88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5133 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5133  Resolvase domain  100 
 
 		 539 aa  1115    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.880179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3805  resolvase-like protein  47.5 
 
 		 526 aa  491  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296715  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0737  resolvase  47.9 
 
 		 542 aa  474  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0547783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0248  resolvase domain-containing protein  42.89 
 
 		 524 aa  404  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000541084  hitchhiker  0.00459613 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1250  resolvase  25.36 
 
 		 524 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0051  site-specific recombinase  24.52 
 
 		 513 aa  104  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169299  hitchhiker  0.000782563 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3000  resolvase domain protein  22.67 
 
 		 549 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  23.82 
 
 		 415 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  23.89 
 
 		 743 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3963  recombinase  25.25 
 
 		 493 aa  81.3  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2975  resolvase domain-containing protein  22.38 
 
 		 516 aa  80.1  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.539501  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3523  resolvase domain protein  21.55 
 
 		 568 aa  78.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.876485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2572  resolvase domain protein  25.47 
 
 		 539 aa  77.8  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  23.28 
 
 		 522 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4205  resolvase domain protein  21.17 
 
 		 525 aa  74.3  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  24.86 
 
 		 561 aa  70.5  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1430  Resolvase domain protein  23.41 
 
 		 607 aa  69.7  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  25.38 
 
 		 504 aa  69.3  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1448  recombinase  28.44 
 
 		 467 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  24.4 
 
 		 540 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  25.67 
 
 		 517 aa  65.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  24.84 
 
 		 547 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  23.4 
 
 		 489 aa  65.1  0.000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  23.31 
 
 		 542 aa  63.9  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  23.31 
 
 		 542 aa  63.9  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  23.31 
 
 		 542 aa  63.5  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  23.08 
 
 		 531 aa  61.6  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3816  recombinase  27 
 
 		 469 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3890  recombinase  27 
 
 		 469 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4299  recombinase  27 
 
 		 469 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347806  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  25.24 
 
 		 485 aa  60.5  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  24.94 
 
 		 509 aa  60.1  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  25.79 
 
 		 525 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  22.09 
 
 		 500 aa  58.9  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  26.19 
 
 		 525 aa  58.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  26.24 
 
 		 546 aa  57.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  21.55 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  24.32 
 
 		 546 aa  57  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  22.64 
 
 		 537 aa  56.2  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  21.6 
 
 		 515 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2057  Resolvase domain protein  23.92 
 
 		 582 aa  55.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0536001  normal  0.0182288 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  23.4 
 
 		 445 aa  55.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1974  Resolvase domain protein  28.96 
 
 		 503 aa  54.3  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665076  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  23.87 
 
 		 445 aa  54.3  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  23.48 
 
 		 445 aa  53.9  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  23.59 
 
 		 555 aa  53.9  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  20.09 
 
 		 462 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  23.67 
 
 		 563 aa  52.8  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  35.87 
 
 		 214 aa  52.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  23.84 
 
 		 527 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  20.9 
 
 		 534 aa  52  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  26.23 
 
 		 465 aa  52  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  22.3 
 
 		 447 aa  50.4  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  31.73 
 
 		 283 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  24 
 
 		 498 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  21.07 
 
 		 474 aa  49.7  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  21.06 
 
 		 485 aa  48.9  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6320  resolvase domain protein  21.59 
 
 		 553 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  27.89 
 
 		 213 aa  48.5  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  23.01 
 
 		 511 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  22.78 
 
 		 579 aa  48.5  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  27.89 
 
 		 213 aa  48.5  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2896  resolvase-like protein  26.95 
 
 		 206 aa  48.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 565 aa  48.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  26.53 
 
 		 222 aa  47.4  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  21.89 
 
 		 590 aa  47  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  22.85 
 
 		 551 aa  47  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  19.81 
 
 		 482 aa  47  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  20.92 
 
 		 475 aa  46.6  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  29.01 
 
 		 215 aa  47  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2949  site-specific recombinase  31.07 
 
 		 479 aa  46.6  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000000764647  unclonable  0.00000628307 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  21.13 
 
 		 545 aa  46.6  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  28 
 
 		 513 aa  45.8  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  25.85 
 
 		 209 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  25.15 
 
 		 484 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  28.3 
 
 		 515 aa  45.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  36.36 
 
 		 208 aa  45.4  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  25.15 
 
 		 484 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03270  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  25.26 
 
 		 426 aa  45.4  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  26.92 
 
 		 380 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  36.78 
 
 		 569 aa  45.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  23.72 
 
 		 525 aa  44.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  25.85 
 
 		 222 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7609  resolvase domain-containing protein  26.73 
 
 		 690 aa  44.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.918322 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  25.85 
 
 		 222 aa  44.3  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  36.36 
 
 		 208 aa  44.3  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0976  resolvase-like protein  36.62 
 
 		 72 aa  43.9  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.735809 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3150  Resolvase domain protein  19.13 
 
 		 532 aa  43.9  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.617817  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>