 aa  92  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  25.62 
 
 
519 aa  89.7  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  25.32 
 
 
665 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  25.78 
 
 
504 aa  89  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  24.44 
 
 
519 aa  87.4  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  24 
 
 
540 aa  85.5  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  24.5 
 
 
579 aa  84.7  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  27.02 
 
 
555 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  25.45 
 
 
485 aa  84  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  24.82 
 
 
496 aa  84  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  25.82 
 
 
445 aa  82.8  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  22.58 
 
 
475 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  26.61 
 
 
546 aa  82  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  26.2 
 
 
544 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  21.74 
 
 
535 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  24.87 
 
 
521 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5207  Resolvase domain protein  25.81 
 
 
598 aa  81.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  25.77 
 
 
525 aa  81.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  26.18 
 
 
550 aa  80.9  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  26.18 
 
 
555 aa  80.9  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3285  Recombinase  24.02 
 
 
554 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2572  resolvase domain protein  23.58 
 
 
539 aa  80.5  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4166  recombinase  25.39 
 
 
460 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167071  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  24.33 
 
 
590 aa  80.1  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  23.65 
 
 
447 aa  79.7  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3523  resolvase domain protein  22.1 
 
 
568 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.876485  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  22.49 
 
 
537 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  24.36 
 
 
551 aa  79  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  26.78 
 
 
540 aa  77.8  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  24.3 
 
 
539 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  27.07 
 
 
459 aa  77.4  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  26.03 
 
 
546 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  24.43 
 
 
541 aa  77.4  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  23.77 
 
 
558 aa  77  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  21.88 
 
 
537 aa  77.4  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  23.37 
 
 
522 aa  76.3  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  27.48 
 
 
343 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  23.28 
 
 
541 aa  75.5  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  26.79 
 
 
515 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  23.72 
 
 
475 aa  75.9  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  22.8 
 
 
522 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4205  resolvase domain protein  22.97 
 
 
525 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  26.01 
 
 
525 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  23.62 
 
 
586 aa  74.7  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0097  resolvase domain-containing protein  33.14 
 
 
211 aa  74.7  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.371309  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  24.08 
 
 
441 aa  74.7  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  23.27 
 
 
552 aa  74.7  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3150  Resolvase domain protein  24.15 
 
 
532 aa  73.9  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.617817  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  24.86 
 
 
484 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  25.17 
 
 
542 aa  73.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  24.38 
 
 
534 aa  73.6  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  22.14 
 
 
561 aa  73.2  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  24.86 
 
 
484 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  23.36 
 
 
524 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  27.23 
 
 
421 aa  72.4  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  22.97 
 
 
526 aa  72.8  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  27.31 
 
 
527 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  24.07 
 
 
565 aa  72  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  23.16 
 
 
526 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  23.3 
 
 
441 aa  71.6  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  24.11 
 
 
534 aa  71.6  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  23.64 
 
 
547 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  26.4 
 
 
540 aa  70.5  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>