71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6320 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6320  resolvase domain protein  100 
 
 		 553 aa  1141    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3000  resolvase domain protein  34.1 
 
 		 549 aa  247  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2949  site-specific recombinase  27.31 
 
 		 479 aa  127  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000000764647  unclonable  0.00000628307 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0051  site-specific recombinase  27.32 
 
 		 513 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169299  hitchhiker  0.000782563 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3523  resolvase domain protein  25 
 
 		 568 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.876485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2572  resolvase domain protein  24.81 
 
 		 539 aa  100  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2975  resolvase domain-containing protein  23.88 
 
 		 516 aa  99  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.539501  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4205  resolvase domain protein  24.45 
 
 		 525 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3963  recombinase  27.14 
 
 		 493 aa  95.1  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0231  resolvase domain-containing protein  22.67 
 
 		 519 aa  77  0.0000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.829739  normal  0.106092 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  24.57 
 
 		 563 aa  77  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  26.36 
 
 		 521 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  25.95 
 
 		 558 aa  74.7  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  26.63 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  26.57 
 
 		 517 aa  68.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1250  resolvase  21.46 
 
 		 524 aa  67  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  24.31 
 
 		 542 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  24.31 
 
 		 542 aa  66.2  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  24.31 
 
 		 542 aa  66.2  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  25.43 
 
 		 542 aa  63.9  0.000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  22.07 
 
 		 524 aa  63.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  25.43 
 
 		 554 aa  63.2  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  22.41 
 
 		 510 aa  62.4  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  26.35 
 
 		 548 aa  61.6  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  23.08 
 
 		 522 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1691  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 491 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0333311  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  28.11 
 
 		 531 aa  60.5  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  21.53 
 
 		 743 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  23.45 
 
 		 537 aa  58.9  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1430  Resolvase domain protein  23.74 
 
 		 607 aa  58.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3805  resolvase-like protein  21.17 
 
 		 526 aa  58.9  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296715  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2498  cassette chromosome recombinase A  23.27 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 415 aa  57  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  23.64 
 
 		 540 aa  56.2  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2057  Resolvase domain protein  22.33 
 
 		 582 aa  56.2  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0536001  normal  0.0182288 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0050  resolvase domain-containing protein  21.92 
 
 		 449 aa  55.5  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  23.88 
 
 		 561 aa  55.5  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0049  resolvase domain-containing protein  21.92 
 
 		 449 aa  55.5  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  22.99 
 
 		 504 aa  55.1  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  23.2 
 
 		 547 aa  55.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  23.55 
 
 		 546 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  25.58 
 
 		 544 aa  54.7  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  22.49 
 
 		 555 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0737  resolvase  20.37 
 
 		 542 aa  53.5  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0547783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5133  Resolvase domain  21.79 
 
 		 539 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.880179 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  26.27 
 
 		 494 aa  52  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4299  recombinase  21.74 
 
 		 469 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347806  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3890  recombinase  21.74 
 
 		 469 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4166  recombinase  23.82 
 
 		 460 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167071  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3816  recombinase  21.74 
 
 		 469 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  24.9 
 
 		 421 aa  51.2  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  23.76 
 
 		 540 aa  51.2  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  25.37 
 
 		 441 aa  50.8  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  22.91 
 
 		 475 aa  50.4  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  21.62 
 
 		 546 aa  49.3  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  23.98 
 
 		 534 aa  49.3  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20360  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  33.8 
 
 		 539 aa  48.5  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872003  normal  0.144817 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  25.87 
 
 		 515 aa  48.5  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  22.65 
 
 		 485 aa  48.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0615  Resolvase domain protein  20.85 
 
 		 461 aa  47.8  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  24.78 
 
 		 441 aa  47  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  22.83 
 
 		 523 aa  47  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  23.84 
 
 		 447 aa  46.2  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  23.96 
 
 		 474 aa  45.8  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3109  resolvase  30.84 
 
 		 377 aa  46.2  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  26 
 
 		 485 aa  45.1  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  23.21 
 
 		 523 aa  45.4  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  23.97 
 
 		 460 aa  45.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0097  resolvase domain-containing protein  30.51 
 
 		 211 aa  44.7  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.371309  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  23.3 
 
 		 484 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  24.1 
 
 		 513 aa  43.9  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>