More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3816 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_4299  recombinase  100 
 
 		 469 aa  949    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347806  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3890  recombinase  100 
 
 		 469 aa  949    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3816  recombinase  100 
 
 		 469 aa  949    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1448  recombinase  53.12 
 
 		 467 aa  495  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3904  Resolvase domain protein  36.13 
 
 		 460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1857  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  38.32 
 
 		 488 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830217  decreased coverage  0.0036727 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  38.92 
 
 		 460 aa  270  4e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3518  recombinase  39.04 
 
 		 460 aa  250  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0489876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3591  recombinase  39.04 
 
 		 460 aa  249  9e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4166  recombinase  37.32 
 
 		 460 aa  243  7e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167071  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  34.43 
 
 		 465 aa  230  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1234  Resolvase domain protein  34.85 
 
 		 467 aa  208  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2519  Resolvase domain protein  35.21 
 
 		 494 aa  206  7e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06210  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  34.66 
 
 		 458 aa  186  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0615  Resolvase domain protein  31.71 
 
 		 461 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  32.77 
 
 		 479 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  32.77 
 
 		 479 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20310  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  34.58 
 
 		 458 aa  184  4.0000000000000006e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0744834  normal  0.198251 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1974  Resolvase domain protein  31.07 
 
 		 503 aa  150  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665076  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3568  Resolvase domain protein  34.94 
 
 		 484 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2721  recombinase  33.09 
 
 		 500 aa  141  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.79843 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26050  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  27.53 
 
 		 511 aa  136  8e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20360  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29.08 
 
 		 539 aa  130  4.0000000000000003e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872003  normal  0.144817 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0393  recombinase  30.25 
 
 		 522 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20150  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  26.37 
 
 		 569 aa  126  7e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.339427  normal  0.32342 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2373  recombinase  29.4 
 
 		 497 aa  113  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2529  recombinase  27.05 
 
 		 501 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2051  resolvase domain-containing protein  27.45 
 
 		 494 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07990  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  28.27 
 
 		 529 aa  106  8e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  29.83 
 
 		 527 aa  103  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  28.39 
 
 		 462 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  28.42 
 
 		 525 aa  100  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  34.55 
 
 		 299 aa  100  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  30.68 
 
 		 534 aa  99.8  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  27.41 
 
 		 546 aa  99.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  30.43 
 
 		 537 aa  98.6  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  28.14 
 
 		 525 aa  98.6  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  30.06 
 
 		 447 aa  99  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  30.65 
 
 		 534 aa  97.4  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  30.43 
 
 		 534 aa  97.1  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  30.43 
 
 		 534 aa  97.1  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  30.43 
 
 		 534 aa  97.1  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2551  recombinase  26.75 
 
 		 412 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  31.44 
 
 		 534 aa  95.9  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  30.38 
 
 		 537 aa  94.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  28.53 
 
 		 489 aa  94.4  4e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  24.5 
 
 		 515 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6293  recombinase  27.7 
 
 		 385 aa  93.6  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  29.02 
 
 		 500 aa  93.6  7e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4207  Recombinase  25.76 
 
 		 506 aa  93.2  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0141412 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4124  recombinase  26.19 
 
 		 432 aa  93.6  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  28.04 
 
 		 613 aa  93.2  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  28.5 
 
 		 528 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  23.08 
 
 		 521 aa  92  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  28.32 
 
 		 555 aa  91.7  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  28.32 
 
 		 550 aa  91.7  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  27.98 
 
 		 528 aa  90.9  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  24.25 
 
 		 272 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  29.33 
 
 		 485 aa  89.7  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  28.03 
 
 		 343 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1907  Recombinase  30.66 
 
 		 452 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  28.84 
 
 		 462 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  26.07 
 
 		 475 aa  85.9  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  28.85 
 
 		 421 aa  85.9  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0508  Resolvase domain protein  28.12 
 
 		 520 aa  84.7  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  28.47 
 
 		 462 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  26.15 
 
 		 431 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  27.14 
 
 		 665 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  30.22 
 
 		 522 aa  82.4  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  27.33 
 
 		 568 aa  82  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2571  recombinase  25.19 
 
 		 417 aa  81.6  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  28.06 
 
 		 532 aa  81.3  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  28.77 
 
 		 545 aa  81.3  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  28.23 
 
 		 445 aa  81.3  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  22.47 
 
 		 546 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  29.03 
 
 		 484 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  29.03 
 
 		 484 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3240  Recombinase  24.31 
 
 		 582 aa  80.1  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.143535  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  27.14 
 
 		 537 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  22.01 
 
 		 534 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  27.33 
 
 		 445 aa  79.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  29.29 
 
 		 441 aa  79.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  23.68 
 
 		 522 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  23.55 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  27.18 
 
 		 540 aa  77.4  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  27.11 
 
 		 445 aa  77.8  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  24.02 
 
 		 485 aa  77.4  0.0000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  26.92 
 
 		 515 aa  77.4  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2997  resolvase domain-containing protein  23.84 
 
 		 444 aa  76.6  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  23.01 
 
 		 526 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  28.4 
 
 		 460 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  26.95 
 
 		 511 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0913  resolvase domain-containing protein  34.76 
 
 		 554 aa  76.6  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.955385  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  26.55 
 
 		 558 aa  75.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  21.9 
 
 		 519 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  27.81 
 
 		 509 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  24.7 
 
 		 517 aa  75.5  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  26.28 
 
 		 597 aa  75.5  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  30.39 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  24.69 
 
 		 459 aa  73.6  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>